164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0947 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_0947  ribosomal protein S20  100 
 
 		 97 aa  182  9e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.351712 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0847  30S ribosomal protein S20  75.53 
 
 		 97 aa  136  7e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1432  30S ribosomal protein S20  72.37 
 
 		 95 aa  95.5  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.195476 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0238  30S ribosomal protein S20  44.16 
 
 		 85 aa  64.3  0.0000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00017388  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2436  ribosomal protein S20  43.04 
 
 		 88 aa  59.3  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000012228  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1267  30S ribosomal protein S20  42.68 
 
 		 87 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.771067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0126  30S ribosomal protein S20  47.06 
 
 		 95 aa  57.8  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000563837  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3424  SSU ribosomal protein S20P  42.86 
 
 		 92 aa  57.4  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1106  30S ribosomal protein S20  44.05 
 
 		 93 aa  57  0.00000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00644283  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1685  30S ribosomal protein S20  41.98 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.462249  normal  0.0272644 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12880  ribosomal protein S20  43.21 
 
 		 87 aa  54.7  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.40535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1416  30S ribosomal protein S20  44.44 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.719270000000001e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3922  30S ribosomal protein S20  42.68 
 
 		 88 aa  53.5  0.0000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1005  30S ribosomal protein S20  45.68 
 
 		 89 aa  53.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16671  30S ribosomal protein S20  40.43 
 
 		 97 aa  52.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0292  30S ribosomal protein S20  41.98 
 
 		 87 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161586 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2031  30S ribosomal protein S20  41.98 
 
 		 87 aa  51.6  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0513769  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0849  SSU ribosomal protein S20P  37.8 
 
 		 88 aa  51.6  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2108  30S ribosomal protein S20  43.21 
 
 		 87 aa  51.2  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000204078  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2281  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 90 aa  50.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218498  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  41.46 
 
 		 89 aa  50.8  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000240091  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1145  30S ribosomal protein S20  43.06 
 
 		 95 aa  50.8  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.576615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0795  30S ribosomal protein S20  43.04 
 
 		 85 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.111102  hitchhiker  0.0000000000117943 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0994  30S ribosomal protein S20  40.74 
 
 		 86 aa  50.4  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.945897  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3465  30S ribosomal protein S20  40.74 
 
 		 88 aa  50.8  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3049  30S ribosomal protein S20  43.04 
 
 		 85 aa  50.8  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287118  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3844  30S ribosomal protein S20  40.74 
 
 		 88 aa  50.4  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160691  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1013  30S ribosomal protein S20  41.33 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000773203  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4403  30S ribosomal protein S20  41.77 
 
 		 85 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4221  30S ribosomal protein S20  41.77 
 
 		 85 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000214767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4059  30S ribosomal protein S20  41.77 
 
 		 85 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.2501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4069  30S ribosomal protein S20  41.77 
 
 		 85 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00157919  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4547  30S ribosomal protein S20  41.77 
 
 		 85 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4441  30S ribosomal protein S20  41.77 
 
 		 85 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000591712  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1056  30S ribosomal protein S20  39.19 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.134446  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4344  30S ribosomal protein S20  41.77 
 
 		 85 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000153456 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0856  ribosomal protein S20  42.31 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.819382  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4455  30S ribosomal protein S20  41.77 
 
 		 85 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115322  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0306  ribosomal protein S20  43.21 
 
 		 84 aa  48.5  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000000167926  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2893  30S ribosomal protein S20  37.84 
 
 		 88 aa  48.1  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.204979  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1295  ribosomal protein S20  36.47 
 
 		 89 aa  48.5  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.312929  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4233  ribosomal protein S20  42.31 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000543427  hitchhiker  0.000000915309 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1179  ribosomal protein S20  41.25 
 
 		 86 aa  48.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01050  30S ribosomal protein S20  40.74 
 
 		 82 aa  47.8  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0921  30S ribosomal protein S20  37.84 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000253205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1191  30S ribosomal protein S20  39.19 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000303326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4173  30S ribosomal protein S20  40.51 
 
 		 85 aa  47.8  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0124088  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0669  30S ribosomal protein S20  39.76 
 
