28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1745 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1745  DNA binding domain protein, excisionase family  100 
 
 
68 aa  139  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.453337 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1410  DNA binding domain-containing protein, excisionase family  81.54 
 
 
73 aa  120  5e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.251698  normal  0.111999 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1579  DNA binding domain protein, excisionase family  43.86 
 
 
68 aa  53.9  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.963252  normal  0.220961 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0025  DNA binding domain protein, excisionase family  48.98 
 
 
63 aa  50.4  0.000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.917253  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0882  excisionase family DNA-binding protein  43.4 
 
 
74 aa  50.1  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000814624  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3699  hypothetical protein  36.73 
 
 
55 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0085  DNA binding domain-containing protein  38.33 
 
 
73 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0754203  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0223  molybdopterin biosynthesis protein, putative  42.55 
 
 
315 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0246  putative molybdopterin biosynthesis protein  42.55 
 
 
306 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0194  molybdate-binding protein  42.55 
 
 
315 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1200  excisionase/Xis, DNA-binding  37.25 
 
 
98 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00000791415  normal  0.674457 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0204  molybdopterin biosynthesis protein  42.55 
 
 
306 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0190  molybdate-binding protein  42.55 
 
 
315 aa  43.9  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0403  DNA binding domain-containing protein  41.67 
 
 
118 aa  43.9  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00109148  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0205  molybdopterin biosynthesis protein  42.55 
 
 
306 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0222  putative molybdopterin biosynthesis protein  42.55 
 
 
306 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0201  DNA binding domain-containing protein  42.55 
 
 
305 aa  43.5  0.0009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3698  DNA binding domain protein, excisionase family  42.31 
 
 
59 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0812  DNA binding domain protein, excisionase family  40.74 
 
 
308 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5098  periplasmic molybdate-binding protein  40.43 
 
 
306 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0229  putative molybdopterin biosynthesis protein  40.43 
 
 
306 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1737  DNA binding domain protein, excisionase family  42.55 
 
 
315 aa  41.6  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0643  DNA binding domain protein, excisionase family  42.31 
 
 
81 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0187  DNA binding domain-containing protein  40.43 
 
 
306 aa  41.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1985  DNA binding domain protein, excisionase family  40.38 
 
 
71 aa  41.2  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000030807  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3301  phage transcriptional regulator, AlpA  35.71 
 
 
84 aa  40.8  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0344  DNA binding domain protein, excisionase family  43.48 
 
 
56 aa  40.8  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0663  DNA binding domain-containing protein  36.54 
 
 
71 aa  40.4  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.292535  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>