48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1957 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1957  ABC-2 type transporter  100 
 
 
388 aa  761  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0574803  normal  0.493307 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1790  putative sodium ABC transporter permease protein  59.49 
 
 
395 aa  451  1e-126  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1676  ABC-2 type transporter  38.48 
 
 
413 aa  197  3e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.333655 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1529  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  30.88 
 
 
409 aa  168  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.508402  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2943  ABC-2 type transporter  26.65 
 
 
405 aa  152  9e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0364  ABC-2 type transporter  24.69 
 
 
394 aa  146  7e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0341  ABC-2 type transporter  24.12 
 
 
394 aa  142  1e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2950  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  29.21 
 
 
397 aa  141  2e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.404593  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0112  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  26.6 
 
 
403 aa  139  8e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03077  putative ABC-type Na+ efflux pump, permease component  29.88 
 
 
398 aa  130  5e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3144  Abortive infection protein  29.31 
 
 
830 aa  112  9e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.569126  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0115  ABC-2 type transporter  24.16 
 
 
405 aa  105  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3196  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  36 
 
 
408 aa  102  9e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.109527 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02800  ABC transporter sodium permease  32.44 
 
 
397 aa  92  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4866  ABC-2 type transporter  31 
 
 
387 aa  87.8  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4192  ABC-2 type transporter  24.25 
 
 
381 aa  87.4  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.148286  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4462  ABC-2 type transporter  25.53 
 
 
382 aa  85.9  1e-15  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.510043 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1500  ABC transporter sodium permease  28.31 
 
 
394 aa  84.3  3e-15  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.809114  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3799  Na+ ABC transporter permease protein  25.55 
 
 
397 aa  84  4e-15  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.578241  normal  0.0174839 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1445  ABC transporter sodium permease  29 
 
 
394 aa  84  4e-15  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.757965  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3782  ABC-2 type transporter  28.83 
 
 
378 aa  83.6  6e-15  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0055  transport protein, putative  25.13 
 
 
379 aa  83.2  8e-15  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0072  transport protein, putative  25.94 
 
 
379 aa  82.4  1e-14  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.177811 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0069  transport protein, putative  26.22 
 
 
379 aa  81.6  2e-14  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0074  transport protein, putative  25.94 
 
 
379 aa  82  2e-14  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  3.31098e-05 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0069  transport protein, putative  25.94 
 
 
379 aa  81.6  2e-14  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0769  Abortive infection protein  31.43 
 
 
775 aa  82  2e-14  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4280  transport protein, putative  25.19 
 
 
379 aa  81.3  3e-14  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0074  transport protein, putative  25.19 
 
 
379 aa  80.9  4e-14  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0071  transport protein, putative  26.22 
 
 
379 aa  80.9  4e-14  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0070  transport protein, putative  25.69 
 
 
379 aa  79.3  9e-14  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3872  ABC transporter sodium permease  27.27 
 
 
394 aa  78.6  2e-13  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0066  transport protein, putative  26.52 
 
 
378 aa  77.4  4e-13  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3979  ABC-2 type transporter  28.15 
 
 
377 aa  76.6  7e-13  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.508382  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3577  transport protein, putative  25.3 
 
 
378 aa  75.9  1e-12  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0724  protein NatB  26.74 
 
 
396 aa  74.7  2e-12  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19710  ABC-2 type transporter  27.78 
 
 
193 aa  73.2  8e-12  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1131  ABC-2 type transporter  25.33 
 
 
390 aa  68.9  1e-10  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.315475  hitchhiker  0.00237195 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3735  heavy metal efflux pump CzcA  23.08 
 
 
392 aa  53.5  6e-06  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0858  hypothetical protein  23.62 
 
 
378 aa  50.4  5e-05  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.137935  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0209  conserved hypothetical protein  24.44 
 
 
396 aa  49.3  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1421  ABC-2 type transporter  28.86 
 
 
415 aa  47  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  23.31 
 
 
366 aa  46.2  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2392  Fis family transcriptional regulator  22.4 
 
 
387 aa  45.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.76466  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  23.58 
 
 
376 aa  44.3  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0659  ABC-2 type transporter  33.96 
 
 
271 aa  44.3  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2558  hypothetical protein  27.8 
 
 
466 aa  43.5  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.246034  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3999  ATP-dependent Na+ efflux pump  24.11 
 
 
406 aa  43.1  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.241363 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>