More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1072 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1072  cold-shock DNA-binding domain protein  100 
 
 
68 aa  141  4e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000000253624  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2290  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.53 
 
 
68 aa  110  8.000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.388252  hitchhiker  0.00970612 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0662  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  75.76 
 
 
75 aa  102  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000214016  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0440  cold-shock DNA-binding domain protein  67.65 
 
 
68 aa  99.8  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.270892  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0970  cold-shock DNA-binding domain protein  72.31 
 
 
74 aa  99.8  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.251773 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34450  cold-shock DNA-binding protein family  69.7 
 
 
68 aa  97.8  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3141  cold-shock DNA-binding domain protein  71.01 
 
 
67 aa  97.1  7e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0244532  hitchhiker  0.00153434 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1376  cold-shock DNA-binding protein family protein  66.18 
 
 
67 aa  97.1  7e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.128629  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2064  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.59 
 
 
67 aa  96.7  9e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000424325  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0278  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.75 
 
 
65 aa  95.1  3e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000141015  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1580  cold-shock DNA-binding domain protein  69.12 
 
 
67 aa  94.7  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.507056  normal  0.495998 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8123  cold-shock DNA-binding domain protein  68.18 
 
 
67 aa  94.7  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0201  cold shock protein  67.69 
 
 
66 aa  94.4  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000435671  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2880  cold-shock DNA-binding domain protein  70.15 
 
 
68 aa  93.6  8e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000807571  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2426  cold-shock DNA-binding domain protein  68.66 
 
 
67 aa  92  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.386206  normal  0.184038 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0668  cold-shock DNA-binding domain protein  67.65 
 
 
67 aa  92  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.16024  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0310  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 
67 aa  92  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0782  cold-shock DNA-binding domain protein  67.65 
 
 
66 aa  92.4  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6800  cold-shock DNA-binding domain protein  70.15 
 
 
67 aa  92.8  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0268  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 
67 aa  92  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110044 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1006  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.15 
 
 
89 aa  91.7  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.644816  hitchhiker  0.000419725 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0803  cold-shock DNA-binding domain protein  66.67 
 
 
66 aa  91.7  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8911  putative cold-shock DNA-binding domain protein  65.67 
 
 
66 aa  91.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3637  putative cold-shock DNA-binding domain protein  67.65 
 
 
67 aa  91.3  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05396  hypothetical protein  68.25 
 
 
69 aa  90.9  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0560  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 
67 aa  90.5  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0103  cold-shock DNA-binding domain protein  68.66 
 
 
67 aa  90.5  6e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C47  cold-shock DNA-binding protein family protein  58.82 
 
 
66 aa  90.9  6e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1970  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.84 
 
 
69 aa  90.5  6e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00428125  normal  0.0463669 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0982  cold-shock DNA-binding domain protein  69.7 
 
 
83 aa  90.5  7e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000734957  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2017  cold-shock DNA-binding protein family protein  68.75 
 
 
65 aa  90.5  7e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.679038  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4269  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.65 
 
 
67 aa  90.5  7e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0028  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.08 
 
 
66 aa  90.5  7e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000000670362  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1731  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.7 
 
 
69 aa  90.1  8e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000000915529  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6113  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  62.12 
 
 
66 aa  90.1  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0301  cold-shock DNA-binding domain protein  66.67 
 
 
67 aa  89.7  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00253542  normal  0.0688177 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2532  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 
65 aa  89.4  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.19716  normal  0.287944 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0614  cold shock-like protein  67.16 
 
 
69 aa  89.7  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.099487  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1896  cold-shock DNA-binding domain protein  64.71 
 
 
67 aa  89.4  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.385975  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0036  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.69 
 
 
66 aa  89.7  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2485  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 
68 aa  89  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.109641  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3353  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.18 
 
 
67 aa  89.4  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0827794  hitchhiker  0.00618792 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2614  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 
68 aa  89  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0114712 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0979  cold-shock DNA-binding domain protein  63.24 
 
 
67 aa  89.4  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.327909 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1267  cold-shock DNA-binding domain protein  64.71 
 
 
67 aa  88.6  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.922504  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1614  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 
68 aa  89  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.074349  hitchhiker  0.00762568 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3123  cold-shock protein, DNA-binding  66.18 
 
 
67 aa  89.4  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0870951  normal  0.605091 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3299  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.64 
 
 
66 aa  89  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301257  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0472  cold-shock DNA-binding protein family protein  64.71 
 
 
67 aa  88.6  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.16014  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0777  cold-shock DNA-binding protein family protein  68.12 
 
