28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1912 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_1912  protein of unknown function DUF935  100 
 
 		 511 aa  1026    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.6802 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1968  hypothetical protein  71.9 
 
 		 523 aa  718    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.418273 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1877  hypothetical protein  37.68 
 
 		 582 aa  260  4e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1641  hypothetical protein  34.57 
 
 		 523 aa  219  7e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2089  hypothetical protein  32.52 
 
 		 528 aa  207  5e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00551419  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2136  hypothetical protein  32.47 
 
 		 538 aa  206  6e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2248  hypothetical protein  37.9 
 
 		 584 aa  206  9e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3047  hypothetical protein  33.75 
 
 		 517 aa  204  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88762  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0667  hypothetical protein  31.99 
 
 		 533 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3006  hypothetical protein  33.87 
 
 		 517 aa  201  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.357056  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1299  hypothetical protein  33.68 
 
 		 543 aa  196  7e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2101  hypothetical protein  33.68 
 
 		 543 aa  196  7e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0242078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3393  protein of unknown function DUF935  29.82 
 
 		 543 aa  189  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.219922  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0671  protein of unknown function DUF935  30.45 
 
 		 530 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2680  hypothetical protein  27.03 
 
 		 521 aa  172  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0729  protein of unknown function DUF935  30.8 
 
 		 552 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4502  hypothetical protein  31.85 
 
 		 544 aa  163  8.000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.221715 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0763  hypothetical protein  26.93 
 
 		 519 aa  161  3e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0674  hypothetical protein  26.93 
 
 		 519 aa  161  3e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3783  hypothetical protein  29.64 
 
 		 537 aa  133  6.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.690842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0433  protein of unknown function DUF935  24.93 
 
 		 510 aa  94.7  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2932  hypothetical protein  24.47 
 
 		 496 aa  92  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.163033  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1284  protein of unknown function DUF935  24.1 
 
 		 524 aa  80.5  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02991e-32 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3417  Mu-like protein prophage protein gp29-like protein  26.52 
 
 		 545 aa  73.6  0.000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.610061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3373  hypothetical protein  23.49 
 
 		 523 aa  67.8  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1002  Mu-like prophage protein  23.87 
 
 		 505 aa  65.5  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291607 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0250  hypothetical protein  22.54 
 
 		 456 aa  46.6  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0265  hypothetical protein  25.12 
 
 		 429 aa  46.2  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>