More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2029 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2029  NUDIX hydrolase  100 
 
 
184 aa  374  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.40025  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0219  NUDIX hydrolase  64.74 
 
 
184 aa  244  4.9999999999999997e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2928  NUDIX hydrolase  59.89 
 
 
189 aa  224  4e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2826  pyrophosphohydrolase related protein  57.95 
 
 
192 aa  216  1e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0471  NUDIX hydrolase  57.78 
 
 
184 aa  214  5.9999999999999996e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115783  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1662  NUDIX hydrolase  57.65 
 
 
201 aa  212  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2474  MutT/nudix family protein  53.49 
 
 
182 aa  197  1.0000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.131904  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1066  NUDIX hydrolase  55.03 
 
 
201 aa  190  1e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.133388  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3753  NUDIX hydrolase  51.46 
 
 
206 aa  183  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.641661  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0333  MutT/nudix family protein  52.84 
 
 
189 aa  181  7e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0452702  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0271  NUDIX hydrolase  41.42 
 
 
180 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.443042  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  39.66 
 
 
184 aa  123  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4146  NUDIX hydrolase  41.95 
 
 
180 aa  122  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2209  NUDIX hydrolase  37.43 
 
 
184 aa  122  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.022301  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0157  NUDIX hydrolase  43.03 
 
 
180 aa  120  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0179624  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15030  NTP pyrophosphohydrolase  46.67 
 
 
181 aa  118  6e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.202896  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2011  NUDIX hydrolase  34.41 
 
 
192 aa  115  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252009  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3049  NUDIX hydrolase  39.66 
 
 
182 aa  113  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
178 aa  112  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
178 aa  112  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2429  NUDIX hydrolase  37.85 
 
 
182 aa  111  6e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0417103 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02241  hypothetical protein  40.83 
 
 
179 aa  108  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0727099  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4021  NUDIX hydrolase  41.11 
 
 
181 aa  107  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4251  NUDIX hydrolase  41.11 
 
 
181 aa  107  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.833226  normal  0.0489284 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4096  NUDIX hydrolase  41.11 
 
 
181 aa  107  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.196207  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  34.86 
 
 
183 aa  107  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1523  NUDIX hydrolase  40 
 
 
180 aa  106  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000782  ADP-ribose pyrophosphatase  36.72 
 
 
179 aa  105  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2794  NUDIX hydrolase  36.78 
 
 
181 aa  103  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2006  NUDIX hydrolase  39.52 
 
 
186 aa  102  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00276085  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6067  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
193 aa  102  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0114891  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2018  NUDIX hydrolase  39.77 
 
 
192 aa  101  7e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  34.34 
 
 
182 aa  100  8e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2376  NUDIX hydrolase  38.01 
 
 
215 aa  100  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  31.79 
 
 
177 aa  100  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3065  hypothetical protein  37.57 
 
 
181 aa  99.8  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00194764 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
176 aa  99  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4737  NUDIX hydrolase  38.15 
 
 
174 aa  99  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.271916 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  33.73 
 
 
180 aa  99  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6125  NUDIX hydrolase  38.64 
 
 
178 aa  98.6  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25410  NTP pyrophosphohydrolase  36.67 
 
 
210 aa  98.2  7e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2174  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
190 aa  98.2  7e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0334323  normal  0.0698698 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2943  NUDIX hydrolase  38.98 
 
 
209 aa  98.2  7e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2987  NUDIX hydrolase  38.98 
 
 
209 aa  98.2  7e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0180  NUDIX hydrolase  36.42 
 
 
183 aa  97.1  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195159 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3000  NUDIX hydrolase  35.75 
 
 
199 aa  96.7  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3558  NUDIX hydrolase  42.45 
 
 
173 aa  96.3  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2822  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
210 aa  96.7  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2958  NUDIX hydrolase  38.42 
 
 
209 aa  95.5  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.682992  normal  0.58041 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  34.13 
 
 
180 aa  95.1  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3624  NUDIX hydrolase  41.73 
 
