268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2197 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2197  large conductance mechanosensitive channel protein  100 
 
 
132 aa  257  4e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.270032  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1165  large conductance mechanosensitive channel protein  51.56 
 
 
122 aa  135  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.221389  normal  0.423534 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1383  large conductance mechanosensitive channel protein  48.48 
 
 
145 aa  120  6e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.190141  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1843  large conductance mechanosensitive channel protein  48.12 
 
 
126 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.130997  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1972  large conductance mechanosensitive channel protein  43.41 
 
 
132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8656  large conductance mechanosensitive channel protein  47.58 
 
 
134 aa  111  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1657  large-conductance mechanosensitive channel  46.21 
 
 
125 aa  111  3e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7238  large conductance mechanosensitive channel protein  47.73 
 
 
129 aa  111  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0390041  normal  0.160628 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4693  large-conductance mechanosensitive channel  49.65 
 
 
138 aa  110  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0070  large conductance mechanosensitive channel protein  48.85 
 
 
131 aa  110  6e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6488  large conductance mechanosensitive channel protein  48.82 
 
 
169 aa  110  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.182707  normal  0.360955 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0089  large conductance mechanosensitive channel protein  47.14 
 
 
142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0334  large-conductance mechanosensitive channel  47.18 
 
 
138 aa  108  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0803754  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0318  large-conductance mechanosensitive channel  47.18 
 
 
138 aa  108  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384644  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0253  large-conductance mechanosensitive channel  47.22 
 
 
145 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410741  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2291  large conductance mechanosensitive channel protein  46.92 
 
 
131 aa  107  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0410  large-conductance mechanosensitive channel  48.57 
 
 
137 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3231  large-conductance mechanosensitive channel  43.84 
 
 
144 aa  107  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0624  large conductance mechanosensitive channel protein  42.31 
 
 
176 aa  107  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.29249  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0437  large-conductance mechanosensitive channel  44.62 
 
 
133 aa  107  6e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000628379  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1030  large conductance mechanosensitive channel protein  47.22 
 
 
139 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.184236  normal  0.070135 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6045  large conductance mechanosensitive channel protein  46.48 
 
 
163 aa  105  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1928  large-conductance mechanosensitive channel  45.77 
 
 
139 aa  105  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.425698 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0820  large-conductance mechanosensitive channel  42.36 
 
 
151 aa  105  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.577469  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3207  large-conductance mechanosensitive channel  42.76 
 
 
142 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0902  large conductance mechanosensitive channel protein  48.08 
 
 
134 aa  104  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2342  large conductance mechanosensitive channel protein  42.19 
 
 
126 aa  104  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.998505  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2962  large-conductance mechanosensitive channel  45.39 
 
 
159 aa  103  6e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1428  large conductance mechanosensitive channel protein  43.18 
 
 
126 aa  103  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.144967  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0055  large conductance mechanosensitive channel protein  42.96 
 
 
140 aa  103  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.153997 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2630  large conductance mechanosensitive channel protein  44.76 
 
 
138 aa  102  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.425108  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0006  large conductance mechanosensitive channel protein  46.96 
 
 
138 aa  103  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404291  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3137  large conductance mechanosensitive channel protein  43.75 
 
 
127 aa  103  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2607  large conductance mechanosensitive channel protein  47.92 
 
 
142 aa  102  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  0.681771 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1381  large conductance mechanosensitive channel protein  41.35 
 
 
132 aa  101  3e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2261  large-conductance mechanosensitive channel  46.53 
 
 
139 aa  101  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6128  large-conductance mechanosensitive channel  42.18 
 
 
143 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.316261  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1951  large-conductance mechanosensitive channel  42.18 
 
 
143 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30610  large conductance mechanosensitive channel protein  43.08 
 
 
164 aa  101  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0156749  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1975  large-conductance mechanosensitive channel  41.5 
 
 
143 aa  100  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0443039 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2860  large-conductance mechanosensitive channel  41.38 
 
 
142 aa  101  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.219386 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2579  large conductance mechanosensitive channel protein  45.83 
 
 
141 aa  100  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1865  large-conductance mechanosensitive channel  41.5 
 
 
143 aa  100  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.568071  hitchhiker  0.00372648 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0317  large conductance mechanosensitive channel protein  41.67 
 
 
123 aa  100  5e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209684  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1938  large-conductance mechanosensitive channel  41.5 
 
 
143 aa  100  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2802  large conductance mechanosensitive channel protein  45.83 
 
 
141 aa  100  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.21352  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1501  large-conductance mechanosensitive channel  40.82 
 
 
143 aa  100  6e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.917907  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2079  large-conductance mechanosensitive channel  40.82 
 
 
143 aa  100  6e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2000  large-conductance mechanosensitive channel  40.82 
 
 
143 aa  100  6e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3310  large-conductance mechanosensitive channel  40.82 
 
 
143 aa  100  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00104042  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2373  large-conductance mechanosensitive channel  40.82 
 
