18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2611 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2611  Rad52/22 double-strand break repair protein  100 
 
 		 238 aa  478  1e-134  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1173  hypothetical protein  58.15 
 
 		 211 aa  250  1e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000729431  normal  0.496656 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0977  Rad52/22 double-strand break repair protein  48.25 
 
 		 201 aa  121  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.00000000168807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2527  Rad52/22 double-strand break repair protein  37.42 
 
 		 170 aa  106  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00242809  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0535  hypothetical protein  39.69 
 
 		 151 aa  91.7  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0116997  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0052  putative prophage protein  41.53 
 
 		 282 aa  85.5  8e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.012266 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0086  prophage protein  42.11 
 
 		 118 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0080  prophage protein  42.11 
 
 		 118 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.568604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0517  Rad52/22 double-strand break repair protein  36.89 
 
 		 167 aa  80.5  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.743906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0612  gp49  34.96 
 
 		 235 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0180237  hitchhiker  0.00151942 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0188  hypothetical protein  30.18 
 
 		 201 aa  75.5  0.0000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.521264  normal  0.55512 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1314  Rad52/22 double-strand break repair protein  34.75 
 
 		 179 aa  73.2  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.321327  normal  0.202591 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0322  hypothetical protein  36.43 
 
 		 242 aa  71.6  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0576  hypothetical protein  32.24 
 
 		 170 aa  71.6  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00845502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2129  hypothetical protein  35.96 
 
 		 252 aa  66.6  0.0000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3545  RAD52/22 double-strand break repair protein  34.25 
 
 		 170 aa  64.7  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000561994  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0565  RAD52/22 double-strand break repair protein  29.73 
 
 		 169 aa  61.6  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.103803 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49083  predicted protein  30.19 
 
 		 468 aa  41.6  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.652257  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>