More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1574 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  100 
 
 
385 aa  775  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  38.64 
 
 
387 aa  219  5e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  33.24 
 
 
414 aa  136  6e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  2.30336e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  31.82 
 
 
363 aa  135  1e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  28.65 
 
 
370 aa  134  4e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  31.22 
 
 
387 aa  132  8e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  30.17 
 
 
389 aa  130  5e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  30.14 
 
 
390 aa  129  1e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  30 
 
 
404 aa  129  1e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  29.2 
 
 
374 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  29.2 
 
 
374 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  33.33 
 
 
377 aa  127  4e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  25.66 
 
 
369 aa  122  7e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  28.61 
 
 
370 aa  122  1e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  29.3 
 
 
357 aa  121  2e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  25.97 
 
 
369 aa  121  2e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  1.20563e-05 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  29.33 
 
 
367 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  31.49 
 
 
435 aa  120  5e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  28.91 
 
 
443 aa  117  2e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  30.29 
 
 
377 aa  116  7e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  26.87 
 
 
369 aa  115  1e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  28.19 
 
 
413 aa  114  2e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  29.08 
 
 
386 aa  114  2e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  26.2 
 
 
391 aa  115  2e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  28.57 
 
 
383 aa  113  6e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  1.32895e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  29.95 
 
 
409 aa  112  1e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  27.66 
 
 
400 aa  111  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  27.86 
 
 
451 aa  110  4e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  28.99 
 
 
391 aa  110  6e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  30 
 
 
477 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  24.3 
 
 
381 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1351  integrase family protein  28.78 
 
 
416 aa  108  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26510  site-specific recombinase XerD  28.31 
 
 
443 aa  107  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  26.06 
 
 
381 aa  107  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  29.94 
 
 
378 aa  107  5e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  26.78 
 
 
381 aa  106  6e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  1.65595e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  31.72 
 
 
383 aa  105  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  30.59 
 
 
385 aa  105  1e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  1.19227e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  31.27 
 
 
371 aa  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  25.57 
 
 
398 aa  105  1e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  27.95 
 
 
368 aa  104  3e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  25.97 
 
 
393 aa  103  6e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  30.29 
 
 
391 aa  103  7e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  29.73 
 
 
379 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  29.73 
 
 
379 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0795  integrase family protein  26.73 
 
 
362 aa  102  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.475603  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  31.23 
 
 
379 aa  101  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  25.38 
 
 
392 aa  101  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  28.09 
 
 
378 aa  101  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  23.57 
 
 
376 aa  100  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  25.14 
 
 
376 aa  99  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  1.92232e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25.47 
 
 
376 aa  99.4  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25.47 
 
 
376 aa  99.4  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1885  prophage LambdaSa2, site-specific recombinase phage integrase family protein  23.76 
 
 
356 aa  98.6  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  25.27 
 
 
378 aa  95.1  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  28.61 
 
 
416 aa  94.4  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0926  phage integrase family site specific recombinase  23.94 
 
 
354 aa  94  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  7.19898e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  23.95 
 
 
388 aa  92.8  9e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  25.68 
 
 
305 aa  90.5  5e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  25.96 
 
 
325 aa  89.7  7e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  25.5 
 
 
373 aa  89.7  7e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1096  integrase  25.14 
 
 
374 aa  89.4  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.077251  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0926  integrase family protein  30.42 
 
 
438 aa  89  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  27.3 
 
 
454 aa  87.4  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  30.8 
 
 
388 aa  87.4  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1407  integrase family protein  27.44 
 
 
374 aa  87  6e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0609363  normal  0.0878514 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  27.51 
 
 
392 aa  86.7  7e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  3.97895e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  30.04 
 
 
402 aa  86.7  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  22.62 
 
 
384 aa  86.3  8e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1239  integrase family protein  24.81 
 
 
390 aa  85.5  1e-15  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.120865  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0607  integrase  26.88 
 
 
374 aa  85.5  1e-15  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  26.61 
 
 
400 aa  85.5  1e-15  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  9.71423e-06 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  28.02 
 
 
403 aa  85.9  1e-15  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  26.88 
 
 
463 aa  85.1  2e-15  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  25.74 
 
 
392 aa  85.1  2e-15  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
 
NC_008699  Noca_2293  phage integrase family protein  27.07 
 
 
395 aa  84.3  3e-15  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2275  integrase  24.46 
 
 
393 aa  84  4e-15  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1986  phage integrase family site specific recombinase  24.09 
 
 
375 aa  83.6  5e-15  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0058  phage integrase family protein  29.13 
 
 
395 aa  83.6  5e-15  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251229  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0457  integrase family protein  27.54 
 
 
487 aa  83.2  7e-15  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  31.91 
 
 
431 aa  82.8  8e-15  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3548  phage integrase family protein  29.76 
 
 
209 aa  82.8  9e-15  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.339654  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1100  phage integrase family protein  29.13 
 
 
383 aa  82.4  1e-14  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08320  site-specific recombinase XerD  23.69 
 
 
460 aa  82.4  1e-14  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.113738 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  31.66 
 
 
422 aa  82.8  1e-14  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  29.32 
 
 
422 aa  82.8  1e-14  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3747  phage integrase family protein  28.68 
 
 
471 aa  81.6  2e-14  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51033  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  27.25 
 
 
353 aa  81.6  2e-14  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1985  phage integrase family protein  28.12 
 
 
469 aa  81.6  2e-14  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.630467  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  23.81 
 
 
388 aa  82  2e-14  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2786  phage integrase family protein  28.68 
 
 
471 aa  82  2e-14  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3913  phage integrase family protein  31.15 
 
 
387 aa  81.3  3e-14  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126543  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2097  phage integrase family protein  24.23 
 
 
345 aa  81.3  3e-14  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0806496  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2060  phage integrase family protein  24.23 
 
 
345 aa  81.3  3e-14  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00257719  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1527  integrase family protein  26.97 
 
 
357 aa  80.1  6e-14  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.115316 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  26.8 
 
 
404 aa  80.1  6e-14  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1182  phage integrase family protein  24.04 
 
 
376 aa  80.1  6e-14  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  9.13824e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  24.86 
 
 
376 aa  79.7  7e-14  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1956  Integrase  26.47 
 
 
312 aa  79.7  7e-14  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03080  site-specific recombinase XerC  26.94 
 
 
381 aa  79.7  8e-14  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0299404  hitchhiker  1.02879e-24 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>