More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1487 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  100 
 
 
510 aa  1020    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  70.22 
 
 
514 aa  715    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0381  amine oxidase  73.23 
 
 
510 aa  723    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  59.22 
 
 
510 aa  570  1e-161  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  45.08 
 
 
554 aa  434  1e-120  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  42.83 
 
 
554 aa  416  9.999999999999999e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  44.09 
 
 
547 aa  411  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  41.68 
 
 
559 aa  405  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  35.81 
 
 
556 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2659  beta-carotene ketolase  40.5 
 
 
526 aa  323  3e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3030  FAD dependent oxidoreductase  40.45 
 
 
551 aa  316  8e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.788741  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3290  amine oxidase  38.62 
 
 
545 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  33.64 
 
 
547 aa  293  4e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  33.03 
 
 
564 aa  276  4e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  34.32 
 
 
565 aa  276  5e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  34.14 
 
 
556 aa  266  8e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  33.64 
 
 
561 aa  254  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.839972 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  32.72 
 
 
563 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  32.83 
 
 
555 aa  238  3e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3530  oxidoreductase  33.84 
 
 
531 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0635  FAD dependent oxidoreductase  32.2 
 
 
516 aa  213  7e-54  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.470789 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0226  FAD dependent oxidoreductase  29.87 
 
 
518 aa  211  2e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3174  FAD dependent oxidoreductase  33.46 
 
 
531 aa  212  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.919135 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2838  FAD dependent oxidoreductase  33.78 
 
 
531 aa  206  8e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.430895 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  33.59 
 
 
529 aa  203  6e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1271  amine oxidase  30.1 
 
 
530 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3934  FAD dependent oxidoreductase  30.3 
 
 
549 aa  199  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217875  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  31.62 
 
 
547 aa  199  1.0000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3166  FAD dependent oxidoreductase  31.39 
 
 
539 aa  197  3e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2541  putative phytoene dehydrogenase  33.33 
 
 
530 aa  196  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.553028 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  30.51 
 
 
533 aa  192  8e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  29.29 
 
 
537 aa  191  4e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3854  FAD dependent oxidoreductase  32.58 
 
 
530 aa  187  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  31.46 
 
 
527 aa  182  9.000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3288  FAD dependent oxidoreductase  29.06 
 
 
537 aa  180  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  30.08 
 
 
536 aa  177  6e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3375  FAD dependent oxidoreductase  30.09 
 
 
536 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0710471  hitchhiker  0.0059341 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4029  FAD dependent oxidoreductase  30.26 
 
 
536 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150408  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2014  FAD dependent oxidoreductase  29.81 
 
 
552 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.166375  normal  0.451875 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1696  FAD dependent oxidoreductase  29.52 
 
 
524 aa  172  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209349  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3380  amine oxidase  31.96 
 
 
532 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1063  FAD dependent oxidoreductase  29.59 
 
 
545 aa  171  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.164132  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3444  amine oxidase  31.96 
 
 
532 aa  171  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2365  FAD dependent oxidoreductase  30.75 
 
 
535 aa  171  4e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0283536  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  29.3 
 
 
533 aa  170  6e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2744  FAD dependent oxidoreductase  30.32 
 
 
535 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294261  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3302  FAD dependent oxidoreductase  31.03 
 
 
532 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4444  FAD dependent oxidoreductase  31.48 
 
 
523 aa  162  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  29.46 
 
 
530 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04210  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  29.81 
 
 
527 aa  158  2e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.507647  normal  0.876413 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2949  FAD dependent oxidoreductase  30.29 
 
 
517 aa  158  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4289  FAD dependent oxidoreductase  31.81 
 
 
528 aa  156  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.366851  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3467  FAD dependent oxidoreductase  29.8 
 
 
533 aa  155  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  28.91 
 
 
530 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  28.91 
 
 
530 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  29.92 
 
 
528 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3691  FAD dependent oxidoreductase  31.21 
 
 
481 aa  147  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0128787  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0948  FAD dependent oxidoreductase  28.02 
 
 
536 aa  138  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  29.4 
 
 
523 aa  137  6.0000000000000005e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1935  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 
521 aa  136  7.000000000000001e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.790128  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0947  FAD dependent oxidoreductase  28.87 
 
 
532 aa  135  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1810  phytoene dehydrogenase family protein  25.14 
 
 
499 aa  134  5e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.149228  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1978  FAD dependent oxidoreductase  29.1 
 
 
534 aa  133  7.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413393  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1663  phytoene dehydrogenase, putative  27.8 
 
 
465 aa  132  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.638198  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1834  putative transmembrane protein  30.81 
 
 
535 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47508  normal  0.564682 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1712  phytoene desaturase  27.11 
 
 
504 aa  128  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678565  normal  0.384259 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1758  FAD dependent oxidoreductase  30.18 
 
 
534 aa  127  7e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1954  FAD dependent oxidoreductase  27.96 
 
 
560 aa  125  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1744  FAD dependent oxidoreductase  30.12 
 
 
534 aa  125  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0167987 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2815  FAD dependent oxidoreductase  27.41 
 
 
522 aa  124  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000107827  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  27.51 
 
 
493 aa  124  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5197  phytoene desaturase  28.43 
 
 
525 aa  124  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3691  FAD dependent oxidoreductase  27.47 
 
 
526 aa  123  6e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00372447  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2958  FAD dependent oxidoreductase  29.1 
 
 
474 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0342  FAD dependent oxidoreductase  27.17 
 
 
531 aa  122  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0789  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  28.54 
 
 
470 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5076  FAD dependent oxidoreductase  26.07 
 
 
520 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2416  FAD dependent oxidoreductase  29.62 
 
 
487 aa  120  7e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.28605  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0648  FAD dependent oxidoreductase  28.05 
 
 
531 aa  119  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4505  FAD dependent oxidoreductase  26.4 
 
 
520 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4592  FAD dependent oxidoreductase  26.4 
 
 
520 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353805  normal  0.593862 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1268  FAD dependent oxidoreductase  28.8 
 
 
474 aa  117  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4888  FAD dependent oxidoreductase  26.4 
 
 
520 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.162383 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14190  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  31.02 
 
 
511 aa  117  5e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00208581  normal  0.0106814 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3577  zeta-phytoene desaturase  27.84 
 
 
504 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557125  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  27.75 
 
 
507 aa  114  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1878  FAD dependent oxidoreductase  28.63 
 
 
523 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1677  FAD dependent oxidoreductase  24.52 
 
 
519 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1238  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  28.02 
 
 
472 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.690842  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0965  FAD dependent oxidoreductase  27.95 
 
 
528 aa  113  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19081  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  25.95 
 
 
511 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  25.43 
 
 
492 aa  112  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3180  FAD dependent oxidoreductase  25.8 
 
 
478 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.882146 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2820  phytoene desaturase  27.2 
 
 
498 aa  111  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  27.56 
 
 
545 aa  110  6e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0637  putative dehydrogenase  26.29 
 
 
548 aa  110  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0715988 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1308  carotene isomerase  26.43 
 
 
512 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2254  carotene isomerase  25.83 
 
 
506 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000347702 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1398  FAD dependent oxidoreductase  28.93 
 
 
469 aa  108  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.389386  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4153  putative dehydrogenase  28.29 
 
 
479 aa  108  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>