More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1015 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2459  extracellular solute-binding protein family 1  79.86 
 
 		 419 aa  694    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  0.585846 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 418 aa  854    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2348  extracellular solute-binding protein  44.38 
 
 		 363 aa  323  4e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.585172 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  36.72 
 
 		 411 aa  238  2e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  36.46 
 
 		 411 aa  237  3e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  36.27 
 
 		 414 aa  226  5.0000000000000005e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  34.28 
 
 		 411 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 428 aa  216  5e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  35.08 
 
 		 421 aa  191  2e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  31.03 
 
 		 425 aa  188  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2090  extracellular solute-binding protein family 1  35.25 
 
 		 423 aa  187  2e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000307561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  29.88 
 
 		 437 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  30.73 
 
 		 413 aa  184  2.0000000000000003e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20870  extracellular solute-binding protein family 1  30.99 
 
 		 430 aa  182  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3146  extracellular solute-binding protein family 1  33.68 
 
 		 439 aa  179  8e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.654082  normal  0.268339 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3329  extracellular solute-binding protein  33.52 
 
 		 423 aa  176  6e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2940  extracellular solute-binding protein  29.81 
 
 		 421 aa  167  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459152  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2526  extracellular solute-binding protein  31.11 
 
 		 421 aa  166  5.9999999999999996e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  31.68 
 
 		 423 aa  166  9e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0304  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  32.78 
 
 		 421 aa  166  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  30.3 
 
 		 439 aa  158  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0025  extracellular solute-binding protein  30.73 
 
 		 422 aa  157  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669897  normal  0.473652 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1697  extracellular solute-binding protein  31.78 
 
 		 447 aa  150  5e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00303465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2237  extracellular solute-binding protein family 1  30.22 
 
 		 466 aa  150  6e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0258  extracellular solute-binding protein  31.34 
 
 		 419 aa  149  8e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  30.65 
 
 		 446 aa  149  8e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4442  extracellular solute-binding protein  30.19 
 
 		 425 aa  148  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00539632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  30.66 
 
 		 455 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  28.68 
 
 		 464 aa  146  7.0000000000000006e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0397  extracellular solute-binding protein family 1  30.96 
 
 		 522 aa  144  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  26.3 
 
 		 440 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  28.19 
 
 		 419 aa  143  7e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  30.33 
 
 		 436 aa  142  9e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0413  extracellular solute-binding protein  27.2 
 
 		 428 aa  137  4e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3687  extracellular solute-binding protein  28.01 
 
 		 453 aa  137  4e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0762  extracellular solute-binding protein  27.82 
 
 		 424 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000277245  normal  0.855778 
 
 
 
NC_004578  PSPTO_0889  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  28.81 
 
 		 424 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  28.53 
 
 		 412 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1626  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  27.44 
 
 		 418 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2797  extracellular solute-binding protein family 1  27.46 
 
 		 426 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 412 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1408  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  28.27 
 
 		 421 aa  129  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.590186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  28.04 
 
 		 412 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4395  extracellular solute-binding protein  30.28 
 
 		 420 aa  126  7e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.87283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0138  extracellular solute-binding protein  24.55 
 
 		 412 aa  122  9.999999999999999e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0623  extracellular solute-binding protein family 1  26.09 
 
 		 428 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.58509 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4015  extracellular solute-binding protein family 1  25.51 
 
 		 434 aa  119  7.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15281  ABC transporter for sugars, solute-binding protein  27.07 
 
 		 422 aa  116  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0282  extracellular solute-binding protein  28.37 
 
 		 423 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5508  extracellular solute-binding protein  28.08 
 
 		 412 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3592  extracellular solute-binding protein  28.08 
 
 		 439 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4775  extracellular solute-binding protein  28.08 
 
 		 439 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0950  putative multiple sugar transport system substrate-binding protein  23.59 
 
 		 438 aa  109  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4158  extracellular solute-binding protein  28.08 
 
 		 446 aa  109  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.214678  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0939  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  27.76 
 
 		 496 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3355  extracellular solute-binding protein family 1  27.45 
 
 		 436 aa  108  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  23.77 
 
 		 415 aa  108  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4682  extracellular solute-binding protein  27.44 
 
 		 412 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  29.75 
 
 		 415 aa  105  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15040  extracellular solute-binding protein family 1  25.67 
 
 		 458 aa  103  5e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.751229  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  24.74 
 
 		 431 aa  103  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  26.23 
 
 		 431 aa  103  8e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  26.54 
 
 		 419 aa  101  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  24.16 
 
 		 411 aa  101  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1078  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  22.5 
 
 		 433 aa  99.4  1e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3777  extracellular solute-binding protein  27.65 
 
 		 436 aa  98.2  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.253936  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4617  extracellular solute-binding protein  26.53 
 
 		 433 aa  95.1  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0699008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0807  extracellular solute-binding protein family 1  24.86 
 
 		 420 aa  94.4  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4116  extracellular solute-binding protein  25.27 
 
 		 447 aa  92  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000719407  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3567  ABC transporter substrate binding protein (sorbitol)  27.2 
 
 		 439 aa  90.5  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3144  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  24.31 
 
 		 460 aa  90.5  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23010  extracellular solute-binding protein family 1  22.57 
 
 		 436 aa  90.1  6e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000978171  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1262  extracellular solute-binding protein  23.77 
 
 		 424 aa  90.1  7e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00529057  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4090  twin-arginine translocation pathway signal  26.77 
 
 		 440 aa  87.8  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.25614 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1492  extracellular solute-binding protein  23.45 
 
 		 421 aa  88.2  3e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2058  extracellular solute-binding protein family 1  27.01 
 
 		 435 aa  87.8  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.617385 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0904  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  23.27 
 
 		 439 aa  87.4  4e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00221898  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  22.64 
 
 		 399 aa  87.4  4e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2358  extracellular solute-binding protein  25.43 
 
 		 441 aa  87  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  26.1 
 
 		 442 aa  86.7  7e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4125  extracellular solute-binding protein  26.62 
 
 		 408 aa  86.7  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0385  extracellular solute-binding protein family 1  28.65 
 
 		 410 aa  85.9  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  24.93 
 
 		 427 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  27.01 
 
 		 443 aa  85.5  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0091  ABC sorbitol/mannitol transporter, periplasmic binding protein  25.39 
 
 		 436 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.126585  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  25.98 
 
 		 410 aa  85.1  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1727  extracellular solute-binding protein  25.39 
 
 		 436 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  25.98 
 
 		 410 aa  85.1  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.63 
 
 		 407 aa  84.7  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2753  extracellular solute-binding protein family 1  28.19 
 
 		 410 aa  84  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.501272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2082  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  23.13 
 
 		 422 aa  84  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.890991  normal  0.0137332 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3752  extracellular solute-binding protein family 1  26.63 
 
 		 436 aa  83.6  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2172  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  23.13 
 
 		 422 aa  83.2  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00849198  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0633  extracellular solute-binding protein  24.6 
 
 		 436 aa  83.2  0.000000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  23.95 
 
 		 504 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2622  extracellular solute-binding protein family 1  25.87 
 
 		 437 aa  82.4  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0574924  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3450  extracellular solute-binding protein family 1  26.35 
 
 		 436 aa  82.8  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  25.34 
 
 		 446 aa  82.4  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0487  extracellular solute-binding protein family 1  24.76 
 
 		 433 aa  82  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1041  extracellular solute-binding protein family 1  24.1 
 
 		 416 aa  81.6  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172945  normal  0.776305 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>