16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0565 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_0565  RAD52/22 double-strand break repair protein  100 
 
 		 169 aa  342  1e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.103803 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3545  RAD52/22 double-strand break repair protein  88.1 
 
 		 170 aa  310  4.999999999999999e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000561994  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0576  hypothetical protein  86.39 
 
 		 170 aa  307  5e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00845502  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1314  Rad52/22 double-strand break repair protein  56.97 
 
 		 179 aa  195  3e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.321327  normal  0.202591 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0517  Rad52/22 double-strand break repair protein  39.75 
 
 		 167 aa  108  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.743906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2527  Rad52/22 double-strand break repair protein  39.47 
 
 		 170 aa  100  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00242809  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2129  hypothetical protein  36 
 
 		 252 aa  79.7  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0052  putative prophage protein  38.18 
 
 		 282 aa  77.8  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.012266 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0612  gp49  39.84 
 
 		 235 aa  76.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0180237  hitchhiker  0.00151942 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0086  prophage protein  38.89 
 
 		 118 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0080  prophage protein  38.89 
 
 		 118 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.568604  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2611  Rad52/22 double-strand break repair protein  29.73 
 
 		 238 aa  61.6  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0322  hypothetical protein  35.26 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0535  hypothetical protein  32.35 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0116997  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1173  hypothetical protein  25.44 
 
 		 211 aa  47.8  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000729431  normal  0.496656 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0977  Rad52/22 double-strand break repair protein  29.46 
 
 		 201 aa  43.1  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.00000000168807  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>