More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0644 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0644  Trans-aconitate 2-methyltransferase  100 
 
 
253 aa  514  1e-145  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.069805 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3059  Trans-aconitate 2-methyltransferase  49.41 
 
 
255 aa  245  4e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000652441 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1351  Trans-aconitate 2-methyltransferase  50.2 
 
 
254 aa  244  1e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0825265 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4335  trans-aconitate 2-methyltransferase  46.15 
 
 
254 aa  210  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0474  trans-aconitate 2-methyltransferase  49.41 
 
 
277 aa  205  7e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.901578 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6020  Trans-aconitate 2-methyltransferase  40.48 
 
 
252 aa  201  9e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3939  trans-aconitate 2-methyltransferase  41.73 
 
 
255 aa  192  4e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2909  trans-aconitate 2-methyltransferase  40.43 
 
 
256 aa  167  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0465109  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3467  Trans-aconitate 2-methyltransferase  39.06 
 
 
257 aa  163  2e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  38.82 
 
 
259 aa  162  4e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  40.94 
 
 
257 aa  160  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5330  trans-aconitate 2-methyltransferase  42.32 
 
 
260 aa  160  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.270812  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  41.41 
 
 
258 aa  159  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0581  trans-aconitate 2-methyltransferase  39.3 
 
 
257 aa  159  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423521  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2790  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.47 
 
 
258 aa  158  8e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal  0.178369 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2280  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.65 
 
 
258 aa  158  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17170  trans-aconitate methyltransferase  37.69 
 
 
255 aa  157  1e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00821566  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5925  Methyltransferase type 11  39.76 
 
 
258 aa  155  6e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2430  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.24 
 
 
268 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2002  Trans-aconitate 2-methyltransferase  43.61 
 
 
258 aa  153  3e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.681077 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2481  trans-aconitate 2-methyltransferase  40 
 
 
256 aa  152  4e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0101749  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3158  trans-aconitate 2-methyltransferase  38.67 
 
 
252 aa  151  9e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1410  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.43 
 
 
255 aa  150  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.22 
 
 
255 aa  150  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1455  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.43 
 
 
255 aa  150  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8614  Trans-aconitate 2-methyltransferase  35.83 
 
 
250 aa  151  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2425  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.89 
 
 
253 aa  150  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.576064 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1770  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.97 
 
 
258 aa  150  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  4.80921e-10  hitchhiker  0.00972565 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3508  trans-aconitate 2-methyltransferase  38.93 
 
 
257 aa  150  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.510981  normal  0.74985 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2207  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.24 
 
 
260 aa  150  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1603  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.97 
 
 
258 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.463552  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3459  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.38 
 
 
256 aa  149  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.064868  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1498  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.55 
 
 
258 aa  149  6e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  6.87545e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2136  trans-aconitate 2-methyltransferase  38.43 
 
 
256 aa  148  7e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000208135  decreased coverage  0.00294275 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2127  Trans-aconitate 2-methyltransferase  37.89 
 
 
252 aa  148  9e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01476  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.89 
 
 
252 aa  148  9e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2139  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.89 
 
 
252 aa  148  9e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01487  hypothetical protein  37.89 
 
 
252 aa  148  9e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2132  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.89 
 
 
252 aa  147  1e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.523623  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0827  trans-aconitate 2-methyltransferase  38.61 
 
 
256 aa  148  1e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.934205 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.89 
 
 
252 aa  147  2e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.335531  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1601  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.5 
 
 
252 aa  145  4e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.767111  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1653  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.5 
 
 
252 aa  145  6e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.217982  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2203  trans-aconitate 2-methyltransferase  42.79 
 
 
258 aa  145  8e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.968625  hitchhiker  0.00608144 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3612  methyltransferase type 11  35.02 
 
 
256 aa  144  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4126  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.86 
 
 
256 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0941  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.45 
 
 
256 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.842807  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4124  trans-aconitate 2-methyltransferase  41.92 
 
 
261 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.104917 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1327  trans-aconitate methyltransferase, putative  37.5 
 
 
256 aa  143  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3371  trans-aconitate 2-methyltransferase  39.51 
 
