More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0855 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_0855  folate-binding protein YgfZ  100 
 
 		 339 aa  676    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.22028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0748  folate-binding protein YgfZ  56.12 
 
 		 325 aa  358  8e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.485087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2127  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  41.16 
 
 		 298 aa  157  3e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0061  folate-binding protein YgfZ  31.64 
 
 		 356 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000369449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0063  folate-binding protein YgfZ  31.64 
 
 		 356 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4696  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.23 
 
 		 349 aa  119  9e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.77868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1989  folate-binding protein YgfZ  30.07 
 
 		 354 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.36576 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2628  glycine cleavage T protein, aminomethyl transferase  27.16 
 
 		 342 aa  116  6e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.509615  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2871  folate-binding protein YgfZ  29.11 
 
 		 326 aa  114  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3708  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  32.18 
 
 		 324 aa  113  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0106413 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4173  folate-binding protein YgfZ  31.25 
 
 		 336 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3533  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  33.12 
 
 		 337 aa  110  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1651  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.25 
 
 		 327 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.411538 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0266  folate-binding protein YgfZ  27.12 
 
 		 362 aa  108  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0098053 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2547  folate-binding protein YgfZ  29.68 
 
 		 325 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5037  folate-binding protein YgfZ  29.97 
 
 		 369 aa  100  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6837  folate-binding protein YgfZ  30.89 
 
 		 364 aa  100  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37750  folate-binding protein YgfZ  27.89 
 
 		 376 aa  97.4  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.356305 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3469  folate-binding protein YgfZ  28.26 
 
 		 375 aa  95.9  9e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  29.85 
 
 		 799 aa  93.6  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1391  folate-binding protein YgfZ  28.94 
 
 		 321 aa  93.6  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1112  folate-binding protein YgfZ  28.94 
 
 		 321 aa  93.6  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0376  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.75 
 
 		 369 aa  92.8  8e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5709  folate-binding protein YgfZ  30 
 
 		 344 aa  92  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2848  LigA  31.12 
 
 		 304 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2780  glycine cleavage T-protein barrel  30.58 
 
 		 316 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.369075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1254  folate-binding protein YgfZ  31.21 
 
 		 322 aa  91.7  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0313  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.75 
 
 		 369 aa  90.1  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0332  folate-binding protein YgfZ  29.25 
 
 		 386 aa  89  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.97102  normal  0.0439096 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4919  glycine cleavage T-protein, C-terminal barrel  31.17 
 
 		 356 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2474  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.27 
 
 		 347 aa  87.4  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.839994  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3032  folate-binding protein YgfZ  31.23 
 
 		 304 aa  87.4  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.156046  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2938  folate-binding protein YgfZ  30.88 
 
 		 304 aa  87.4  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.428228  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10826  hypothetical protein  30.82 
 
 		 368 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0841313 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2873  hypothetical protein  29.43 
 
 		 343 aa  86.7  6e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  27.09 
 
 		 371 aa  86.7  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4388  folate-binding protein YgfZ  33.1 
 
 		 313 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.410002  normal  0.740627 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0976  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.48 
 
 		 430 aa  85.9  9e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3086  folate-binding protein YgfZ  28.61 
 
 		 399 aa  85.5  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150861 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3415  folate-binding protein YgfZ  31.27 
 
 		 396 aa  85.1  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2868  glycine cleavage system T protein  28.33 
 
 		 361 aa  85.1  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4536  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.84 
 
 		 356 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.935602  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4623  glycine cleavage T-protein, C-terminal barrel  30.84 
 
 		 356 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1063  hypothetical protein  31.56 
 
 		 313 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1638  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.22 
 
 		 367 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.246382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1464  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  24.6 
 
 		 354 aa  83.6  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.24907  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2199  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.07 
 
 		 339 aa  82.8  0.000000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0720  glycine cleavage system T protein  26.69 
 
 		 364 aa  82.8  0.000000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0713  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.81 
 
