42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0733 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_0733  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  271  3e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.59707  decreased coverage  0.00107456 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2823  putative tricarboxylic transport membrane protein  62.94 
 
 		 143 aa  129  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0616705 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1454  putative tricarboxylic transport membrane protein  43.17 
 
 		 151 aa  100  5e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1800  hypothetical protein  34.85 
 
 		 146 aa  89  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.490656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0725  putative tricarboxylic transport membrane protein  42.03 
 
 		 149 aa  83.6  9e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4434  putative tricarboxylic transport membrane protein  31.47 
 
 		 146 aa  82.8  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0903  putative tricarboxylic transport membrane protein  34.27 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.530268  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3855  putative tricarboxylic transport membrane protein  39.13 
 
 		 150 aa  74.7  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.760581  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4233  membrane protein TctB, putative  35.66 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3967  membrane protein TctB, putative  35.21 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.605379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54550  hypothetical protein  34.03 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000543729  normal  0.0724401 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4767  hypothetical protein  34.69 
 
 		 156 aa  67  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.433731  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2896  putative tricarboxylic transport membrane protein  41.3 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1362  tricarboxylic transport  33.81 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3086  tricarboxylic transport  34.53 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2983  tricarboxylic transport  34.53 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.545092 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2966  tricarboxylic transport  34.53 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00298616 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2899  tricarboxylic transport  34.53 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4304  hypothetical protein  34.27 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.836999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0155  TctB protein  35.25 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2931  tricarboxylic transport  33.81 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.331411  normal  0.167192 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2582  hypothetical protein  33.81 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.909963  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1456  hypothetical protein  33.61 
 
 		 147 aa  57  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1637  TctB protein  29.66 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3785  putative tricarboxylic transport membrane protein  31.62 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1352  membrane protein TctB, putative  30.58 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49470  tripartite tricarboxylate transporter small hypothetical protein  33.59 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0240129  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3441  hypothetical protein  34.62 
 
 		 163 aa  48.9  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00151639  normal  0.878549 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1417  tricarboxylate transport protein TctB, putative  33.06 
 
 		 161 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.342625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8067  hypothetical protein  29.33 
 
 		 178 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3298  integral membrane protein  30.82 
 
 		 168 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.172548  normal  0.0280313 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3236  integral membrane protein  30.82 
 
 		 168 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.687326  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1826  membrane protein TctB, putative  29.91 
 
 		 167 aa  45.1  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4394  tricarboxylate transport protein TctB  31.4 
 
 		 152 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837927 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3247  integral membrane protein  30.19 
 
 		 168 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.461302  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2222  putative tricarboxylic transporter, TctB (4TM)subunit  29.41 
 
 		 172 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0953872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3343  tricarboxylic transport  30.22 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.363295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1057  tricarboxylate transport protein TctB  32.23 
 
 		 152 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2071  hypothetical protein  31.33 
 
 		 183 aa  42  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.953764  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4540  hypothetical protein  33.06 
 
 		 156 aa  41.6  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1643  hypothetical protein  31.33 
 
 		 183 aa  41.2  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0922744  normal  0.0412546 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3135  hypothetical protein  35.54 
 
 		 173 aa  40.8  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.675068  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>