More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2461 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  100 
 
 
202 aa  401  1e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  74.63 
 
 
205 aa  298  4e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  58.38 
 
 
210 aa  199  3e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  51.98 
 
 
671 aa  188  4e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  53.73 
 
 
224 aa  187  9e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  48.04 
 
 
213 aa  186  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  51.5 
 
 
901 aa  184  6e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0386  thymidylate kinase  50.99 
 
 
222 aa  183  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203543  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  50 
 
 
207 aa  183  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  51.9 
 
 
705 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  46.41 
 
 
211 aa  181  7e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  54.41 
 
 
225 aa  181  8.000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  51.83 
 
 
688 aa  179  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  50.99 
 
 
215 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  50.95 
 
 
703 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  51.05 
 
 
214 aa  178  4e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  48.54 
 
 
206 aa  178  4e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  45.1 
 
 
206 aa  177  8e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  48.28 
 
 
217 aa  177  9e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  50 
 
 
213 aa  177  9e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  45.65 
 
 
204 aa  176  1e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  49.5 
 
 
207 aa  176  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  50 
 
 
217 aa  176  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  47.6 
 
 
207 aa  174  6e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  50.48 
 
 
707 aa  174  6e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  49.24 
 
 
213 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  50.5 
 
 
686 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  50.25 
 
 
686 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  46.31 
 
 
216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  48.17 
 
 
216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4954  thymidylate kinase  49.26 
 
 
707 aa  171  5.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768884  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  45.77 
 
 
212 aa  171  7.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  46.67 
 
 
214 aa  171  9e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  50.99 
 
 
210 aa  170  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  48.73 
 
 
225 aa  170  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  50.49 
 
 
210 aa  169  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  50 
 
 
210 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3232  dTMP kinase  49.51 
 
 
226 aa  169  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  50.49 
 
 
210 aa  169  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  49.01 
 
 
215 aa  169  3e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  47.32 
 
 
208 aa  169  3e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  44.93 
 
 
209 aa  168  4e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  49.51 
 
 
210 aa  168  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  49.03 
 
 
210 aa  168  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2194  thymidylate kinase  45.96 
 
 
221 aa  168  6e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  46.97 
 
 
219 aa  168  6e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1564  thymidylate kinase  45.93 
 
 
225 aa  167  7e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.446858  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  52.31 
 
 
688 aa  167  7e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  50.76 
 
 
224 aa  167  8e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26170  thymidylate kinase  49.75 
 
 
243 aa  167  9e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288155  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  45.45 
 
 
236 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  46.38 
 
 
211 aa  166  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  46.81 
 
 
234 aa  166  2e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1310  thymidylate kinase  46.77 
 
 
214 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  44.55 
 
 
218 aa  164  5.9999999999999996e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  44.5 
 
 
226 aa  164  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1425  thymidylate kinase  49.28 
 
 
205 aa  164  6.9999999999999995e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.578696  normal  0.216838 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0661  thymidylate kinase  49.75 
 
 
210 aa  164  8e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.438198  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1407  thymidylate kinase  47.96 
 
 
213 aa  164  8e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255239  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1784  thymidylate kinase  50.24 
 
 
205 aa  164  9e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378428  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  50.25 
 
 
207 aa  164  9e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3720  dTMP kinase  48.31 
 
 
229 aa  164  9e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00484768 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  47.32 
 
 
218 aa  163  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0128  dTMP kinase  47.62 
 
 
217 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.630862  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1466  thymidylate kinase  48.79 
 
 
205 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.0122014 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3412  thymidylate kinase  47.52 
 
 
221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1460  dTMP kinase  45.32 
 
 
223 aa  162  2.0000000000000002e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  48.77 
 
 
662 aa  162  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1508  dTMP kinase  49.49 
 
 
240 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376965  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  46.19 
 
 
211 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  44.5 
 
 
212 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  46.86 
 
 
221 aa  162  4.0000000000000004e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  47.26 
 
 
281 aa  162  5.0000000000000005e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  42.86 
 
 
203 aa  160  8.000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1611  dTMP kinase  45.81 
 
 
217 aa  160  9e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  49.26 
 
 
204 aa  160  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  49.03 
 
 
210 aa  160  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0822  thymidylate kinase  41.87 
 
 
213 aa  159  2e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0899477  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  44.39 
 
 
215 aa  159  3e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0683  thymidylate kinase  47.98 
 
 
216 aa  159  4e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  47.03 
 
 
208 aa  158  5e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  47.12 
 
 
217 aa  158  5e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  43.94 
 
 
211 aa  158  6e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3204  thymidylate kinase  49.74 
 
 
225 aa  158  6e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00156948  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  46.89 
 
 
215 aa  157  7e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0025  thymidylate kinase  44 
 
 
208 aa  157  8e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  43.33 
 
 
219 aa  157  9e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_684  thymidylate kinase  45.81 
 
 
207 aa  157  1e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  48.54 
 
 
210 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_002936  DET0778  thymidylate kinase  45.32 
 
 
207 aa  156  2e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2940  dTMP kinase  48.22 
 
 
225 aa  156  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0704  thymidylate kinase  45.77 
 
 
208 aa  156  2e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0992  dTMP kinase  42.59 
 
 
234 aa  156  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.241763  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0498  dTMP kinase  42.61 
 
 
236 aa  156  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1145  thymidylate kinase  47.06 
 
 
244 aa  155  3e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.446337  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3591  thymidylate kinase  46.46 
 
 
214 aa  155  3e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.389295 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  49.51 
 
 
211 aa  155  4e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09210  thymidylate kinase  47.15 
 
 
295 aa  155  4e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0808366 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  47.34 
 
 
212 aa  155  4e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2267  dTMP kinase  42.44 
 
 
212 aa  155  4e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.799684  normal  0.27429 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>