More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2532 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2532  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
525 aa  1068    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0925  extracellular solute-binding protein family 5  81.91 
 
 
523 aa  874    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.182407  normal  0.30323 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2465  extracellular solute-binding protein  37.12 
 
 
529 aa  309  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.352303 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3888  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  34.58 
 
 
550 aa  292  9e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.799639  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0807  ABC dipeptide transporter, substrate-binding subunit DdpA  36.92 
 
 
538 aa  290  3e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123514  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2326  extracellular solute-binding protein  35.12 
 
 
546 aa  289  1e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.294702  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0372  extracellular solute-binding protein  36.18 
 
 
529 aa  286  9e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.132597  normal  0.149219 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1906  extracellular solute-binding protein  35.26 
 
 
543 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0377443  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4180  extracellular solute-binding protein family 5  34.54 
 
 
547 aa  276  9e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336386  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3852  extracellular solute-binding protein family 5  34.91 
 
 
547 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2713  extracellular solute-binding protein  32.53 
 
 
529 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0038  extracellular solute-binding protein  33.96 
 
 
532 aa  274  3e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.216937  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3829  extracellular solute-binding protein  34.51 
 
 
569 aa  264  3e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.847313 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0799  extracellular solute-binding protein  33.54 
 
 
531 aa  258  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.162067  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2047  extracellular solute-binding protein  31.21 
 
 
529 aa  258  2e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.101703  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7644  extracellular solute-binding protein  31.9 
 
 
528 aa  258  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.938913  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1917  extracellular solute-binding protein  31.77 
 
 
518 aa  252  1e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1248  extracellular solute-binding protein  30.86 
 
 
537 aa  249  9e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.710714 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1442  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.8 
 
 
563 aa  248  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.663118  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3198  extracellular solute-binding protein  32.66 
 
 
547 aa  245  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.271789  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2916  4-phytase  30.93 
 
 
522 aa  245  9.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4056  extracellular solute-binding protein  33.6 
 
 
489 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3528  extracellular solute-binding protein  31.63 
 
 
564 aa  243  5e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.61993  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1274  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33 
 
 
533 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.834925  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1311  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33 
 
 
533 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251362  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2562  periplasmic solute-binding protein  33 
 
 
533 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4004  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
535 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1392  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33 
 
 
533 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00928392  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1050  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33 
 
 
533 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0518  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33 
 
 
533 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.886694  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0247  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33 
 
 
533 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.279993  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4061  extracellular solute-binding protein  32.57 
 
 
529 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.707761  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0553  extracellular solute-binding protein  32.81 
 
 
522 aa  236  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.727867  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6301  extracellular solute-binding protein family 5  31.74 
 
 
535 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4017  extracellular solute-binding protein  32.67 
 
 
533 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0465332  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  32.39 
 
 
515 aa  234  4.0000000000000004e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0197  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.74 
 
 
535 aa  233  6e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.415604  normal  0.0839796 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4479  extracellular solute-binding protein  32.46 
 
 
533 aa  233  9e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.027731  normal  0.668994 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1105  extracellular solute-binding protein  31.84 
 
 
522 aa  231  2e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5720  extracellular solute-binding protein  32.92 
 
 
529 aa  232  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.174819  normal  0.308845 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3783  extracellular solute-binding protein  32.92 
 
 
529 aa  232  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.44101  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4585  extracellular solute-binding protein  32.92 
 
 
529 aa  232  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1258  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  32.44 
 
 
543 aa  231  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1666  extracellular solute-binding protein  32.63 
 
 
501 aa  230  6e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4012  extracellular solute-binding protein  31.51 
 
 
529 aa  229  6e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0256267  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0232  solute-binding family 5 protein  32.16 
 
 
530 aa  230  6e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.79785  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4474  extracellular solute-binding protein  31.51 
 
 
529 aa  229  7e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0385001  normal  0.989495 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1692  extracellular solute-binding protein family 5  31.46 
 
 
531 aa  229  7e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.122173  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1065  solute-binding family 5 protein  32.37 
 
 
530 aa  229  8e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1261  solute-binding family 5 protein  32.37 
 
 
530 aa  229  8e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.24251  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2574  solute-binding family 5 protein  32.37 
 
