More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2086 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2086  DNA ligase, NAD-dependent  100 
 
 		 670 aa  1346    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1670  DNA ligase NAD-dependent  66.06 
 
 		 666 aa  864    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.229082 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0696  DNA ligase, NAD-dependent  52.28 
 
 		 684 aa  647    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.266157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2346  DNA ligase, NAD-dependent  47.24 
 
 		 670 aa  596  1e-169  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1094  DNA ligase, NAD-dependent  49.18 
 
 		 672 aa  588  1e-166  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.878392  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2438  DNA ligase, NAD-dependent  49.85 
 
 		 673 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0271  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.19 
 
 		 670 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1618  DNA ligase, NAD-dependent  46.89 
 
 		 673 aa  579  1e-164  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000164842  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1167  DNA ligase, NAD-dependent  49.25 
 
 		 678 aa  580  1e-164  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.140803  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2013  DNA ligase, NAD-dependent  49.93 
 
 		 666 aa  576  1.0000000000000001e-163  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1517  DNA ligase, NAD-dependent  47.6 
 
 		 659 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000611736  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2024  DNA ligase (NAD(+))  50.15 
 
 		 675 aa  570  1e-161  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00334946  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0327  DNA ligase, NAD-dependent  49.33 
 
 		 685 aa  568  1e-161  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0681  DNA ligase, NAD-dependent  47.98 
 
 		 673 aa  570  1e-161  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.295891  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2927  DNA ligase, NAD-dependent  46.85 
 
 		 683 aa  566  1e-160  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000591487  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1147  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.61 
 
 		 670 aa  565  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2728  NAD-dependent DNA ligase C4-type  48.1 
 
 		 671 aa  565  1.0000000000000001e-159  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0163  DNA ligase, NAD-dependent  48.42 
 
 		 685 aa  556  1e-157  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0316123  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1881  DNA ligase (NAD+)  46.6 
 
 		 674 aa  556  1e-157  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.605724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0763  DNA ligase, NAD-dependent  45.63 
 
 		 677 aa  558  1e-157  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000192603  normal  0.836157 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0292  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.22 
 
 		 669 aa  555  1e-156  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0352  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.07 
 
 		 669 aa  552  1e-156  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4968  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.22 
 
 		 669 aa  553  1e-156  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1305  DNA ligase, NAD-dependent  48.64 
 
 		 672 aa  554  1e-156  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.617786  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0306  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.22 
 
 		 669 aa  555  1e-156  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1522  NAD-dependent DNA ligase  45.17 
 
 		 673 aa  553  1e-156  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1993  DNA ligase, NAD-dependent  43.27 
 
 		 667 aa  553  1e-156  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4656  DNA ligase, NAD-dependent  46.23 
 
 		 673 aa  554  1e-156  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.203554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0337  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.22 
 
 		 669 aa  555  1e-156  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1959  DNA ligase, NAD-dependent  43.27 
 
 		 667 aa  553  1e-156  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0182  DNA ligase, NAD-dependent  43.44 
 
 		 681 aa  553  1e-156  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0335  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.76 
 
 		 669 aa  551  1e-155  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0276  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.92 
 
 		 669 aa  551  1e-155  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0279  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.92 
 
 		 669 aa  551  1e-155  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0538  DNA ligase, NAD-dependent  46.36 
 
 		 662 aa  550  1e-155  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0378  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.76 
 
 		 669 aa  551  1e-155  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1511  DNA ligase, NAD-dependent  41.95 
 
 		 662 aa  551  1e-155  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0217425  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0655  DNA ligase, NAD-dependent  45.02 
 
 		 670 aa  551  1e-155  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0286  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.91 
 
 		 669 aa  551  1e-155  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0287  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.61 
 
 		 669 aa  548  1e-154  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0890  DNA ligase, NAD-dependent  46.88 
 
 		 670 aa  545  1e-154  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1442  DNA ligase, NAD-dependent  43.42 
 
 		 665 aa  546  1e-154  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.474438  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1886  NAD-dependent DNA ligase  46.98 
 
 		 711 aa  547  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136067  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0277  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.09 
 
 		 679 aa  548  1e-154  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1035  DNA ligase, NAD-dependent  45.05 
 
 		 663 aa  546  1e-154  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2744  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.76 
 
 		 670 aa  542  1e-153  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000148607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0462  DNA ligase, NAD-dependent  44.58 
 
 		 663 aa  539  9.999999999999999e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0877  DNA ligase, NAD-dependent  47.05 
 
 		 718 aa  540  9.999999999999999e-153  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00627604  hitchhiker  0.0000000262982 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2364  DNA ligase, NAD-dependent  45.13 
 
 		 685 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0084265  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1432  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.76 
 
 		 670 aa  540  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000269504  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2883  DNA ligase, NAD-dependent  43.88 
 
 		 678 aa  539  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.745192 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0369  DNA ligase (NAD(+))  47.3 
 
 		 661 aa  542  9.999999999999999e-153  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3444  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.43 
 
