More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1280 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_1280  NADH dehydrogenase I, D subunit  100 
 
 		 414 aa  841    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1874  NADH dehydrogenase I, D subunit  85.92 
 
 		 415 aa  725    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.598165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0912  NADH dehydrogenase I, D subunit  65.84 
 
 		 403 aa  540  9.999999999999999e-153  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1046  NADH dehydrogenase I, D subunit  57.54 
 
 		 411 aa  473  1e-132  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3675  NADH dehydrogenase I, D subunit  56.56 
 
 		 417 aa  452  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1321  NADH dehydrogenase I, D subunit  57.07 
 
 		 417 aa  453  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3082  NADH dehydrogenase I, D subunit  53.67 
 
 		 422 aa  446  1.0000000000000001e-124  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1313  NADH dehydrogenase I, D subunit  52.43 
 
 		 401 aa  426  1e-118  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4241  NADH dehydrogenase I, D subunit  51.54 
 
 		 390 aa  422  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0411944  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4007  NADH dehydrogenase I, D subunit  52.81 
 
 		 389 aa  420  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2044e-27 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3135  NADH dehydrogenase I, D subunit  51.28 
 
 		 390 aa  419  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0132145  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3923  NADH dehydrogenase I, D subunit  52.81 
 
 		 389 aa  421  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.587069  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0341  NADH dehydrogenase I, D subunit  50.77 
 
 		 390 aa  412  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0211499  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3352  NADH dehydrogenase I, D subunit  51.28 
 
 		 390 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.131197  normal  0.0118999 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1541  NADH dehydrogenase I, D subunit  51.14 
 
 		 400 aa  403  1e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0270  NADH dehydrogenase subunit D  50.37 
 
 		 440 aa  404  1e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.877752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6679  NADH dehydrogenase subunit D  49.63 
 
 		 483 aa  399  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0284  NADH dehydrogenase I subunit D  49.26 
 
 		 438 aa  395  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6091  NADH dehydrogenase subunit D  49.88 
 
 		 457 aa  390  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.489458  normal  0.0112827 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4555  NADH dehydrogenase I, D subunit  49.38 
 
 		 443 aa  388  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0366  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.8 
 
 		 417 aa  386  1e-106  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4062  NADH dehydrogenase subunit D  47.07 
 
 		 441 aa  387  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.855736  normal  0.069193 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1277  NADH dehydrogenase I, D subunit  48.04 
 
 		 444 aa  385  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.494921  normal  0.687145 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3620  NADH dehydrogenase I, D subunit  49.87 
 
 		 404 aa  386  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.761398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4460  NADH dehydrogenase subunit D  46.83 
 
 		 441 aa  386  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5056  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.79 
 
 		 431 aa  382  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03190  NADH dehydrogenase subunit D  46.36 
 
 		 460 aa  382  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.515319 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0541  NADH dehydrogenase subunit D  48.66 
 
 		 482 aa  383  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.482391  normal  0.20204 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0398  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.81 
 
 		 446 aa  379  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0587  NADH dehydrogenase (quinone)  45.85 
 
 		 441 aa  379  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1152  NADH dehydrogenase I, D subunit  48.51 
 
 		 413 aa  379  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0523  NADH dehydrogenase subunit D  48.16 
 
 		 446 aa  381  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2692  NADH dehydrogenase subunit D  46.47 
 
 		 434 aa  376  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1614  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.3 
 
 		 414 aa  372  1e-102  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7688  NADH dehydrogenase subunit D  46.19 
 
 		 445 aa  372  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.450459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0977  NADH dehydrogenase subunit D  46.55 
 
 		 459 aa  373  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0560  NADH dehydrogenase subunit D  44.22 
 
 		 390 aa  370  1e-101  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3226  NADH dehydrogenase subunit D  47.38 
 
 		 445 aa  371  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00372602 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2058  NADH dehydrogenase subunit D  45.5 
 
 		 417 aa  370  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1882  NADH dehydrogenase subunit D  45.5 
 
 		 442 aa  369  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.303191  normal  0.424323 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1211  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.32 
 
 		 396 aa  366  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1082  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.32 
 
 		 396 aa  366  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.129082 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1016  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.48 
 
 		 396 aa  366  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1601  NADH dehydrogenase subunit D  45.34 
 
 		 446 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0566  NADH dehydrogenase subunit D  46.13 
 
 		 388 aa  365  1e-100  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1173  NADH dehydrogenase subunit D  46.29 
 
 		 412 aa  366  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.313794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1547  NADH dehydrogenase subunit D  45.34 
 
 		 446 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.795023  normal  0.142178 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4415  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.06 
 
