24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1365 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_1365  preprotein translocase, SecG subunit  100 
 
 		 75 aa  144  6e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000203988  hitchhiker  0.000409461 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1142  preprotein translocase subunit SecG  63.24 
 
 		 75 aa  88.2  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0123677  normal  0.266643 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2837  preprotein translocase subunit SecG  40.79 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000321144  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3242  preprotein translocase subunit SecG  40.79 
 
 		 111 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000345429  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3283  preprotein translocase subunit SecG  40.79 
 
 		 111 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000869835  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1125  preprotein translocase subunit SecG  40.79 
 
 		 111 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000669441  unclonable  0.00000000000376809 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3420  preprotein translocase subunit SecG  40.79 
 
 		 111 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000118136  decreased coverage  0.0000944454 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0958  preprotein translocase subunit SecG  38.16 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.117439  normal  0.139091 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2830  preprotein translocase subunit SecG  38.16 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000815505  hitchhiker  0.00315875 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3564  preprotein translocase subunit SecG  38.16 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.202883  hitchhiker  0.00000390785 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1345  preprotein translocase subunit SecG  42.86 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0694845  normal  0.232595 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2957  preprotein translocase subunit SecG  40.58 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000000890053  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3392  preprotein translocase subunit SecG  38.16 
 
 		 115 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000462887  hitchhiker  0.000698491 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2867  preprotein translocase, SecG subunit  38.89 
 
 		 81 aa  42  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000181267  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0448  preprotein translocase subunit SecG  38.67 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3063  preprotein translocase subunit SecG  36.84 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000201334  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03401  preprotein translocase subunit SecG  37.33 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1004  preprotein translocase subunit SecG  36.84 
 
 		 110 aa  40.8  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.03745  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3733  preprotein translocase subunit SecG  36 
 
 		 111 aa  40.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0213713  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3988  preprotein translocase subunit SecG  36 
 
 		 111 aa  40.4  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000109182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3599  preprotein translocase subunit SecG  36 
 
 		 111 aa  40.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000162935  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4923  preprotein translocase subunit SecG  37.68 
 
 		 77 aa  40.4  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.20248  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5245  preprotein translocase subunit SecG  37.68 
 
 		 77 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0707435  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0486  preprotein translocase subunit SecG  37.33 
 
 		 111 aa  40  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.065883  normal  0.270072 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>