More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1882 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  49.84 
 
 		 906 aa  768    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1882  SMC domain protein  100 
 
 		 904 aa  1761    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.600097  normal  0.549876 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0772  SMC domain protein  25.18 
 
 		 961 aa  252  3e-65  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1677  SMC domain-containing protein  26.11 
 
 		 1018 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0491089  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1640  SMC domain-containing protein  26.11 
 
 		 1018 aa  187  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0173468  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2703  SMC domain protein  25.69 
 
 		 1018 aa  185  3e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0776806  hitchhiker  0.0000173958 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1589  exonuclease SbcC, putative  24.52 
 
 		 1018 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2326  putative exonuclease  23.8 
 
 		 1029 aa  181  7e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.678825  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1268  exonuclease SbcC, putative  27.54 
 
 		 1020 aa  180  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0566832  hitchhiker  0.000365685 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05654  DNA repair exonuclease  25.34 
 
 		 1018 aa  178  4e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1655  SMC domain-containing protein  25.31 
 
 		 1018 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00224161  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000033  exonuclease SbcC  25.93 
 
 		 1018 aa  170  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00466596  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2633  SMC domain-containing protein  25.12 
 
 		 1018 aa  169  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.158627  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2998  putative exonuclease  24.84 
 
 		 1029 aa  167  5e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000658197  decreased coverage  0.00861967 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0823  SMC protein-like protein  39.63 
 
 		 910 aa  167  8e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.465313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1890  DNA repair exonuclease, SbcC  27.87 
 
 		 989 aa  154  5.9999999999999996e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.295467  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0052  SMC domain protein  22.96 
 
 		 1049 aa  149  3e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0521  SMC domain protein  23.17 
 
 		 1011 aa  146  2e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1257  SMC domain protein  27.01 
 
 		 1019 aa  141  4.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.861215  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0525  SMC domain-containing protein  24.89 
 
 		 859 aa  140  7e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315541  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0760  SMC domain protein  29.27 
 
 		 1165 aa  133  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000289262  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1551  SMC domain-containing protein  31.3 
 
 		 824 aa  127  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.875451  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2848  exonuclease SbcC  32.86 
 
 		 1308 aa  126  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1496  SMC domain-containing protein  30.86 
 
 		 824 aa  125  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00508772  hitchhiker  0.000363104 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1488  SMC domain protein  34.26 
 
 		 1114 aa  124  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3946  exonuclease protein  25.28 
 
 		 1024 aa  121  6e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4031  SMC domain-containing protein  32.7 
 
 		 810 aa  119  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.515725  normal  0.378288 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0426  exonuclease subunit SbcC  27.76 
 
 		 1047 aa  117  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.442969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04030  Exodeoxyribonuclease I subunit C  22.87 
 
 		 1108 aa  116  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0894457  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0549  exonuclease SbcC, putative  23.32 
 
 		 859 aa  116  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2451  SMC domain-containing protein  34.48 
 
 		 1232 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0316  exonuclease subunit SbcC  28.46 
 
 		 1047 aa  115  3e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.53041  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0673  SMC domain protein  30.93 
 
 		 1116 aa  115  5e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00700495  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3236  exonuclease subunit SbcC  28.32 
 
 		 1047 aa  114  6e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.528521  hitchhiker  0.0000322457 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0464  exonuclease subunit SbcC  28.32 
 
 		 1047 aa  114  6e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00345  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  28.16 
 
 		 1048 aa  114  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00349  hypothetical protein  28.16 
 
 		 1048 aa  114  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3108  SMC domain protein  34.17 
 
 		 1227 aa  114  8.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.885936  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1915  SMC domain protein  33.16 
 
 		 815 aa  114  9e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00125008  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3212  exonuclease SbcC  28.55 
 
 		 1048 aa  113  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.223053  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0493  exonuclease subunit SbcC  33.85 
 
 		 1046 aa  112  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0433  exonuclease subunit SbcC  33.85 
 
 		 1046 aa  112  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.2903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2167  SMC domain-containing protein  29.93 
 
 		 1029 aa  112  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876433  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0207  exonuclease SbcC  27.95 
 
 		 1172 aa  112  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0438  exonuclease subunit SbcC  33.85 
 
 		 1046 aa  112  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0205  SMC domain-containing protein  25.95 
 
 		 1180 aa  111  6e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2519  SMC domain-containing protein  29.49 
 
 		 1018 aa  111  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00280637  unclonable  0.0000395857 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0171  nuclease SbcCD, C subunit, putative  23.66 
 
 		 1030 aa  111  8.000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0205  exonuclease SbcC  27.64 
 
 		 1172 aa  110  9.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.305096  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0432  exonuclease subunit SbcC  28.32 
 
