More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2445 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2445  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
397 aa  806    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2379  Extracellular ligand-binding receptor  88.16 
 
 
397 aa  700    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0029  extracellular ligand-binding receptor  34.43 
 
 
393 aa  220  3.9999999999999997e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3839  extracellular ligand-binding receptor  34.97 
 
 
397 aa  219  7.999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0951081  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2357  extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 
389 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0768636  normal  0.579443 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4065  extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 
391 aa  204  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0404  Extracellular ligand-binding receptor  32.75 
 
 
389 aa  202  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1594  Extracellular ligand-binding receptor  31.97 
 
 
394 aa  179  7e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2285  Extracellular ligand-binding receptor  27.84 
 
 
385 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.399222  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2427  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  27.3 
 
 
403 aa  116  7.999999999999999e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0626  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  26.63 
 
 
410 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.741534  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0542  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  26.63 
 
 
420 aa  111  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3506  putative branched-chain amino acid transport system substrate-binding protein  25.21 
 
 
408 aa  101  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1734  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  25.5 
 
 
380 aa  101  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.534498  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2037  Extracellular ligand-binding receptor  26.64 
 
 
379 aa  97.1  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000596452 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1735  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26.28 
 
 
378 aa  94.4  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2190  Extracellular ligand-binding receptor  25.61 
 
 
379 aa  94.4  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2746  Extracellular ligand-binding receptor  27.67 
 
 
385 aa  93.2  7e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3111  Extracellular ligand-binding receptor  27.14 
 
 
385 aa  93.2  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2038  Extracellular ligand-binding receptor  24.6 
 
 
379 aa  92.4  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000518039 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2606  Extracellular ligand-binding receptor  27.59 
 
 
373 aa  92.4  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0170435  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3253  extracellular ligand-binding receptor  27.59 
 
 
373 aa  92.4  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.363046 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0531  extracellular ligand-binding receptor  23.9 
 
 
386 aa  90.1  5e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000267349  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5995  putative leucine-, isoleucine-, valine-, threonine-, and alanine-binding protein precursor  25.7 
 
 
407 aa  89  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.524183  normal  0.0200525 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2750  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.63 
 
 
425 aa  89  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0109739  normal  0.254921 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2189  Extracellular ligand-binding receptor  24.2 
 
 
379 aa  89.4  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1671  extracellular ligand-binding receptor  25.37 
 
 
379 aa  88.6  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2131  extracellular ligand-binding receptor  25.09 
 
 
379 aa  87.8  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0617424  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1392  Extracellular ligand-binding receptor  26.79 
 
 
382 aa  87.4  4e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.54413  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4331  extracellular ligand-binding receptor  26.32 
 
 
373 aa  87  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4935  Extracellular ligand-binding receptor  24.01 
 
 
389 aa  87  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0920  extracellular ligand-binding receptor  26.12 
 
 
382 aa  87  6e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0314  extracellular ligand-binding receptor  26.75 
 
 
397 aa  86.3  9e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.568066  normal  0.496718 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0052  Extracellular ligand-binding receptor  28.31 
 
 
387 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1155  hypothetical protein  26.28 
 
 
438 aa  85.5  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0965806  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2138  leucine-, isoleucine-, valine-, threonine-, and alanine-binding protein precursor  26.29 
 
 
371 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.469771  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0862  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding protein  26.29 
 
 
371 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22915  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1546  branched chain amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  26.63 
 
 
404 aa  85.1  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.102523  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2901  extracellular ligand-binding receptor  25.83 
 
 
419 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0772  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding protein  26.29 
 
 
371 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1861  Extracellular ligand-binding receptor  23.63 
 
 
379 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.571716  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3994  extracellular ligand-binding receptor  24.77 
 
 
339 aa  84.3  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000070067  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2130  extracellular ligand-binding receptor  24.52 
 
 
380 aa  84  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.482674  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4549  Extracellular ligand-binding receptor  27.44 
 
 
393 aa  84  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1741  Extracellular ligand-binding receptor  28.83 
 
 
375 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.734186  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0139  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component  27.78 
 
 
402 aa  84  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1839  leucine-, isoleucine-, valine-, threonine-, and alanine-binding protein precursor  26 
 
 
371 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201932  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4947  extracellular ligand-binding receptor  28.03 
 
 
372 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4432  extracellular ligand-binding receptor  28.03 
 
 
372 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.197262  hitchhiker  0.000137112 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5900  extracellular ligand-binding receptor  27.09 
 
 
384 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.137338 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3623  extracellular ligand-binding receptor  28.03 
 
 
372 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.606149  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5010  hypothetical protein  25.36 
 
