296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0430 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0430  Ferritin Dps family protein  100 
 
 
176 aa  357  6e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00669774  hitchhiker  0.00115538 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7797  DNA protection during starvation protein (DNA-binding ferritin-like protein)  60.29 
 
 
137 aa  168  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.245311  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2510  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  50.64 
 
 
177 aa  165  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4423  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  49.06 
 
 
188 aa  162  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0800  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  49.07 
 
 
163 aa  162  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.388043 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3484  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  50.32 
 
 
163 aa  160  6e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4966  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  47.85 
 
 
181 aa  155  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.933657  hitchhiker  0.0000112331 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0322  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  47.8 
 
 
178 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2476  Ferritin Dps family protein  49.02 
 
 
158 aa  147  5e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.225873  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3912  Ferritin Dps family protein  45.91 
 
 
160 aa  136  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.530114 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2487  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  41.92 
 
 
167 aa  130  7.999999999999999e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.321878  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1767  Ferritin, Dps family protein  49.59 
 
 
157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.294588 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2877  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  37.65 
 
 
167 aa  129  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000573167  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1585  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  39.13 
 
 
167 aa  129  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0156974  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0868  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  41.94 
 
 
167 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.558858  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0896  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  41.94 
 
 
167 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.686485  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0926  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  41.94 
 
 
167 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.589813  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0959  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  41.94 
 
 
167 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0980  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  41.94 
 
 
167 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00779  DNA protection during starvation conditions  41.94 
 
 
167 aa  124  5e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2830  Ferritin Dps family protein  41.94 
 
 
167 aa  124  5e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.11817  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0961  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  41.94 
 
 
167 aa  124  5e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00256764  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0836  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  41.94 
 
 
167 aa  124  5e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0126376  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2831  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  41.94 
 
 
167 aa  124  5e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2536  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  41.94 
 
 
167 aa  124  5e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000397049  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00796  hypothetical protein  41.94 
 
 
167 aa  124  5e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0881  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  41.94 
 
 
167 aa  124  5e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000444626  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0868  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  41.94 
 
 
167 aa  124  5e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000196372  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1481  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  37.65 
 
 
167 aa  124  7e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1299  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  40.76 
 
 
167 aa  123  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.465743  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0762  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  44.81 
 
 
165 aa  119  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.654997  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1771  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  37.89 
 
 
167 aa  117  7e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000026009  normal  0.0516528 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1497  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  37.89 
 
 
167 aa  117  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000580086  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1602  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  37.89 
 
 
167 aa  117  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2149  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  43.51 
 
 
165 aa  117  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2062  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  43.51 
 
 
165 aa  116  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.334508  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0735  Ferritin and Dps  40 
 
 
165 aa  114  7.999999999999999e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.714613  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0703  Ferritin Dps family protein  38.82 
 
 
164 aa  102  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2890  Ferritin Dps family protein  39.6 
 
 
158 aa  101  6e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.18015  normal  0.244288 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1333  Ferritin Dps family protein  38.96 
 
 
178 aa  95.5  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0377707  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2520  ferritin  40 
 
 
179 aa  91.3  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1431  Ferritin Dps family protein  40.94 
 
 
178 aa  90.1  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.103908  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0218  Ferritin Dps family protein  37.86 
 
 
182 aa  87  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5451  Ferritin, Dps family protein  37.24 
 
 
179 aa  86.3  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5072  Ferritin and Dps  37.24 
 
 
179 aa  86.3  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5160  Ferritin, Dps family protein  37.24 
 
 
179 aa  86.3  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.221838  normal  0.23346 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1159  Ferritin Dps family protein  34.86 
 
 
199 aa  84.7  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.385489  normal  0.0464368 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03560  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  37.75 
 
 
163 aa  84.7  7e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02269  stress response DNA-binding protein Dps  36.42 
 
 
169 aa  82  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2007  Ferritin, Dps family protein  34.53 
 
 
162 aa  81.6  0.000000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.779211  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1112  Ferritin, Dps family protein  35.17 
 
 
182 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.998293 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3577  Ferritin, Dps family protein  32.37 
 
 
167 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0321644 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5700  Ferritin, Dps family protein  35.17 
 
 
182 aa  79  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.963789 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1791  Ferritin Dps family protein  35.17 
 
