More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1161 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_1161  peptidase S41  100 
 
 		 415 aa  826    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.724073  decreased coverage  0.00200018 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0677  peptidase S41  40.52 
 
 		 426 aa  256  6e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1209  peptidase S41  41.63 
 
 		 422 aa  253  6e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000636879  normal  0.518205 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2828  peptidase S41  41.37 
 
 		 434 aa  248  9e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.282259 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0986  peptidase S41  38.32 
 
 		 433 aa  202  9e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.284271  normal  0.172012 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0277  peptidase S41  36.1 
 
 		 447 aa  192  9e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0676  peptidase S41  34.53 
 
 		 405 aa  187  4e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1216  peptidase S41  34.2 
 
 		 438 aa  172  1e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.683381 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2829  peptidase S41  31.52 
 
 		 444 aa  157  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.455505 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1729  carboxyl-terminal protease  32.56 
 
 		 396 aa  104  3e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  27.48 
 
 		 418 aa  102  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0604  carboxyl-terminal protease  27.37 
 
 		 440 aa  96.3  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1589  carboxyl-terminal protease  24.65 
 
 		 458 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1614  carboxyl-terminal protease  24.65 
 
 		 458 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0877  carboxyl-terminal protease  30.05 
 
 		 417 aa  94.7  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  30.23 
 
 		 436 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  30.23 
 
 		 436 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1420  carboxyl-terminal protease  29.55 
 
 		 440 aa  92.4  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  28.37 
 
 		 433 aa  91.7  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2258  carboxyl-terminal protease  31.27 
 
 		 421 aa  91.3  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0647499  unclonable  0.0000000459659 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1138  C-terminal processing peptidase-2  27.09 
 
 		 412 aa  91.3  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00750441 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1251  peptidase S41  31.15 
 
 		 483 aa  90.9  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02002  carboxy-terminal protease  27.46 
 
 		 680 aa  90.9  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.373627  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1268  carboxyl-terminal protease  28.62 
 
 		 423 aa  90.1  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  28.16 
 
 		 446 aa  90.5  6e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1850  peptidase S41A, C-terminal protease  30.42 
 
 		 429 aa  90.1  7e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.333848  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0838  Periplasmic protease-like protein  28.47 
 
 		 452 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0492  peptidase S41A, C-terminal protease  25.23 
 
 		 439 aa  87.8  3e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1509  carboxyl-terminal protease  26.28 
 
 		 496 aa  87.4  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2810  carboxy-terminal protease  27.19 
 
 		 683 aa  87.4  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0215017  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04161  carboxyl-terminal protease  29.32 
 
 		 457 aa  87  5e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.63143 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1480  carboxyl-terminal protease  26.28 
 
 		 496 aa  87.4  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0224  carboxyl-terminal protease  23.57 
 
 		 401 aa  87  5e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000279933  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  30.13 
 
 		 426 aa  87.4  5e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  28.57 
 
 		 423 aa  86.7  7e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03481  carboxyl-terminal protease  27.55 
 
 		 431 aa  86.7  8e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1701  carboxyl-terminal protease  29.01 
 
 		 436 aa  86.3  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4069  carboxyl-terminal protease  34.01 
 
 		 423 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.686351 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  28.41 
 
 		 476 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1993  carboxy-terminal protease  27.65 
 
 		 679 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000930411  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0490  carboxyl-terminal protease  26.2 
 
 		 400 aa  85.9  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0703  carboxyl-terminal protease  28.53 
 
 		 437 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0266  carboxyl-terminal protease  23.92 
 
 		 401 aa  84.7  0.000000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000503976  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2857  peptidase S41  30.94 
 
 		 482 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0704  carboxyl-terminal protease  28.53 
 
 		 437 aa  84  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46670  predicted protein  29.08 
 
 		 476 aa  84  0.000000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0698625  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2406  C-terminal processing peptidase-2  25.54 
 
 		 434 aa  84  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.304858 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0484  carboxyl-terminal protease  26.38 
 
 		 394 aa  84  0.000000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.165712  normal  0.591876 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1823  carboxyl-terminal protease  28.25 
 
 		 556 aa  84  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0958668  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03501  carboxyl-terminal protease  28.05 
 
 		 428 aa  83.2  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2330  C-terminal processing peptidase-2  27.96 
 
