More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1963 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_1963  ribosome recycling factor  100 
 
 		 185 aa  374  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.566814  normal  0.0766357 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1783  ribosome recycling factor  76.76 
 
 		 185 aa  303  1.0000000000000001e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00108157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1046  ribosome recycling factor  62.84 
 
 		 183 aa  236  2e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.197511  normal  0.0713595 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  52.84 
 
 		 184 aa  197  9e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  52.33 
 
 		 186 aa  193  1e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10920  ribosome recycling factor  51.65 
 
 		 186 aa  191  4e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0728725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2379  ribosome recycling factor  52.02 
 
 		 184 aa  191  6e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0010  ribosome recycling factor  51.65 
 
 		 192 aa  191  7e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0696052  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1918  ribosome recycling factor  46.45 
 
 		 185 aa  190  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2472  ribosome recycling factor  50.82 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1253  ribosome recycling factor  46.99 
 
 		 185 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000298645  hitchhiker  0.00105804 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1035  ribosome recycling factor  51.91 
 
 		 185 aa  188  4e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000462528  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1003  ribosome recycling factor  50 
 
 		 183 aa  187  5e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  53.01 
 
 		 185 aa  188  5e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  49.45 
 
 		 186 aa  187  5e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1401  ribosome recycling factor  50.85 
 
 		 186 aa  187  5.999999999999999e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.100309  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1142  ribosome recycling factor  46.99 
 
 		 185 aa  187  8e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000869669  normal  0.111417 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  49.18 
 
 		 185 aa  187  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1539  ribosome recycling factor  47.54 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4958  ribosome recycling factor  46.7 
 
 		 192 aa  185  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.759908  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0528  ribosome recycling factor  47.28 
 
 		 185 aa  185  4e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1761  ribosome recycling factor  50 
 
 		 186 aa  184  4e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.725495  normal  0.0665089 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  51.46 
 
 		 184 aa  184  5e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07680  ribosome recycling factor  48.09 
 
 		 185 aa  184  5e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029169  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1438  ribosome recycling factor  47.78 
 
 		 186 aa  184  6e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.389466  hitchhiker  0.000418835 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  51.45 
 
 		 186 aa  184  7e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0986  ribosome recycling factor  46.99 
 
 		 185 aa  184  8e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00114143  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  52.05 
 
 		 184 aa  184  9e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2692  ribosome recycling factor  50.58 
 
 		 186 aa  183  9e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.272144  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1527  ribosome recycling factor  46.74 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00139576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0445  ribosome recycling factor  46.45 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00199228  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3730  ribosome recycling factor  46.45 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000151569  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0570  ribosome recycling factor  45.65 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0496987  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  48.63 
 
 		 186 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  47.25 
 
 		 184 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3514  ribosome recycling factor  47.54 
 
 		 185 aa  183  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.763665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0300  ribosome recycling factor  49.72 
 
 		 186 aa  182  3e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0653192 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_318  ribosome recycling factor  47.8 
 
 		 185 aa  182  3e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.108452  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1335  ribosome recycling factor  48.89 
 
 		 186 aa  182  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2753  ribosome recycling factor  46.45 
 
 		 185 aa  181  4.0000000000000006e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1826  ribosome recycling factor  46.45 
 
 		 186 aa  181  4.0000000000000006e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05781  ribosome recycling factor  50 
 
 		 182 aa  181  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0374  ribosome recycling factor  47.25 
 
 		 185 aa  181  6e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1407  ribosome recycling factor  46.11 
 
 		 186 aa  181  6e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  48.09 
 
 		 185 aa  181  7e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1537  ribosome recycling factor  48.85 
 
 		 187 aa  180  9.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2847  ribosome recycling factor  50 
 
 		 186 aa  179  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1488  ribosome recycling factor  45.9 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169142 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1676  ribosome recycling factor  44.81 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1670  ribosome recycling factor  44.81 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1951  ribosome recycling factor  44.02 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1669  ribosome recycling factor  44.02 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.17061  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2452  ribosome recycling factor  48.33 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.26871  hitchhiker  0.00149746 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1853  ribosome recycling factor  49.43 
 