 		 449 aa  366  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1577  NADH dehydrogenase subunit D  45.34 
 
 		 446 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2396  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.25 
 
 		 396 aa  366  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.213945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2057  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.32 
 
 		 396 aa  366  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.320233  normal  0.342596 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0483  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.83 
 
 		 426 aa  366  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2627  NADH dehydrogenase subunit D  44.77 
 
 		 417 aa  364  1e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2155  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.36 
 
 		 441 aa  364  1e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2254  NADH dehydrogenase subunit D  44.77 
 
 		 417 aa  364  1e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154911 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1145  NADH dehydrogenase subunit D  44.77 
 
 		 417 aa  364  2e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2833  NADH dehydrogenase subunit D  45.22 
 
 		 416 aa  363  3e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.371933  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3632  NADH dehydrogenase subunit D  43.86 
 
 		 397 aa  363  4e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638594 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1628  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.31 
 
 		 369 aa  362  6e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.963572  normal  0.66391 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5799  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.6 
 
 		 396 aa  362  8e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.143218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0924  NADH dehydrogenase subunit D  46.11 
 
 		 406 aa  362  9e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13169  NADH dehydrogenase subunit D  45.34 
 
 		 440 aa  362  9e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0616  NADH dehydrogenase subunit D  43.15 
 
 		 393 aa  362  9e-99  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0389154  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4129  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.8 
 
 		 396 aa  362  1e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0542  NADH dehydrogenase subunit D  46.45 
 
 		 446 aa  361  1e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.502265  normal  0.442373 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0426  NADH dehydrogenase subunit D  43.15 
 
 		 393 aa  360  2e-98  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1289  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.77 
 
 		 381 aa  360  2e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1025  NADH dehydrogenase subunit D  44.56 
 
 		 396 aa  361  2e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2575  NADH dehydrogenase subunit D  44.53 
 
 		 401 aa  360  3e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0392469  normal  0.134645 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4484  NADH dehydrogenase subunit D  45.5 
 
 		 451 aa  360  4e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00259323 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4560  NADH dehydrogenase subunit D  44.44 
 
 		 398 aa  360  4e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.17714 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1558  NADH dehydrogenase subunit D  44.42 
 
 		 392 aa  359  4e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.970995  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1888  NADH dehydrogenase subunit D  43.8 
 
 		 417 aa  359  4e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2211  NADH dehydrogenase subunit D  43.8 
 
 		 417 aa  359  5e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.518232 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2921  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.48 
 
 		 394 aa  359  5e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5177  NADH dehydrogenase subunit D  45.01 
 
 		 417 aa  359  5e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.752973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0744  NADH dehydrogenase subunit D  45.22 
 
 		 403 aa  359  5e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0891  NADH dehydrogenase subunit D  45.06 
 
 		 396 aa  359  6e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.984899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1715  NADH dehydrogenase subunit D  45.06 
 
 		 396 aa  358  9e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1031  NADH dehydrogenase subunit D  43.55 
 
 		 417 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0235722  normal  0.1717 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1504  NADH dehydrogenase subunit D  43.55 
 
 		 417 aa  358  9.999999999999999e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00434712 
 
 
-
 
NC_002936  DET0926  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, D subunit  48.09 
 
 		 367 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3223  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.68 
 
 		 392 aa  357  1.9999999999999998e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0966966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0206  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  46.49 
 
 		 794 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000609108  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0153  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  44.34 
 
 		 791 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2713  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.82 
 
 		 448 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4393  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.8 
 
 		 396 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0182447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2884  NADH dehydrogenase subunit D  44.19 
 
 		 416 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.736243  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3297  NADH dehydrogenase subunit D  44.96 
 
 		 402 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1745  NADH dehydrogenase subunit D  43.55 
 
 		 417 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3444  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  44.58 
 
 		 792 aa  356  2.9999999999999997e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2059  NADH dehydrogenase subunit D  43.55 
 
 		 417 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.102892  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1346  NADH dehydrogenase subunit D  42.58 
 
 		 417 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00313693  hitchhiker  0.00709586 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5574  NADH dehydrogenase subunit D  43.07 
 
 		 417 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0121919  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1634  NADH dehydrogenase subunit D  43.07 
 
 		 417 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.166476  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2163  NADH dehydrogenase subunit D  42.82 
 
 		 417 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.549103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2246  NADH dehydrogenase subunit D  43.07 
 
 		 417 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105278  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1293  NADH dehydrogenase subunit D  43.07 
 
 		 417 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1094  NADH dehydrogenase subunit D  44.28 
 
 		 417 aa  356  3.9999999999999996e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.402289  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0734  NADH dehydrogenase subunit D  43.07 
 
 		 417 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.301756  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>