More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0697 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0697  xylulokinase  100 
 
 
499 aa  959    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0014259 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2691  xylulokinase  62.66 
 
 
501 aa  531  1e-149  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0703  xylulokinase  64.41 
 
 
487 aa  521  1e-147  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.872008  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  48.35 
 
 
496 aa  433  1e-120  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  51.43 
 
 
511 aa  417  9.999999999999999e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  48.07 
 
 
498 aa  411  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  41.32 
 
 
500 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  44.89 
 
 
518 aa  394  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  47.7 
 
 
504 aa  385  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  46.67 
 
 
509 aa  380  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  47.77 
 
 
506 aa  379  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  43.46 
 
 
511 aa  380  1e-104  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  38.34 
 
 
500 aa  377  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  41.41 
 
 
501 aa  372  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  46.19 
 
 
499 aa  370  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  44.84 
 
 
512 aa  369  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  38.81 
 
 
489 aa  364  2e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  43.44 
 
 
515 aa  363  4e-99  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  41.12 
 
 
502 aa  361  2e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  39.45 
 
 
509 aa  360  3e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  40.12 
 
 
499 aa  355  1e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  37.02 
 
 
492 aa  352  7e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  37.02 
 
 
492 aa  352  7e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  39.51 
 
 
488 aa  351  2e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  42.26 
 
 
505 aa  330  3e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  35.15 
 
 
490 aa  320  3.9999999999999996e-86  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  45.99 
 
 
496 aa  318  9e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  34.02 
 
 
496 aa  312  7.999999999999999e-84  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0131  xylulokinase  36.62 
 
 
503 aa  312  9e-84  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.435122  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  42.79 
 
 
511 aa  310  2.9999999999999997e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  41.31 
 
 
517 aa  307  2.0000000000000002e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2691  carbohydrate kinase  41.31 
 
 
517 aa  307  3e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  40.37 
 
 
484 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3833  xylulokinase  39.92 
 
 
489 aa  304  3.0000000000000004e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.967873  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0497  xylulokinase  43.11 
 
 
494 aa  301  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71509  normal  0.01013 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  34.93 
 
 
509 aa  301  2e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0548  xylulokinase  40.7 
 
 
483 aa  300  3e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.560227  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0550  xylulokinase  40.7 
 
 
483 aa  300  3e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  43.6 
 
 
493 aa  300  4e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  42.98 
 
 
491 aa  298  1e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  43.18 
 
 
493 aa  299  1e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2791  xylulokinase  40.97 
 
 
484 aa  298  2e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.504033  normal  0.565277 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  43.08 
 
 
493 aa  296  7e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0097  xylulokinase  44.34 
 
 
483 aa  296  7e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  42.86 
 
 
493 aa  295  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2616  xylulokinase  42.36 
 
 
478 aa  295  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.252562 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0224  xylulokinase  39.47 
 
 
483 aa  295  1e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  43.08 
 
 
493 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  43.08 
 
 
493 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2162  xylulokinase  44.5 
 
 
485 aa  294  2e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  43.6 
 
 
481 aa  293  4e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0343  xylulokinase  43.4 
 
 
490 aa  292  8e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0642  xylulokinase  43.4 
 
 
490 aa  292  8e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.333334  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2477  xylulokinase  43.4 
 
 
490 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0090  xylulokinase  43.4 
 
 
490 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0452597  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6333  xylulokinase  45.95 
 
 
492 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1088  xylulokinase  39.88 
 
 
495 aa  291  1e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000712825 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1046  xylulokinase  43.62 
 
 
493 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0055  xylulokinase  40.86 
 
 
484 aa  291  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0887  xylulokinase  43.62 
 
 
493 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0884  xylulokinase  43.62 
 
 
493 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103144  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1997  xylose kinase  42.48 
 
 
480 aa  290  3e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0574625  normal  0.349837 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  42.7 
 
 
493 aa  290  4e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  42.95 
 
 
493 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3412  xylulokinase  39.31 
 
 
484 aa  289  6e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.636398  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2515  xylulokinase  42.39 
 
 
472 aa  289  7e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.898924  normal  0.571015 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6033  xylulokinase  46.38 
 
 
492 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal  0.638126 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1117  xylulokinase  41.85 
 
 
491 aa  288  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1177  xylulose kinase  44.82 
 
 
478 aa  289  1e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3412  xylulokinase  40.04 
 
 
485 aa  288  2e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4162  xylulose kinase  43.12 
 
 
484 aa  287  2.9999999999999996e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618416  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3710  xylulokinase  38.71 
 
 
484 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.917033  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1868  xylulokinase  39.14 
 
 
482 aa  287  2.9999999999999996e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.933233  normal  0.588405 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2464  xylulokinase  42.24 
 
 
484 aa  287  4e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.542449 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4103  xylulokinase  42.89 
 
 
484 aa  287  4e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0729  xylulokinase  43.18 
 
 
493 aa  286  4e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2839  xylulokinase  44.14 
 
 
478 aa  286  7e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.241247  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0588  xylulokinase (xylulose kinase)  38.23 
 
 
486 aa  285  1.0000000000000001e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0702  xylulokinase  40.7 
 
 
493 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0059  xylulokinase  40.7 
 
 
486 aa  283  5.000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0150  xylulokinase  40.46 
 
 
484 aa  283  6.000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3725  xylulokinase  37.93 
 
 
492 aa  283  7.000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03416  xylulokinase  40.29 
 
 
484 aa  281  2e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0146  xylulokinase  40.29 
 
 
484 aa  281  2e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6328  xylulokinase  42.48 
 
 
492 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3767  xylulokinase  40.29 
 
 
484 aa  281  2e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4940  xylulokinase  40.5 
 
 
484 aa  281  2e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0856501 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03367  hypothetical protein  40.29 
 
 
484 aa  281  2e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4156  xylulokinase  43.95 
 
 
485 aa  280  3e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6505  xylulokinase  42.41 
 
 
492 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6739  xylulokinase  42.41 
 
 
492 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0801458  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4060  xylulokinase  40.25 
 
 
484 aa  280  3e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3887  xylulokinase  40.08 
 
 
484 aa  279  7e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4544  xylulokinase  46.31 
 
 
508 aa  278  2e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0028  xylulokinase  41.71 
 
 
483 aa  277  3e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.237536  normal  0.287388 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1732  xylulose kinase  37.9 
 
 
494 aa  277  4e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0237  xylulokinase  41.35 
 
 
486 aa  276  6e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0077  xylulokinase  40.2 
 
 
486 aa  276  7e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6659  xylulokinase  39.62 
 
 
486 aa  276  8e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4438  xylulokinase  42.83 
 
 
485 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>