 		 100 aa  47.8  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2972  30S ribosomal protein S20  46.34 
 
 		 94 aa  47.4  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1755  30S ribosomal protein S20  39.51 
 
 		 91 aa  47.4  0.00007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00299182  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3537  30S ribosomal protein S20  36.59 
 
 		 88 aa  47  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2087  30S ribosomal protein S20  38.27 
 
 		 86 aa  47  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701536  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2181  30S ribosomal protein S20  38.14 
 
 		 97 aa  47  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.752642  normal  0.564535 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1710  30S ribosomal protein S20  44.16 
 
 		 89 aa  47  0.00009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000312483  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4855  30S ribosomal protein S20  39.02 
 
 		 90 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3238  30S ribosomal protein S20  37.84 
 
 		 88 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000254037  normal  0.534831 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2960  30S ribosomal protein S20  39.19 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000020022  normal  0.711019 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3042  30S ribosomal protein S20  39.19 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000711095  normal  0.679659 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60400  30S ribosomal protein S20  37.65 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503412 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3140  30S ribosomal protein S20  39.19 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000322066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1051  30S ribosomal protein S20  37.84 
 
 		 88 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000204572  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16781  30S ribosomal protein S20  38.3 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.833107  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1118  30S ribosomal protein S20  37.84 
 
 		 88 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000408096  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1152  30S ribosomal protein S20  37.84 
 
 		 88 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000294185  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0001  30S ribosomal protein S20  41.98 
 
 		 88 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5467  30S ribosomal protein S20  38.27 
 
 		 88 aa  45.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0585  30S ribosomal protein S20  38.27 
 
 		 87 aa  45.4  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000109999  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  37.04 
 
 		 88 aa  45.4  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1096  30S ribosomal protein S20  37.84 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000700681  normal  0.0325702 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0600  30S ribosomal protein S20  36.36 
 
 		 92 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218047  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0802  ribosomal protein S20  36.36 
 
 		 92 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0707  30S ribosomal protein S20  36.36 
 
 		 92 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0827  SSU ribosomal protein S20P  38.1 
 
 		 92 aa  45.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352915  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0478  SSU ribosomal protein S20P  35 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.075192  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1667  30S ribosomal protein S20  37.04 
 
 		 88 aa  45.4  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00940932  normal  0.076211 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1039  ribosomal protein S20  43.04 
 
 		 115 aa  45.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000562255  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0001  30S ribosomal protein S20  42.31 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0641  30S ribosomal protein S20  36.36 
 
 		 92 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647122  normal  0.196215 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0646  30S ribosomal protein S20  36.36 
 
 		 92 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571699 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4562  30S ribosomal protein S20  36.36 
 
 		 92 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.251807  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2689  30S ribosomal protein S20  39.19 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2561  30S ribosomal protein S20  39.19 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1774  30S ribosomal protein S20  40.74 
 
 		 87 aa  45.1  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058734  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0917  30S ribosomal protein S20  35.8 
 
 		 89 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0196  ribosomal protein S20  39.33 
 
 		 91 aa  44.7  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4890  30S ribosomal protein S20  42.31 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.540354  normal  0.302297 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0001  30S ribosomal protein S20  42.31 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.714217 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3551  30S ribosomal protein S20  35.71 
 
 		 89 aa  44.3  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1846  30S ribosomal protein S20  40.26 
 
 		 91 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16911  30S ribosomal protein S20  36.17 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0739  30S ribosomal protein S20  38.46 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2188  30S ribosomal protein S20  40.26 
 
 		 91 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0220995  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2427  30S ribosomal protein S20  38.55 
 
 		 100 aa  43.9  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3000  30S ribosomal protein S20  38.55 
 
 		 100 aa  43.9  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.468809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2909  30S ribosomal protein S20  44.59 
 
 		 91 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40720  30S ribosomal protein S20  36.47 
 
 		 91 aa  43.9  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2005  ribosomal protein S20  43.06 
 
 		 95 aa  43.9  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.894621  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0546  30S ribosomal protein S20  35.8 
 
 		 87 aa  43.9  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2817  30S ribosomal protein S20  44.59 
 
 		 91 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2211  30S ribosomal protein S20  36.25 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.829407  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>