More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2726 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2726  tRNA pseudouridine synthase A  100 
 
 		 259 aa  529  1e-149  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2273  tRNA pseudouridine synthase A  71.88 
 
 		 263 aa  367  1e-100  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000217948 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01500  pseudouridylate synthase I  44.09 
 
 		 246 aa  205  7e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  8.6087e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02450  pseudouridylate synthase I  44.09 
 
 		 246 aa  205  7e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000086341  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0900  tRNA pseudouridine synthase A  41.18 
 
 		 244 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106944  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1685  tRNA pseudouridine synthase A  40 
 
 		 244 aa  193  3e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0466  tRNA pseudouridine synthase A  42.58 
 
 		 252 aa  189  4e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000184743  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0143  tRNA pseudouridine synthase A  41.77 
 
 		 248 aa  186  4e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000160558  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0255  tRNA pseudouridine synthase A  40.47 
 
 		 247 aa  182  7e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000251416  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0139  tRNA pseudouridine synthase A  41.2 
 
 		 258 aa  178  8e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0793  tRNA pseudouridine synthase A  39.84 
 
 		 245 aa  177  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000229391  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2939  tRNA pseudouridine synthase A  37.25 
 
 		 244 aa  177  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0255  tRNA pseudouridine synthase A  42.4 
 
 		 250 aa  176  3e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00104612  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0173  tRNA pseudouridine synthase A  40.62 
 
 		 252 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000175513  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0142  tRNA pseudouridine synthase A  40.62 
 
 		 247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000629315  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0911  tRNA pseudouridine synthase A  42.19 
 
 		 250 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000123783  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2365  tRNA pseudouridine synthase A  37.3 
 
 		 244 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000187105  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0142  tRNA pseudouridine synthase A  40.23 
 
 		 247 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000419417  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0137  tRNA pseudouridine synthase A  40.23 
 
 		 247 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000139661  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0135  tRNA pseudouridine synthase A  40.23 
 
 		 247 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000154872  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0142  tRNA pseudouridine synthase A  40.23 
 
 		 247 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000771013  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0155  tRNA pseudouridine synthase A  40.23 
 
 		 252 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.18067e-36 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5163  tRNA pseudouridine synthase A  40.23 
 
 		 252 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176686  hitchhiker  0.0000000000431811 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0605  tRNA pseudouridine synthase A  42.35 
 
 		 256 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000709788  hitchhiker  0.00819756 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2680  tRNA pseudouridine synthase A  37.7 
 
 		 244 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000443367  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0137  tRNA pseudouridine synthase A  40.23 
 
 		 252 aa  172  5e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239358  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0163  tRNA pseudouridine synthase A  40.23 
 
 		 252 aa  171  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000189836  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1161  tRNA pseudouridine synthase A  41.18 
 
 		 271 aa  171  1e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0226119  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3350  tRNA pseudouridine synthase A  41.8 
 
 		 247 aa  171  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0985621 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1666  tRNA pseudouridine synthase A  41.18 
 
 		 261 aa  171  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0056205  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2497  tRNA pseudouridine synthase A  41.11 
 
 		 271 aa  168  6e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1901  tRNA pseudouridine synthase A  40.08 
 
 		 252 aa  168  6e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.48254e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2426  tRNA pseudouridine synthase A  39.36 
 
 		 246 aa  167  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000220887  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2877  tRNA pseudouridine synthase A  41.2 
 
 		 244 aa  167  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00616108  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5141  tRNA pseudouridine synthase A  39.37 
 
 		 264 aa  167  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.11531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4238  tRNA pseudouridine synthase A  42.13 
 
 		 250 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00146243 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0543  tRNA pseudouridine synthase A  33.6 
 
 		 245 aa  165  5e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000330857  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0248  tRNA pseudouridine synthase A  40.62 
 
 		 246 aa  165  5.9999999999999996e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.262775 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2299  pseudouridylate synthase  38.04 
 
 		 249 aa  165  5.9999999999999996e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000390138  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4830  tRNA pseudouridine synthase A  33.6 
 
 		 245 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0152439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1452  tRNA pseudouridine synthase A  38.22 
 
 		 256 aa  164  9e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000896278  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0543  tRNA pseudouridine synthase A  33.2 
 
 		 245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.432297  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0492  tRNA pseudouridine synthase A  33.6 
 
 		 245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.138657  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4567  tRNA pseudouridine synthase A  39.3 
 
 		 249 aa  163  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0407  tRNA pseudouridine synthase A  32.8 
 
 		 245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0136  tRNA pseudouridine synthase A  38.28 
 
 		 247 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000296429  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1048  tRNA pseudouridine synthase A  38.82 
 
 		 244 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000774285  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0401  tRNA pseudouridine synthase A  32.8 
 
 		 245 aa  163  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1494  tRNA pseudouridine synthase A  39.08 
 
 		 259 aa  163  3e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.643957  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1237  tRNA pseudouridine synthase ACD  38.8 
 
 		 245 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0714167  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1700  tRNA pseudouridine synthase A  38.37 
 
