204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1407 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_1407  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 378 aa  746    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.185064 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2209  permease YjgP/YjgQ family protein  52.91 
 
 		 377 aa  368  1e-101  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.145759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1183  permease YjgP/YjgQ  35.06 
 
 		 381 aa  186  7e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.807963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  25.64 
 
 		 365 aa  103  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  24.33 
 
 		 382 aa  89  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  24.67 
 
 		 389 aa  88.6  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  20.73 
 
 		 364 aa  83.6  0.000000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  23.2 
 
 		 1040 aa  83.2  0.000000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  23.27 
 
 		 434 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3261  permease YjgP/YjgQ family protein  25.52 
 
 		 370 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000653775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1258  permease YjgP/YjgQ family protein  25.77 
 
 		 370 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000016572  hitchhiker  0.000115983 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3108  permease YjgP/YjgQ family protein  25.77 
 
 		 370 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000374217  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3118  permease YjgP/YjgQ family protein  25.54 
 
 		 370 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000110304  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0188  permease YjgP/YjgQ family protein  25.06 
 
 		 360 aa  77.8  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1015  permease YjgP/YjgQ family protein  25.54 
 
 		 370 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000271858  normal  0.473888 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0911  permease YjgP/YjgQ family protein  26.09 
 
 		 371 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000466343  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  23.02 
 
 		 359 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  21.88 
 
 		 388 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  22.69 
 
 		 418 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  33.8 
 
 		 391 aa  73.6  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  23.77 
 
 		 399 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  23.82 
 
 		 358 aa  72.8  0.000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1424  permease YjgP/YjgQ family protein  25.27 
 
 		 360 aa  72.8  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248764  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  31.75 
 
 		 391 aa  72.8  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  23.47 
 
 		 391 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  24.48 
 
 		 362 aa  71.6  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  26.08 
 
 		 370 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000695544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2122  permease YjgP/YjgQ family protein  22.62 
 
 		 393 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2169  permease YjgP/YjgQ family protein  22.62 
 
 		 393 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.330163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1077  permease YjgP/YjgQ family protein  25.26 
 
 		 370 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000191567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  22.36 
 
 		 394 aa  68.9  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  24.32 
 
 		 359 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  25.71 
 
 		 392 aa  68.6  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  24.61 
 
 		 374 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1949  permease, putative  22.64 
 
 		 359 aa  67  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000528059  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1179  permease YjgP/YjgQ family protein  26.67 
 
 		 370 aa  67  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.301073  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  23.08 
 
 		 403 aa  66.6  0.0000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002429  hypothetical protein  24.87 
 
 		 366 aa  65.9  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000155201  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2589  permease YjgP/YjgQ family protein  27.08 
 
 		 379 aa  65.9  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00221006  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1232  permease  23.12 
 
 		 384 aa  65.5  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0437  hypothetical protein  26.92 
 
 		 443 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0796  hypothetical protein  25.06 
 
 		 369 aa  66.2  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.211721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0397  permease YjgP/YjgQ family protein  33.59 
 
 		 354 aa  65.9  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0180892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  22.25 
 
 		 391 aa  65.5  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2908  permease YjgP/YjgQ family protein  26.23 
 
 		 370 aa  65.5  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000409785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0680  permease YjgP/YjgQ family protein  27.3 
 
 		 372 aa  64.7  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.519951  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  22.98 
 
 		 356 aa  65.1  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  28.46 
 
 		 392 aa  64.3  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1695  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 		 361 aa  63.5  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2826  permease YjgP/YjgQ family protein  26.23 
 
 		 370 aa  63.9  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00420336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3005  permease YjgP/YjgQ family protein  26.23 
 
 		 370 aa  63.9  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000818676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0409  permease YjgP/YjgQ family protein  20.17 
 
 		 360 aa  63.2  0.000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1297  permease YjgP/YjgQ family protein  24.56 
 
 		 358 aa  62.4  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0266045  normal  0.200906 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  21.93 
 