 
185 aa  77.8  0.00000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.384711  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3044  Ferritin, Dps family protein  30 
 
 
162 aa  77.8  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0512892  normal  0.232541 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0224  Ferritin Dps family protein  32.68 
 
 
158 aa  75.9  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2838  Ferritin, Dps family protein  30.71 
 
 
167 aa  75.5  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.232041  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1499  Ferritin and Dps  36.43 
 
 
187 aa  73.6  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.478459  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0395  Ferritin and Dps  31.08 
 
 
161 aa  73.6  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.680559  normal  0.268333 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3028  Ferritin and Dps  29.29 
 
 
162 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.129513  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3087  Ferritin, Dps family protein  29.29 
 
 
162 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0395756  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1812  Ferritin and Dps  34.62 
 
 
213 aa  71.6  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1406  Ferritin Dps family protein  35.26 
 
 
179 aa  71.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.2229 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1410  DNA-binding ferritin-like protein  32.86 
 
 
159 aa  71.2  0.000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18820  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  36.76 
 
 
216 aa  71.2  0.000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000855963  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36300  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  30.97 
 
 
158 aa  70.9  0.000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.414933 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0878  Ferritin Dps family protein  30.37 
 
 
159 aa  70.5  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1904  Ferritin Dps family protein  33.1 
 
 
190 aa  70.1  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.830946  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18630  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  33.79 
 
 
191 aa  68.9  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.284161  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0761  Ferritin, Dps family protein  31.39 
 
 
159 aa  69.3  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.208639  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0943  ferritin Dps family protein  29.68 
 
 
169 aa  68.6  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.230406  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2149  Ferritin Dps family protein  29.93 
 
 
158 aa  68.6  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000025192  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1729  Ferritin Dps family protein  31.94 
 
 
149 aa  68.2  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.910338  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1748  Dps family protein  28.57 
 
 
148 aa  67.4  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2744  ferritin Dps family protein  35 
 
 
155 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111213  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5065  Ferritin Dps family protein  29.86 
 
 
188 aa  66.6  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.667805  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0902  Ferritin Dps family protein  31.69 
 
 
187 aa  65.9  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0327  Ferritin Dps family protein  25.9 
 
 
159 aa  65.5  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4823  Ferritin Dps family protein  31.4 
 
 
155 aa  65.9  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2692  ferritin Dps family protein  32.03 
 
 
191 aa  65.9  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.119491  normal  0.477908 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2868  Ferritin and Dps  30.32 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0734  Ferritin Dps family protein  28.19 
 
 
157 aa  65.5  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0799  hypothetical protein  31.82 
 
 
155 aa  65.1  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.597246  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0319  Ferritin Dps family protein  29.58 
 
 
157 aa  64.7  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1076  Ferritin Dps family protein  30.34 
 
 
179 aa  64.3  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.320757 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2213  Ferritin Dps family protein  27.86 
 
 
147 aa  63.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.716736  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0554  Ferritin Dps family protein  29.63 
 
 
159 aa  63.9  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4559  Ferritin Dps family protein  32.39 
 
 
158 aa  63.5  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.276191 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0378  Ferritin, Dps family protein  27.78 
 
 
172 aa  63.5  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.291476  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2175  Ferritin, Dps family protein  27.86 
 
 
147 aa  63.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.728461  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0369  Ferritin Dps family protein  27.78 
 
 
172 aa  63.5  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0735152  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0334  Ferritin, Dps family protein  31.62 
 
 
159 aa  64.3  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6797  putative DNA-binding stress protein (oxydative damage protectant)  27.15 
 
 
175 aa  63.2  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.226915 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0325  Ferritin, Dps family protein  27.71 
 
 
174 aa  62.8  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0225857 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01577  DNA-binding related protein  28.15 
 
 
181 aa  62  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0013  ferritin-like protein  34.04 
 
 
159 aa  62  0.000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000373945 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0650  Ferritin Dps family protein  28.08 
 
 
180 aa  61.6  0.000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1392  Ferritin Dps family protein  30.2 
 
 
197 aa  61.6  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.349984  hitchhiker  0.00135993 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05670  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  30.28 
 
 
176 aa  61.2  0.000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2466  Ferritin, Dps family protein  30.61 
 
 
175 aa  61.2  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>