15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1697 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1697  cyclase/dehydrase  100 
 
 
145 aa  297  3e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.128204  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1806  cyclase/dehydrase  77.93 
 
 
145 aa  231  2.0000000000000002e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000623077  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3614  cyclase/dehydrase  27.03 
 
 
156 aa  59.7  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2552  cyclase/dehydrase  23.45 
 
 
155 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00196411  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5760  cyclase/dehydrase  26.58 
 
 
161 aa  50.4  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0842  cyclase/dehydrase  29.25 
 
 
218 aa  48.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.623924  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3009  cyclase/dehydrase  30.07 
 
 
256 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000149284 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5126  cyclase/dehydrase  24.46 
 
 
169 aa  45.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1223  hypothetical protein  31.58 
 
 
163 aa  44.7  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0114  cyclase/dehydrase  34.43 
 
 
225 aa  43.5  0.0009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4500  cyclase/dehydrase  23.31 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4587  cyclase/dehydrase  23.31 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4883  cyclase/dehydrase  23.31 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0833406 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1645  bacterio-opsin linked product  24.31 
 
 
166 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0022  cyclase/dehydrase  26.36 
 
 
155 aa  41.2  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>