 		 407 aa  83.2  0.000000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.436353 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  28.13 
 
 		 439 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03601  carboxyl-terminal protease  28.44 
 
 		 436 aa  83.2  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0227  carboxyl-terminal protease  27.56 
 
 		 550 aa  83.2  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000791174 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1722  carboxyl-terminal protease  27.57 
 
 		 560 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000358148  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  26.44 
 
 		 429 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21861  carboxyl-terminal protease  28.26 
 
 		 446 aa  82.4  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.43703 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0605  carboxyl-terminal protease  25.52 
 
 		 413 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0620  carboxyl-terminal protease  25.52 
 
 		 413 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.210968  normal  0.919859 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03561  carboxyl-terminal protease  25.21 
 
 		 429 aa  82.4  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.748457  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  27.4 
 
 		 443 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0702  hypothetical protein  26.2 
 
 		 434 aa  80.9  0.00000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.240469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0208  carboxyl-terminal protease  26.21 
 
 		 538 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.582164  normal  0.210036 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0516  C-terminal processing peptidase-2  26.26 
 
 		 440 aa  80.9  0.00000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.484387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0669  C-terminal processing peptidase-3  27.59 
 
 		 437 aa  80.9  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  28.88 
 
 		 445 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1705  carboxyl-terminal protease  30.53 
 
 		 413 aa  80.5  0.00000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.880099  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  28.88 
 
 		 445 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3779  carboxyl-terminal protease  27.01 
 
 		 526 aa  80.5  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2119  carboxy-terminal protease  28.04 
 
 		 678 aa  79.7  0.00000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000159277  hitchhiker  0.000525254 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4514  carboxyl-terminal protease  26.65 
 
 		 447 aa  79.7  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000295237  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0043  C-terminal processing peptidase-3  28.62 
 
 		 401 aa  79.7  0.00000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000408883 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1328  C-terminal processing peptidase-1  27.65 
 
 		 694 aa  79.7  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0242336  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0352  putative carboxy-terminal processing protease transmembrane protein  28.03 
 
 		 549 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.77017  normal  0.100187 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  25.43 
 
 		 444 aa  79.3  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0303  peptidase S41A, C-terminal protease  27.83 
 
 		 532 aa  79.7  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.955856  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1363  carboxyl-terminal protease  26.96 
 
 		 688 aa  79  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0104  peptidase S41  29.01 
 
 		 389 aa  79.3  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  25.64 
 
 		 379 aa  79.3  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5403  carboxyl-terminal protease  25.83 
 
 		 705 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0813  peptidase S41A, C-terminal protease  27.95 
 
 		 551 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.338188  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0330  carboxyl-terminal protease  26.63 
 
 		 427 aa  78.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0287  carboxyl-terminal protease  26.32 
 
 		 377 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4724  carboxyl-terminal protease  27.87 
 
 		 463 aa  78.6  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.458117  normal  0.0374379 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0674  C-terminal processing peptidase  26.15 
 
 		 520 aa  78.6  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0041  C-terminal processing peptidase-3  28.62 
 
 		 401 aa  79  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.660161  hitchhiker  0.00325128 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04290  tail-specific protease  26.44 
 
 		 719 aa  78.6  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0049  C-terminal processing peptidase-3  27.99 
 
 		 401 aa  79  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000124234 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3812  peptidase S41  29.01 
 
 		 444 aa  78.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0205907  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2006  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  25.22 
 
 		 434 aa  78.6  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00114653  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2187  carboxy-terminal protease  27.92 
 
 		 664 aa  78.6  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.596133  normal  0.445771 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  25.08 
 
 		 410 aa  78.6  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2591  carboxyl-terminal protease  26.33 
 
 		 448 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.837496  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0304  carboxyl-terminal protease  29.68 
 
 		 498 aa  77.8  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000604667 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0932  S41 family peptidase  26.33 
 
 		 448 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0235658  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0182  carboxyl-terminal protease  24.93 
 
 		 402 aa  77.8  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0641627  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1401  carboxyl-terminal protease  24.48 
 
 		 439 aa  78.2  0.0000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000562456  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0091  carboxyl-terminal protease  25.69 
 
 		 445 aa  77.8  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0132582  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1071  carboxy-terminal protease  26.86 
 
 		 675 aa  77.8  0.0000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.461658  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  28.2 
 
 		 438 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>