 		 391 aa  62.8  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0501  hypothetical protein  19.9 
 
 		 360 aa  61.6  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.183407 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1369  hypothetical protein  25.58 
 
 		 370 aa  62  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0824  permease YjgP/YjgQ family protein  31.25 
 
 		 444 aa  61.6  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00713526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0679  permease YjgP/YjgQ family protein  31.52 
 
 		 350 aa  61.6  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  21.37 
 
 		 395 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  28.57 
 
 		 395 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2678  permease YjgP/YjgQ family protein  35.25 
 
 		 371 aa  61.2  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197081  normal  0.64085 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0309  permease YjgP/YjgQ family protein  20.19 
 
 		 417 aa  60.8  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1425  permease YjgP/YjgQ family protein  24.63 
 
 		 380 aa  61.2  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.308886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08021  putative permease  25.25 
 
 		 395 aa  61.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2100  hypothetical protein  27.11 
 
 		 339 aa  60.8  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0377846  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  32.09 
 
 		 441 aa  60.8  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0560  permease YjgP/YjgQ family protein  27.42 
 
 		 360 aa  60.5  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0147721  hitchhiker  0.00000329056 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  32.28 
 
 		 400 aa  60.5  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  21.39 
 
 		 359 aa  60.5  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1352  permease YjgP/YjgQ family protein  25.4 
 
 		 1153 aa  60.5  0.00000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.929762  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03634  hypothetical protein  24.42 
 
 		 366 aa  60.1  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  22.14 
 
 		 356 aa  60.1  0.00000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16801  putative permease  30 
 
 		 403 aa  60.1  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.636863 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2082  hypothetical protein  24.08 
 
 		 366 aa  60.1  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000432404  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0527  putative permease  24.16 
 
 		 370 aa  58.9  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0167564  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0872  permease YjgP/YjgQ  26.34 
 
 		 370 aa  59.3  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000506114  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0170  putative permease  24.75 
 
 		 395 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.736703  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1948  permease, putative  24.05 
 
 		 397 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00215493  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0054  permease YjgP/YjgQ  31.31 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.520112 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2176  permease YjgP/YjgQ  23.24 
 
 		 402 aa  58.5  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  26.62 
 
 		 442 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  21.34 
 
 		 792 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0517  permease  28.22 
 
 		 367 aa  57.8  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0300348  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0764  permease YjgP/YjgQ family protein  26.63 
 
 		 360 aa  57.4  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.27721 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0925  permease YjgP/YjgQ family protein  25.73 
 
 		 370 aa  57.4  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000914337  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  30.71 
 
 		 401 aa  57.4  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0189  permease YjgP/YjgQ family protein  22.55 
 
 		 423 aa  57  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  normal  0.771409 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  30.71 
 
 		 401 aa  57  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09981  putative permease  27.27 
 
 		 401 aa  57  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0902  permease YjgP/YjgQ family protein  32.59 
 
 		 382 aa  55.8  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0497689 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0046  hypothetical protein  35.9 
 
 		 402 aa  54.7  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0972  YjgP/YjgQ permease  25.43 
 
 		 340 aa  55.1  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.707138  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1747  permease YjgP/YjgQ  30.77 
 
 		 369 aa  55.5  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2943  permease YjgP/YjgQ  28.12 
 
 		 396 aa  55.5  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.263942  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1402  permease YjgP/YjgQ family protein  32.52 
 
 		 370 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.999053 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0318  permease YjgP/YjgQ family protein  23.91 
 
 		 363 aa  54.7  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.341931 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0741  putative permease  29.81 
 
 		 388 aa  53.9  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1374  SecD export membrane protein  28.57 
 
 		 352 aa  53.9  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0976  putative permease, YjgP/YjgQ family  24.5 
 
 		 341 aa  53.9  0.000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0962  permease YjgP/YjgQ family protein  24.85 
 
 		 367 aa  53.9  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.506776  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>