 
530 aa  229  8e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1253  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  32.46 
 
 
533 aa  229  8e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1329  solute-binding family 5 protein  32.37 
 
 
530 aa  229  8e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492206  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0504  solute-binding family 5 protein  32.37 
 
 
530 aa  229  8e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1427  solute-binding family 5 protein  32.16 
 
 
533 aa  229  9e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3551  ABC dipeptide/oligopeptide/nickel transporter, periplasmic dipeptide/oligopeptide/nickel-binding protein  31.49 
 
 
522 aa  228  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3686  extracellular solute-binding protein  31.49 
 
 
522 aa  228  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2056  extracellular solute-binding protein  30.69 
 
 
521 aa  229  1e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.149494  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1410  solute-binding family 5 protein  32.16 
 
 
530 aa  229  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.139309  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1878  extracellular solute-binding protein family 5  30.97 
 
 
531 aa  228  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.558624  normal  0.335683 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1763  extracellular solute-binding protein family 5  30.02 
 
 
536 aa  228  2e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3777  extracellular solute-binding protein  31.88 
 
 
533 aa  227  4e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4591  extracellular solute-binding protein  31.88 
 
 
533 aa  227  4e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0140228  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2706  extracellular solute-binding protein  32.45 
 
 
538 aa  226  6e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.723031  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5714  extracellular solute-binding protein  31.88 
 
 
533 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0573169 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3741  extracellular solute-binding protein  28.63 
 
 
532 aa  224  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1030  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  29.67 
 
 
534 aa  224  2e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.180664  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1600  extracellular solute-binding protein  31.61 
 
 
501 aa  224  3e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2911  extracellular solute-binding protein  28.85 
 
 
524 aa  223  8e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.628741  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3993  extracellular solute-binding protein family 5  27.15 
 
 
531 aa  221  3e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  31.27 
 
 
534 aa  221  3e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3867  extracellular solute-binding protein family 5  32.05 
 
 
536 aa  218  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3371  extracellular solute-binding protein family 5  32.59 
 
 
536 aa  216  5.9999999999999996e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0135  extracellular solute-binding protein family 5  26.71 
 
 
531 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4044  extracellular solute-binding protein family 5  31.67 
 
 
536 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1799  extracellular solute-binding protein family 5  27.5 
 
 
531 aa  210  6e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0907769  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  30.31 
 
 
535 aa  208  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1255  extracellular solute-binding protein family 5  27.57 
 
 
566 aa  207  3e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2347  extracellular solute-binding protein  30.6 
 
 
516 aa  206  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33855  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3537  extracellular solute-binding protein  30.57 
 
 
556 aa  206  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3088  extracellular solute-binding protein  29.87 
 
 
538 aa  203  6e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.902972  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  28.98 
 
 
544 aa  202  9e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5173  extracellular solute-binding protein family 5  28.94 
 
 
528 aa  200  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12226  normal  0.127243 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4075  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  29.68 
 
 
535 aa  199  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0138  extracellular solute-binding protein  29.81 
 
 
535 aa  199  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4056  periplasmic dipeptide transport protein  29.68 
 
 
535 aa  199  1.0000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0088  4-phytase  29.68 
 
 
535 aa  199  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.534677  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5442  extracellular solute-binding protein family 5  29.43 
 
 
528 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0169825 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1751  extracellular solute-binding protein  31.47 
 
 
538 aa  193  8e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150343  normal  0.0954392 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3907  extracellular solute-binding protein family 5  29.36 
 
 
535 aa  192  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  27.83 
 
 
544 aa  192  1e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3828  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  28.73 
 
 
526 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.808847  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3950  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  28.54 
 
 
526 aa  191  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3906  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  28.54 
 
 
526 aa  191  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.938997 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3842  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  28.54 
 
 
526 aa  191  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  29.67 
 
 
524 aa  191  4e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4010  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  28.54 
 
 
526 aa  190  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2099  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  28.98 
 
 
516 aa  190  5e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2170  extracellular solute-binding protein  28.98 
 
 
516 aa  190  5.999999999999999e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.233404  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  28.74 
 
 
528 aa  190  5.999999999999999e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>