 		 261 aa  162  6e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.125972 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1060  tRNA pseudouridine synthase A  34.63 
 
 		 248 aa  162  6e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1248  tRNA pseudouridine synthase A  34.63 
 
 		 248 aa  162  7e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0622  tRNA pseudouridine synthase A  35.69 
 
 		 245 aa  161  8.000000000000001e-39  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.939748  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0037  tRNA pseudouridine synthase A  42.41 
 
 		 266 aa  161  8.000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.848154 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3997  tRNA pseudouridine synthase ACD  39.23 
 
 		 270 aa  161  9e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.541279  hitchhiker  0.00061511 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0447  tRNA pseudouridine synthase A  37.8 
 
 		 249 aa  160  1e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.801238 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0462  tRNA pseudouridine synthase A  32.4 
 
 		 245 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0405  tRNA pseudouridine synthase A  32.4 
 
 		 245 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00300726  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0487  tRNA pseudouridine synthase A  32.4 
 
 		 245 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3148  tRNA pseudouridine synthase A  39.23 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.733437  normal  0.353233 
 
 
-
 
NC_002978  WD1068  tRNA pseudouridine synthase A  37.7 
 
 		 245 aa  160  3e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0454345  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0421  tRNA pseudouridine synthase A  33.2 
 
 		 260 aa  159  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000417493  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0409  tRNA pseudouridine synthase A  40.49 
 
 		 245 aa  159  3e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.816199  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0473  tRNA pseudouridine synthase A  32.4 
 
 		 245 aa  159  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0410  tRNA pseudouridine synthase A  40.73 
 
 		 245 aa  159  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2487  tRNA pseudouridine synthase A  39.76 
 
 		 252 aa  159  4e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0319  tRNA pseudouridine synthase A  37.3 
 
 		 250 aa  158  7e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000352927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1218  tRNA pseudouridine synthase ACD  38 
 
 		 245 aa  158  7e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567145  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0346  tRNA pseudouridine synthase A  39.61 
 
 		 262 aa  158  8e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000224311  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3382  tRNA pseudouridine synthase A  38.43 
 
 		 244 aa  158  8e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000753277  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3352  pseudouridylate synthase  40.4 
 
 		 278 aa  157  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1914  tRNA pseudouridine synthase A  39.37 
 
 		 351 aa  157  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0263  tRNA pseudouridine synthase A  39.37 
 
 		 246 aa  155  4e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3303  tRNA pseudouridine synthase A  39.76 
 
 		 245 aa  155  4e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0316618  normal  0.649703 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1634  tRNA pseudouridine synthase A  38.28 
 
 		 250 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.228905  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1033  tRNA pseudouridine synthase A  39.3 
 
 		 251 aa  155  6e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0974  tRNA pseudouridine synthase A  39.3 
 
 		 251 aa  155  6e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3634  tRNA pseudouridine synthase A  37.11 
 
 		 245 aa  155  8e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.13903  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0481  tRNA pseudouridine synthase A  38.91 
 
 		 246 aa  154  1e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000089193  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1346  tRNA pseudouridine synthase A  38.52 
 
 		 251 aa  154  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2681  tRNA pseudouridine synthase A  39.84 
 
 		 262 aa  154  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0556679  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0381  tRNA pseudouridine synthase A  39.6 
 
 		 264 aa  153  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1916  tRNA pseudouridine synthase A  38.76 
 
 		 250 aa  153  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2081  pseudouridylate synthase  38.22 
 
 		 289 aa  154  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.999551 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1859  tRNA pseudouridine synthase ACD  36.76 
 
 		 245 aa  154  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.411434  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0391  tRNA pseudouridine synthase A  39.77 
 
 		 247 aa  153  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.16094  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1321  tRNA pseudouridine synthase A  38.37 
 
 		 247 aa  153  2e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1626  tRNA pseudouridine synthase A  36.33 
 
 		 268 aa  152  4e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.895885  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0468  tRNA pseudouridine synthase A  37.5 
 
 		 271 aa  152  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000442967  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0419  tRNA pseudouridine synthase A  35.29 
 
 		 245 aa  152  5e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.293905  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2893  tRNA pseudouridine synthase A  39.61 
 
 		 254 aa  152  5e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0491  tRNA pseudouridine synthase A  35.88 
 
 		 253 aa  152  5.9999999999999996e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_446  pseudouridylate synthase  38.13 
 
 		 246 aa  151  8.999999999999999e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000332106  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0504  tRNA pseudouridine synthase A  36.96 
 
 		 248 aa  150  2e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00170943  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0841  tRNA pseudouridine synthase A  33.96 
 
 		 305 aa  150  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258098  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4747  tRNA pseudouridine synthase A  40.55 
 
 		 254 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.771886  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0228  tRNA pseudouridine synthase A  36.64 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0020  tRNA pseudouridine synthase A  39.53 
 
 		 243 aa  150  3e-35  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0165  tRNA pseudouridine synthase A  36.25 
 
 		 248 aa  150  3e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>