 		 364 aa  82.8  0.000000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1501  folate-binding protein YgfZ  26.55 
 
 		 384 aa  81.6  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.119461  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1885  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.58 
 
 		 363 aa  80.9  0.00000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3008  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.74 
 
 		 361 aa  80.5  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6459  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0884  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.35 
 
 		 360 aa  80.1  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.233435  hitchhiker  0.00165742 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0737  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.6 
 
 		 364 aa  80.1  0.00000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1423  hypothetical protein  32.4 
 
 		 313 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0919  LigA  27.22 
 
 		 328 aa  79.7  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6150  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.07 
 
 		 409 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.274671  normal  0.61333 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0444  folate-binding protein YgfZ  27.42 
 
 		 389 aa  79  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.401201 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3450  glycine cleavage T-protein barrel  28.48 
 
 		 327 aa  79  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0834766  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2719  folate-binding protein YgfZ  28.34 
 
 		 361 aa  77.8  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239345 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.08 
 
 		 369 aa  78.2  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4298  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  32.81 
 
 		 313 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0480  folate-binding protein YgfZ  28.4 
 
 		 352 aa  77.4  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.339791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3692  folate-binding protein YgfZ  24.5 
 
 		 267 aa  77  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0180331  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04980  folate-binding protein YgfZ  27.6 
 
 		 369 aa  76.6  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5109  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.27 
 
 		 361 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.80079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3735  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.06 
 
 		 328 aa  75.9  0.0000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0261257 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0505  folate-binding protein YgfZ  30.74 
 
 		 277 aa  75.5  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.262303  normal  0.803186 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3028  folate-binding protein YgfZ  28.41 
 
 		 379 aa  75.5  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0655  folate-binding protein YgfZ  27.8 
 
 		 328 aa  75.1  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1354  glycine cleavage system T protein  22.29 
 
 		 371 aa  75.1  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.91248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1800  glycine cleavage system T protein  27.53 
 
 		 367 aa  74.3  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  28.65 
 
 		 371 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2037  glycine cleavage system T protein  27.61 
 
 		 375 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3572  folate-binding protein YgfZ  26.23 
 
 		 349 aa  73.2  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0682209  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0557  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.54 
 
 		 320 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.15 
 
 		 368 aa  72.8  0.000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1804  glycine cleavage system T protein  27.27 
 
 		 375 aa  72.8  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4342  folate-binding protein YgfZ  28.62 
 
 		 340 aa  72.4  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.964763  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0217  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.57 
 
 		 340 aa  72.4  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1627  glycine cleavage system T protein  24.51 
 
 		 357 aa  71.2  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0837  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.81 
 
 		 320 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0259  hypothetical protein  26.12 
 
 		 265 aa  71.6  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2956  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.3 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1830  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.89 
 
 		 348 aa  71.2  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0173  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.8 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1515  glycine cleavage system T protein  25.49 
 
 		 356 aa  71.6  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00269982  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3140  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.46 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2041  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.25 
 
 		 381 aa  70.5  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.044839 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1912  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.65 
 
 		 441 aa  70.1  0.00000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000389017  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1085  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.07 
 
 		 309 aa  70.1  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000414438  hitchhiker  0.0000000121971 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1945  aminomethyltransferase  28.07 
 
 		 366 aa  70.1  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000285507 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0860  folate-binding protein YgfZ  26.56 
 
 		 320 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  25.14 
 
 		 357 aa  70.1  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0952  folate-binding protein YgfZ  26.44 
 
 		 389 aa  70.1  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3503  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.38 
 
 		 320 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1737  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.87 
 
 		 348 aa  69.3  0.00000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00179211  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2005  glycine cleavage system T protein  27.99 
 
 		 350 aa  69.7  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2950  hypothetical protein  27.78 
 
 		 321 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.128339 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2098  glycine cleavage T-protein (aminomethyl transferase)  27.01 
 
 		 354 aa  68.6  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.438328  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>