 		 1046 aa  109  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3443  SMC protein-like  36.1 
 
 		 1232 aa  110  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6131  SMC domain protein  42.31 
 
 		 851 aa  109  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.983245 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1408  DNA repair ATPase-like protein  22.76 
 
 		 1009 aa  108  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000306703  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1435  putative exonuclease SbcC  22.76 
 
 		 1009 aa  108  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00155429  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2136  exonuclease SbcC  24.59 
 
 		 1029 aa  108  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.142558  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2379  putative exonuclease  24.59 
 
 		 1029 aa  108  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0472  exonuclease subunit SbcC  33.46 
 
 		 1047 aa  108  6e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227308  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2122  exonuclease  24.59 
 
 		 1029 aa  108  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.837048  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0283  SMC domain protein  31.76 
 
 		 1223 aa  108  6e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0424  exonuclease subunit SbcC  33.08 
 
 		 1047 aa  107  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1532  SMC domain-containing protein  31.27 
 
 		 1018 aa  107  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000252521  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2391  exonuclease, putative  29.59 
 
 		 1029 aa  106  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15331  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2199  exonuclease  24.4 
 
 		 1029 aa  106  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1333  nuclease sbcCD subunit C  38.07 
 
 		 1226 aa  106  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2360  exonuclease  24.4 
 
 		 1029 aa  106  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293135  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3538  SMC domain-containing protein  33.7 
 
 		 1144 aa  106  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.862786  normal  0.561749 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2611  exonuclease SbcC, putative  30.21 
 
 		 1018 aa  106  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153819  hitchhiker  0.0000000100584 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0237  SMC domain-containing protein  22.29 
 
 		 993 aa  105  3e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769992  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11550  ATP-dependent dsDNA exonuclease SbcC  35.44 
 
 		 1137 aa  105  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.055976  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2080  exonuclease SbcC  28.85 
 
 		 1219 aa  105  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2384  exonuclease SbcC  28.41 
 
 		 1099 aa  105  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00297099  hitchhiker  0.00111486 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2461  putative exonuclease  28.48 
 
 		 1029 aa  104  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000696116  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2637  SMC domain-containing protein  37.12 
 
 		 1164 aa  104  6e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.257916  normal  0.0339127 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1730  exonuclease  30.05 
 
 		 1223 aa  104  9e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0842079  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0084  exonuclease sbcC  24.78 
 
 		 1039 aa  103  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  25.32 
 
 		 1029 aa  103  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2505  SMC protein-like protein  36.02 
 
 		 1265 aa  103  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0217131  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2449  SMC domain-containing protein  29.41 
 
 		 1018 aa  103  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634989  unclonable  0.0000000000799023 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1039  exonuclease SbcC  32.54 
 
 		 1083 aa  103  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.772605  normal  0.479303 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1303  SMC domain-containing protein  54.64 
 
 		 1234 aa  103  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2917  SMC domain protein  31.28 
 
 		 1227 aa  102  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.605657  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1006  SMC domain protein  34.29 
 
 		 1227 aa  102  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.817412  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3278  SMC domain-containing protein  34.26 
 
 		 1229 aa  101  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116021  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3139  nuclease SbcCD, C subunit  34.26 
 
 		 1229 aa  102  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.642669  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3289  nuclease SbcCD, C subunit  34.26 
 
 		 1220 aa  102  5e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.267466 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3664  dsDNA exonuclease SbcC  31.02 
 
 		 1017 aa  101  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0918  exonuclease SbcC  28.65 
 
 		 1009 aa  100  9e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2702  putative exonuclease  49.53 
 
 		 881 aa  100  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0098926  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0568  SMC domain-containing protein  31.85 
 
 		 1091 aa  100  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.564542  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0894  SMC domain-containing protein  32.64 
 
 		 1165 aa  100  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.60496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3777  exonuclease SbcC  39.6 
 
 		 1103 aa  99.8  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  unclonable  0.00618704  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1142  SMC domain protein  29.95 
 
 		 857 aa  99.4  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2539  SMC domain protein  34.91 
 
 		 1085 aa  99  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2822  SMC domain-containing protein  27.22 
 
 		 1020 aa  98.2  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3304  exonuclease SbcC  33.33 
 
 		 1227 aa  97.8  7e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1919  SMC protein, N-terminal  30.52 
 
 		 1155 aa  97.8  8e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0204  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)-like  30.92 
 
 		 1088 aa  97.8  8e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.18794  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0865  exonuclease subunit SbcC  46.48 
 
 		 1042 aa  97.1  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.379439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1443  ATPase for DNA repair  36.36 
 
 		 1046 aa  97.1  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1364  ATP-dependent dsDNA exonuclease  35.85 
 
 		 1059 aa  97.1  1e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>