 		 673 aa  541  9.999999999999999e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000441921  hitchhiker  0.000209829 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1617  DNA ligase, NAD-dependent  46.78 
 
 		 672 aa  540  9.999999999999999e-153  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.755766  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1321  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.76 
 
 		 670 aa  540  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000153003  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2948  DNA ligase, NAD-dependent  47.81 
 
 		 668 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1693  DNA ligase (NAD+)  46.41 
 
 		 675 aa  538  1e-151  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000392244  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02300  DNA ligase, NAD-dependent  46.42 
 
 		 670 aa  536  1e-151  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000139643  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1336  DNA ligase, NAD-dependent  47.2 
 
 		 668 aa  536  1e-151  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3405  DNA ligase, NAD-dependent  44.91 
 
 		 672 aa  538  1e-151  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.558724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0647  DNA ligase, NAD-dependent  44.72 
 
 		 707 aa  538  1e-151  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.407599  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2022  DNA ligase, NAD-dependent  45.25 
 
 		 691 aa  536  1e-151  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2377  DNA ligase, NAD-dependent  45.66 
 
 		 669 aa  536  1e-151  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000760862  unclonable  0.00000201736 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0824  DNA ligase, NAD-dependent  44.28 
 
 		 688 aa  537  1e-151  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4515  DNA ligase, NAD-dependent  46.18 
 
 		 726 aa  535  1e-151  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0847  DNA ligase, NAD-dependent  44.28 
 
 		 688 aa  537  1e-151  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2679  DNA ligase, NAD-dependent  45.39 
 
 		 685 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000018832  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2896  DNA ligase, NAD-dependent  45.11 
 
 		 689 aa  534  1e-150  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1734  NAD-dependent DNA ligase  47.04 
 
 		 683 aa  532  1e-150  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.39998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2758  DNA ligase, NAD-dependent  45.39 
 
 		 685 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00554758  hitchhiker  0.000696981 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1343  DNA ligase, NAD-dependent  45.39 
 
 		 683 aa  532  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584756  normal  0.20338 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2316  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.02 
 
 		 774 aa  532  1e-150  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.444372  normal  0.080689 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26670  DNA ligase, NAD-dependent  44.9 
 
 		 708 aa  534  1e-150  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000046682  normal  0.968488 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0676  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.98 
 
 		 738 aa  535  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.759983  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02311  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.53 
 
 		 671 aa  530  1e-149  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000571235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1250  DNA ligase, NAD-dependent  44.53 
 
 		 671 aa  529  1e-149  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000262994  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2571  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.46 
 
 		 671 aa  529  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000161057  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2698  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.53 
 
 		 671 aa  529  1e-149  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000106098  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2546  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.53 
 
 		 671 aa  530  1e-149  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.01558e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02272  hypothetical protein  44.53 
 
 		 671 aa  530  1e-149  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000450383  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1020  DNA ligase  45.27 
 
 		 673 aa  529  1e-149  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1575  DNA ligase, NAD-dependent  45.89 
 
 		 697 aa  530  1e-149  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3660  DNA ligase, NAD-dependent  44.71 
 
 		 681 aa  530  1e-149  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0589668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1878  DNA ligase, NAD-dependent  44.65 
 
 		 711 aa  530  1e-149  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0313  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.28 
 
 		 676 aa  530  1e-149  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2213  DNA ligase, NAD-dependent  45.79 
 
 		 671 aa  529  1e-149  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000618814  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0703  DNA ligase, NAD-dependent  46.27 
 
 		 691 aa  529  1e-149  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2939  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.26 
 
 		 671 aa  531  1e-149  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000192646  normal  0.0623801 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2190  DNA ligase, NAD-dependent  47.05 
 
 		 693 aa  530  1e-149  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0728062  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1705  DNA ligase, NAD-dependent  45.09 
 
 		 685 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000114947  decreased coverage  0.000000000204337 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2662  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.46 
 
 		 671 aa  529  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0516763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2686  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.31 
 
 		 671 aa  528  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.595672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1508  DNA ligase, NAD-dependent  44.91 
 
 		 690 aa  530  1e-149  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000647513  hitchhiker  0.000000119836 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1575  DNA ligase, NAD-dependent  45.32 
 
 		 690 aa  531  1e-149  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0209027  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1267  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.53 
 
 		 671 aa  529  1e-149  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000309607  decreased coverage  0.0000372126 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1569  DNA ligase, NAD-dependent  44.98 
 
 		 691 aa  529  1e-149  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0515781  unclonable  0.000000000191104 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3642  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.53 
 
 		 671 aa  528  1e-149  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000402344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1111  DNA ligase, NAD-dependent  42.55 
 
 		 705 aa  531  1e-149  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.878311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1516  DNA ligase (NAD(+))  45.71 
 
 		 681 aa  531  1e-149  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000678531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2592  DNA ligase, NAD-dependent  45.55 
 
 		 706 aa  528  1e-148  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.457213 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>