 		 182 aa  179  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2698  ribosome recycling factor  47.73 
 
 		 182 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4945  ribosome recycling factor  44.26 
 
 		 186 aa  179  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1918  ribosome recycling factor  44.81 
 
 		 185 aa  178  4e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.36169e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0259  ribosome recycling factor  47.54 
 
 		 185 aa  177  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00118776  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1685  ribosome recycling factor  48.33 
 
 		 186 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.188884 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0241  ribosome recycling factor  47.54 
 
 		 185 aa  177  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.743934 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0257  ribosome recycling factor  47.54 
 
 		 185 aa  177  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.585226 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0244  ribosome recycling factor  47.54 
 
 		 185 aa  177  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0241  ribosome recycling factor  47.54 
 
 		 185 aa  177  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.331553 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0632  ribosome recycling factor  47.73 
 
 		 187 aa  177  5.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.330477  hitchhiker  0.00509823 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  49.18 
 
 		 185 aa  177  7e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1345  ribosome recycling factor  46.67 
 
 		 186 aa  177  7e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0459515  normal  0.505766 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3446  ribosome recycling factor  47.16 
 
 		 187 aa  177  7e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0960945  normal  0.455289 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0356  ribosome recycling factor  50.59 
 
 		 173 aa  177  7e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0472189  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  52.05 
 
 		 185 aa  177  8e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1552  ribosome recycling factor  45.56 
 
 		 186 aa  177  8e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2490  ribosome recycling factor  45.56 
 
 		 186 aa  177  8e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2580  ribosome recycling factor  45.56 
 
 		 186 aa  177  8e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3258  ribosome recycling factor  45.56 
 
 		 186 aa  177  8e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.797404  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2434  ribosome recycling factor  45.56 
 
 		 186 aa  177  8e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0313731  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  52.05 
 
 		 185 aa  177  8e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2053  ribosome recycling factor  45.56 
 
 		 186 aa  177  8e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1325  ribosome recycling factor  45.56 
 
 		 186 aa  177  8e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0289556  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4637  ribosome recycling factor  48.84 
 
 		 182 aa  177  9e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.138932  normal  0.818253 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00170  ribosome releasing factor  46.45 
 
 		 185 aa  176  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.148385  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3431  ribosome recycling factor  46.45 
 
 		 185 aa  176  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000510427  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0174  ribosome recycling factor  46.45 
 
 		 185 aa  176  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00802553  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1484  ribosome recycling factor  43.72 
 
 		 185 aa  176  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000709639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1441  ribosome recycling factor  46.41 
 
 		 186 aa  177  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.378711 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0944  ribosome recycling factor  45.9 
 
 		 185 aa  176  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00317572  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1281  ribosome recycling factor  46.11 
 
 		 186 aa  176  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.208847 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3488  ribosome recycling factor  46.45 
 
 		 185 aa  176  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00730416  normal  0.367592 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0182  ribosome recycling factor  46.45 
 
 		 185 aa  176  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000723298  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2602  ribosome recycling factor  46.45 
 
 		 189 aa  176  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1282  ribosome recycling factor  42.08 
 
 		 185 aa  176  1e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000366075  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  48.63 
 
 		 185 aa  176  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0176  ribosome recycling factor  46.45 
 
 		 185 aa  176  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000066149  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1448  ribosome recycling factor  43.72 
 
 		 185 aa  176  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000214173  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0165  ribosome recycling factor  46.45 
 
 		 185 aa  176  1e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000948857  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2047  ribosome recycling factor  44.81 
 
 		 185 aa  177  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.082584  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0183  ribosome recycling factor  46.45 
 
 		 185 aa  176  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.07548  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00169  hypothetical protein  46.45 
 
 		 185 aa  176  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.160878  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1453  ribosome recycling factor  43.17 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000049819  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1878  ribosome recycling factor  47.37 
 
 		 186 aa  176  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.556612  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1069  ribosome recycling factor  44.81 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00702897  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3193  ribosome recycling factor  48.3 
 
 		 187 aa  176  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>