 
443 aa  81.6  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3606  extracellular ligand-binding receptor  26.06 
 
 
395 aa  81.6  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.316629 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4184  extracellular ligand-binding receptor  25.75 
 
 
377 aa  81.3  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.891545 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1740  extracellular ligand-binding receptor  26.46 
 
 
435 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398941  normal  0.157953 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2663  putative UreA/short-chain amide transport system substrate-binding protein precursor  26.79 
 
 
412 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0749447  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1870  extracellular ligand-binding receptor  25.7 
 
 
358 aa  81.3  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0220738 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3724  extracellular ligand-binding receptor  24.53 
 
 
384 aa  80.5  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159594  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1131  extracellular ligand-binding receptor  25.93 
 
 
385 aa  80.9  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3348  extracellular ligand-binding receptor  27.71 
 
 
372 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5268  extracellular ligand-binding receptor  27.71 
 
 
372 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5019  extracellular ligand-binding receptor  27.71 
 
 
372 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.560718 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2319  extracellular ligand-binding receptor  27.87 
 
 
371 aa  80.5  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0651  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.71 
 
 
399 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.837637  normal  0.508329 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0997  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.52 
 
 
392 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.489385  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0376  extracellular ligand-binding receptor  25.81 
 
 
381 aa  79.7  0.00000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000374663  hitchhiker  0.000123514 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4108  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  23.81 
 
 
374 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0910585  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3845  extracellular ligand-binding receptor  24.3 
 
 
374 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.390057  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5759  putative UreA/short-chain amide transport system substrate-binding protein precursor  25.99 
 
 
411 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0317  extracellular ligand-binding receptor  25.48 
 
 
382 aa  79.3  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00438106  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4575  ABC transporter substrate-binding protein  23.78 
 
 
426 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1927  extracellular ligand-binding receptor  24.44 
 
 
406 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195593  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1566  putative branched-chain amino acid ABC transport system substrate-binding protein  23.4 
 
 
426 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.293644  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3559  extracellular ligand-binding receptor  24.13 
 
 
418 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0888701  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2480  extracellular ligand-binding receptor  25.82 
 
 
375 aa  78.6  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143282  normal  0.0556416 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0052  Fis family transcriptional regulator  24.76 
 
 
426 aa  78.6  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4127  extracellular ligand-binding receptor  25.97 
 
 
400 aa  78.6  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.515914  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1248  extracellular ligand-binding receptor  24.36 
 
 
375 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0300  putative branched-chain amino acid ABC transport system substrate-binding protein  23.59 
 
 
426 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.652614  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1387  extracellular ligand-binding receptor  25.96 
 
 
373 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.279691 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1310  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.68 
 
 
389 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.381196  normal  0.934076 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3153  extracellular ligand-binding receptor  25.82 
 
 
398 aa  77.4  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.154593  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0130  extracellular ligand-binding receptor  28.29 
 
 
423 aa  77.4  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0243473 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1823  extracellular ligand-binding receptor  22.58 
 
 
380 aa  77  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4179  putative branched-chain amino acid ABC transport system substrate-binding protein  23.67 
 
 
438 aa  77  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19650  high affinity branched chain amino acid ABC transporter, amino acid binding protein  25 
 
 
373 aa  76.6  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.337564  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0350  extracellular ligand-binding receptor  27.78 
 
 
376 aa  77  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000281139  normal  0.291499 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5291  putative branched-chain amino acid transport system substrate-binding protein  27 
 
 
418 aa  76.6  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1864  branched-chain amino acid ABC transport system substrate-binding protein  22.72 
 
 
426 aa  76.6  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.397842  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3020  putative urea/short-chain amide transport system substrate-binding protein  26.24 
 
 
412 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0119  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid binding protein, putative  24.4 
 
 
427 aa  76.6  0.0000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.232449  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1050  extracellular ligand-binding receptor  22.49 
 
 
381 aa  76.3  0.0000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.464924 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4422  extracellular ligand-binding receptor  28.9 
 
 
384 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0360  extracellular ligand-binding receptor  27.37 
 
 
381 aa  75.9  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0680  extracellular ligand-binding receptor  29.53 
 
 
399 aa  76.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  25.78 
 
 
376 aa  75.5  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2765  extracellular ligand-binding receptor  27.6 
 
 
408 aa  75.5  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.094864  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3538  hypothetical protein  26.67 
 
 
437 aa  75.1  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000073392  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50520  branched-chain amino acid transport protein BraC  25.32 
 
 
373 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592692 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3335  extracellular ligand-binding receptor  26.82 
 
 
370 aa  75.5  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>