 
143 aa  100  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140991  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2415  large-conductance mechanosensitive channel  40.82 
 
 
143 aa  100  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258205  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1272  large-conductance mechanosensitive channel  40.82 
 
 
143 aa  100  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.404097  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5262  large-conductance mechanosensitive channel  41.5 
 
 
143 aa  100  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0455479  normal  0.24364 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0090  large conductance mechanosensitive channel protein  46.38 
 
 
151 aa  100  7e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.343086  normal  0.118693 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2641  large-conductance mechanosensitive channel  44.52 
 
 
143 aa  100  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00276841 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2624  large conductance mechanosensitive channel protein  41.48 
 
 
129 aa  100  7e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.462758 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2521  large-conductance mechanosensitive channel  40.14 
 
 
199 aa  100  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.334793  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0941  large conductance mechanosensitive channel protein  44.68 
 
 
137 aa  99.8  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.954406  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3208  large conductance mechanosensitive channel protein  42.55 
 
 
141 aa  99.4  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0654251  normal  0.948556 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4806  large-conductance mechanosensitive channel  43.08 
 
 
133 aa  99.4  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0292  large-conductance mechanosensitive channel  40.85 
 
 
138 aa  99.4  1e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2930  large-conductance mechanosensitive channel  41.67 
 
 
141 aa  99  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0832  large conductance mechanosensitive channel protein  41.48 
 
 
201 aa  99  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0900  large conductance mechanosensitive channel protein  39.42 
 
 
166 aa  99  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.117504  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0647  large conductance mechanosensitive channel protein  45.27 
 
 
139 aa  99.4  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16810  mscL large conductance mechanosensitive channel protein  42.86 
 
 
140 aa  99  2e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.230846  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0712  large-conductance mechanosensitive channel  38.89 
 
 
142 aa  98.6  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.23692 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0724  large-conductance mechanosensitive channel  44.44 
 
 
146 aa  98.2  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2915  large conductance mechanosensitive channel protein  42.75 
 
 
130 aa  98.2  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2379  large-conductance mechanosensitive channel  44.44 
 
 
146 aa  98.6  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.567154 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4808  large-conductance mechanosensitive channel  41.54 
 
 
132 aa  97.8  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2817  large conductance mechanosensitive channel protein  43.85 
 
 
130 aa  97.8  4e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.234312  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5504  large-conductance mechanosensitive channel  41.67 
 
 
142 aa  97.4  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.215904 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3886  large-conductance mechanosensitive channel  42.34 
 
 
137 aa  95.5  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00283568  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3845  large-conductance mechanosensitive channel  43.07 
 
 
136 aa  95.5  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0611  large-conductance mechanosensitive channel  42.34 
 
 
137 aa  95.5  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0263138  normal  0.217178 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3789  large-conductance mechanosensitive channel  43.07 
 
 
136 aa  95.5  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3971  large-conductance mechanosensitive channel  43.07 
 
 
136 aa  95.5  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0312  large-conductance mechanosensitive channel  42.34 
 
 
134 aa  95.5  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.929299  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0454  large-conductance mechanosensitive channel  41.54 
 
 
132 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.116893 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0480  large-conductance mechanosensitive channel  43.07 
 
 
136 aa  95.5  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0521  large-conductance mechanosensitive channel  44.53 
 
 
136 aa  95.1  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3511  large-conductance mechanosensitive channel  44.53 
 
 
136 aa  95.1  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0520  large-conductance mechanosensitive channel  43.8 
 
 
136 aa  94.7  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4785  large-conductance mechanosensitive channel  40.77 
 
 
132 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2162  large-conductance mechanosensitive channel  42.19 
 
 
126 aa  94.4  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0554  large-conductance mechanosensitive channel  44.53 
 
 
136 aa  94.4  5e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000110723  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0166  large-conductance mechanosensitive channel  44.06 
 
 
142 aa  94.4  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.3696  normal  0.313526 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3339  large-conductance mechanosensitive channel  43.8 
 
 
136 aa  94.4  5e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2603  large-conductance mechanosensitive channel  46.15 
 
 
143 aa  93.6  8e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.240683  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0225  large-conductance mechanosensitive channel  45.83 
 
 
145 aa  93.6  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4648  large conductance mechanosensitive channel protein  41.41 
 
 
146 aa  93.6  8e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.508499  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4049  large conductance mechanosensitive channel protein  40.46 
 
 
152 aa  93.6  9e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1168  large conductance mechanosensitive channel, MscL family  41.22 
 
 
157 aa  93.6  9e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000144587  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4569  large-conductance mechanosensitive channel  39.23 
 
 
132 aa  92.8  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4404  large-conductance mechanosensitive channel  39.23 
 
 
132 aa  92.8  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3793  large-conductance mechanosensitive channel  43.8 
 
 
137 aa  93.2  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.832034  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13070  large conductance mechanosensitive channel protein  40.15 
 
 
151 aa  92.8  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00812185  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01831  large-conductance mechanosensitive channel  43.07 
 
 
140 aa  92.8  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.514761  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>