 
258 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.362106 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3451  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.25 
 
 
256 aa  142  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1922  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.86 
 
 
256 aa  141  1e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.146762  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10909  conserved hypothetical protein  37.82 
 
 
333 aa  139  3e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00364748  normal  0.0877124 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0992  Trans-aconitate 2-methyltransferase  34.2 
 
 
294 aa  140  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5169  trans-aconitate 2-methyltransferase  40.35 
 
 
262 aa  139  4e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1690  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.5 
 
 
243 aa  139  4e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00892197  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3170  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.45 
 
 
258 aa  138  8e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.781198  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2545  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.45 
 
 
272 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00229105 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2805  trans-aconitate 2-methyltransferase  41.78 
 
 
261 aa  136  3e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2018  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.25 
 
 
252 aa  136  4e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00947857  normal  0.156367 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2216  trans-aconitate 2-methyltransferase  39.51 
 
 
258 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.414358  normal  0.438361 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3156  trans-aconitate 2-methyltransferase  38.13 
 
 
258 aa  135  8e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3392  trans-aconitate 2-methyltransferase  42.25 
 
 
221 aa  135  9e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603365  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4775  trans-aconitate 2-methyltransferase  42.38 
 
 
253 aa  134  1e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4083  Trans-aconitate 2-methyltransferase  35.83 
 
 
257 aa  134  1e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.30188 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3852  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.75 
 
 
269 aa  133  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.223127  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3331  trans-aconitate 2-methyltransferase  39.04 
 
 
262 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.911002 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0077  trans-aconitate methyltransferase  33.47 
 
 
258 aa  132  4e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1816  Trans-aconitate 2-methyltransferase  35.77 
 
 
259 aa  132  6e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17275e-11 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1297  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.5 
 
 
249 aa  131  8e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4574  Trans-aconitate 2-methyltransferase  32.08 
 
 
255 aa  131  1e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1765  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.25 
 
 
264 aa  126  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.736943  hitchhiker  0.00277995 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0608  Trans-aconitate 2-methyltransferase  35.57 
 
 
262 aa  126  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0288273  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2075  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.98 
 
 
287 aa  126  4e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.864232  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11260  trans-aconitate methyltransferase  34.12 
 
 
307 aa  123  3e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.22553  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1778  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.46 
 
 
265 aa  122  5e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525506  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0567  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.14 
 
 
293 aa  119  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.445388  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0425  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.94 
 
 
254 aa  119  4e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.500195  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0374  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.8 
 
 
254 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.603842  normal  0.758289 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0386  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.8 
 
 
254 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0397352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0395  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.8 
 
 
254 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.578699 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10301  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.56 
 
 
261 aa  116  4e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0338576  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0119  Trans-aconitate 2-methyltransferase  31.84 
 
 
268 aa  111  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.464742  normal  0.645262 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0316  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.78 
 
 
255 aa  110  2e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.224637  normal  0.898974 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13820  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.15 
 
 
255 aa  109  4e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.328183  normal  0.535788 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1276  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.77 
 
 
271 aa  102  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.281343  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  31.38 
 
 
268 aa  100  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1621  trans-aconitate methyltransferase  31.3 
 
 
344 aa  98.6  8e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.898496  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2673  trans-aconitate methyltransferase  29.67 
 
 
280 aa  98.2  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0998  methyltransferase, putative  28.81 
 
 
258 aa  92  8e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.742454  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2668  hypothetical protein  30.65 
 
 
275 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2012  Methyltransferase type 11  26.43 
 
 
263 aa  89  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  8.02206e-05  normal  0.20097 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  27.27 
 
 
263 aa  89  6e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  27.27 
 
 
263 aa  89  6e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  27.27 
 
 
263 aa  89  6e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31370  hypothetical protein  29.81 
 
 
275 aa  89  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.14144  hitchhiker  1.0613e-14 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0640  Trans-aconitate 2-methyltransferase  29.46 
 
 
252 aa  87.4  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1749  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.27 
 
 
264 aa  86.7  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  32.94 
 
 
252 aa  85.9  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3635  hypothetical protein  26.23 
 
 
263 aa  84.3  2e-15  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>