 
67 aa  89  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2052  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 
68 aa  89  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0435864  normal  0.0231014 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1466  cold-shock DNA-binding domain protein  65.22 
 
 
67 aa  89  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00122582  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0218  putative cold-shock DNA-binding domain protein  68.66 
 
 
67 aa  88.6  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.230692  hitchhiker  0.00399283 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0945  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  61.54 
 
 
66 aa  88.6  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000276652  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2129  cold-shock DNA-binding domain protein  68.66 
 
 
69 aa  88.2  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0013  cold-shock DNA-binding domain protein  66.18 
 
 
67 aa  88.6  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2630  cold-shock DNA-binding domain protein  66.67 
 
 
66 aa  88.6  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.681724  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2724  cold-shock DNA-binding domain protein  66.67 
 
 
66 aa  88.6  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.720009  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1235  cold-shock DNA-binding protein family protein  66.67 
 
 
66 aa  88.6  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0923  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  61.54 
 
 
66 aa  88.6  3e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000200134  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0638  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  61.54 
 
 
87 aa  88.2  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.557859  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2963  cold-shock DNA-binding domain protein  69.35 
 
 
65 aa  88.2  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37160  cold-shock DNA-binding protein family  69.12 
 
 
67 aa  88.6  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0943216 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0833  cold-shock protein DNA-binding  61.54 
 
 
66 aa  87.8  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457197  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2727  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  58.82 
 
 
66 aa  87.8  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2784  cold-shock protein DNA-binding  58.82 
 
 
66 aa  87.8  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1092  cold shock DNA-binding domain-containing protein  64.06 
 
 
69 aa  87.8  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000741991  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0817  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  61.54 
 
 
66 aa  87.8  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000123312  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1938  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  60.29 
 
 
66 aa  87.8  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.199562  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1358  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.75 
 
 
70 aa  87.4  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000569017 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001460  cold shock protein CspE  64.06 
 
 
69 aa  87.4  5e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0890  cold-shock DNA-binding domain protein  62.12 
 
 
67 aa  87.8  5e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000324148  normal  0.0824036 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0641  cold-shock DNA-binding domain protein  63.24 
 
 
67 aa  87.8  5e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0644  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.08 
 
 
66 aa  87.4  6e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000253244  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3621  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.62 
 
 
69 aa  87.4  6e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0652324  hitchhiker  0.000182164 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5019  cold shock protein CspD  64.62 
 
 
66 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0351296  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4754  cold shock protein CspD  64.62 
 
 
66 aa  87.4  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000181  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4592  cold shock protein  64.62 
 
 
66 aa  87.4  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000232551  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4614  cold shock protein  64.62 
 
 
66 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000169422  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2197  cold-shock DNA-binding domain protein  67.69 
 
 
66 aa  87.4  6e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000106738  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5115  cold shock protein CspD  64.62 
 
 
66 aa  87.4  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00303936  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4972  cold shock protein CspD  64.62 
 
 
66 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5001  cold shock protein CspD  64.62 
 
 
66 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.219986  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3598  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  61.76 
 
 
66 aa  87.4  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.851035  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0174  cold-shock DNA-binding protein family protein  62.12 
 
 
65 aa  87.4  6e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000215085  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0755  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.08 
 
 
68 aa  87.4  6e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4990  cold shock protein CspD  64.62 
 
 
66 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00510931  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02480  cold-shock DNA-binding protein family  61.76 
 
 
67 aa  87.4  7e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181166  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4023  cold-shock DNA-binding domain protein  63.24 
 
 
67 aa  87  7e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00477592 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2285  cold-shock protein, DNA-binding  65.08 
 
 
69 aa  87  7e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1693  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.08 
 
 
68 aa  87  7e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1572  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.08 
 
 
69 aa  87  8e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.259211  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2787  cold shock domain-contain protein  65.08 
 
 
69 aa  87  8e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1748  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.08 
 
 
69 aa  87  8e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000249775  normal  0.291294 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1705  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.08 
 
 
69 aa  87  8e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000671273  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1257  putative cold shock-like protein  68.75 
 
 
70 aa  87  8e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.143325 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2569  cold-shock DNA-binding protein family protein  65.08 
 
 
69 aa  87  8e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.608616  normal  0.369821 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0392  cold-shock DNA-binding protein family protein  64.06 
 
 
92 aa  87  8e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1775  cold-shock protein, DNA-binding  63.24 
 
 
67 aa  87  8e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2659  cold-shock DNA-binding domain protein  65.08 
 
 
69 aa  87  8e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00019694  hitchhiker  0.00182123 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>