 
173 aa  94.7  6e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0176  NUDIX hydrolase  40.15 
 
 
173 aa  94.7  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0982781  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  35.75 
 
 
185 aa  92.4  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  33.15 
 
 
180 aa  92  4e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29440  NUDIX family protein  41.28 
 
 
179 aa  92  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  34.34 
 
 
177 aa  92  4e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  33.73 
 
 
177 aa  91.7  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5434  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 
213 aa  91.3  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000494994  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  37.23 
 
 
179 aa  90.9  9e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  32.75 
 
 
179 aa  90.5  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3282  NUDIX hydrolase  36.78 
 
 
211 aa  89  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1556  NUDIX hydrolase  32.16 
 
 
180 aa  88.2  6e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1587  NUDIX hydrolase  32.16 
 
 
180 aa  88.2  6e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.356936  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1779  adp-ribose pyrophosphatase  30.72 
 
 
176 aa  88.2  7e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6699  NUDIX hydrolase  32.02 
 
 
215 aa  87.8  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.121967 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4016  NUDIX hydrolase  36.63 
 
 
183 aa  87.8  8e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0320053  normal  0.298866 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3501  NUDIX hydrolase  39.18 
 
 
211 aa  87.8  9e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.368602  normal  0.313364 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  35.06 
 
 
199 aa  87  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2192  NUDIX hydrolase  39.43 
 
 
179 aa  86.7  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.349846  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  31.93 
 
 
176 aa  86.3  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0048  NUDIX hydrolase  39.23 
 
 
173 aa  85.9  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.642128 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3458  NUDIX hydrolase  36.9 
 
 
215 aa  85.9  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.185858  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4523  NUDIX hydrolase  35.76 
 
 
178 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2595  NUDIX hydrolase  30.23 
 
 
176 aa  85.5  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000152881  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1912  NUDIX hydrolase  35.37 
 
 
201 aa  85.1  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255381  hitchhiker  0.000304952 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0213  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
178 aa  84.3  8e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0378357  normal  0.391369 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1757  NUDIX hydrolase  33.13 
 
 
189 aa  84.3  8e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335075  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5410  NUDIX hydrolase  41.01 
 
 
208 aa  82.8  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11715  hypothetical protein  35.06 
 
 
207 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.191182 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  34.34 
 
 
281 aa  82.8  0.000000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1921  NUDIX hydrolase  35.19 
 
 
201 aa  82.4  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.137486 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0724  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 
169 aa  81.6  0.000000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.983328  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0076  NUDIX hydrolase  30.11 
 
 
184 aa  81.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.655363 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1659  NUDIX hydrolase  33.7 
 
 
194 aa  81.3  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.074052  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  32.37 
 
 
186 aa  80.9  0.000000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2439  NUDIX hydrolase  34.12 
 
 
181 aa  80.1  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000635517  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0600  NUDIX hydrolase  33.73 
 
 
183 aa  79.7  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  32.76 
 
 
194 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0835  NUDIX hydrolase  35.03 
 
 
199 aa  79.7  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.773833  normal  0.937872 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1673  NUDIX hydrolase  30.12 
 
 
175 aa  79.7  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542994 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000047  ADP-ribose pyrophosphatase  29.34 
 
 
214 aa  79  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.911513  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1026  NUDIX hydrolase  32.06 
 
 
183 aa  79.3  0.00000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2047  hypothetical protein  32.95 
 
 
205 aa  79  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440129  normal  0.12393 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1927  NUDIX hydrolase  33.54 
 
 
184 aa  78.6  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00211801  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1876  NUDIX hydrolase  32.16 
 
 
203 aa  79  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.765348  normal  0.48572 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2199  NUDIX hydrolase  32.16 
 
 
203 aa  79  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0978  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 
189 aa  79  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1489  NUDIX hydrolase  36.65 
 
 
173 aa  78.6  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3464  NUDIX hydrolase  31.55 
 
 
190 aa  78.6  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.36556  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  33.53 
 
 
186 aa  78.6  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>