More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0410 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0410  thioredoxin  100 
 
 
141 aa  281  3.0000000000000004e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0888  thioredoxin  78.1 
 
 
141 aa  220  6e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.747507  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2518  thioredoxin  63.04 
 
 
141 aa  182  1.0000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0652  thioredoxin  50.78 
 
 
150 aa  139  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  48.2 
 
 
150 aa  134  3.0000000000000003e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  63.64 
 
 
109 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  62.63 
 
 
110 aa  127  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00610  thioredoxin  46.76 
 
 
150 aa  127  6e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5403  thioredoxin  61.17 
 
 
109 aa  126  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  61.17 
 
 
109 aa  126  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  61.17 
 
 
109 aa  126  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  54.37 
 
 
110 aa  124  3e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  68.89 
 
 
116 aa  124  6e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3022  thioredoxin  54.9 
 
 
112 aa  122  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4854  thioredoxin  65.52 
 
 
112 aa  120  6e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0500  thioredoxin  49.22 
 
 
144 aa  120  9e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.874633 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4438  thioredoxin  44.37 
 
 
150 aa  118  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.102034  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3596  thioredoxin  46.97 
 
 
150 aa  118  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.854397  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1430  thioredoxin  51.3 
 
 
140 aa  119  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000656365 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  57.58 
 
 
108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5905  thioredoxin  46.38 
 
 
144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3508  thioredoxin  47.73 
 
 
150 aa  118  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  59.77 
 
 
115 aa  118  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3665  thioredoxin  47.73 
 
 
150 aa  117  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  57.14 
 
 
107 aa  117  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  57.14 
 
 
107 aa  117  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  57.14 
 
 
107 aa  117  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5839  thioredoxin  57.69 
 
 
109 aa  117  6e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  57.14 
 
 
107 aa  117  7e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0456  thioredoxin  44.12 
 
 
165 aa  116  7.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6432  thioredoxin  43.08 
 
 
160 aa  116  9e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.432921 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  56.04 
 
 
107 aa  116  9e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  56.04 
 
 
107 aa  116  9e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3583  thioredoxin  44.12 
 
 
149 aa  116  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.029416  normal  0.0374075 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  50.49 
 
 
104 aa  116  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  50.49 
 
 
104 aa  116  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  58.24 
 
 
107 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  60.44 
 
 
108 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3369  thioredoxin  59.78 
 
 
106 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0365156  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  49.51 
 
 
104 aa  115  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  56.04 
 
 
107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  57.14 
 
 
107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  57.14 
 
 
124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4027  thioredoxin  47.01 
 
 
148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0913338  normal  0.121576 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  52.53 
 
 
107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2134  thioredoxin  44.78 
 
 
139 aa  114  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.408487  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  53.85 
 
 
108 aa  114  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  53.85 
 
 
107 aa  114  3.9999999999999997e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7329  thioredoxin  53.47 
 
 
108 aa  114  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  56.04 
 
 
107 aa  114  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5927  thioredoxin  46.15 
 
 
110 aa  114  5e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365173  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  53.85 
 
 
148 aa  114  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4942  thioredoxin  41.61 
 
 
144 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  56.04 
 
 
107 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  54.95 
 
 
107 aa  112  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1420  thioredoxin  46.09 
 
 
157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.669095  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5069  thioredoxin  43.28 
 
 
144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  60.92 
 
 
108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  53.85 
 
 
107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5085  thioredoxin  54.95 
 
 
108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  53.85 
 
 
107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  50.54 
 
 
109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  57.65 
 
 
106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  46.94 
 
 
109 aa  111  3e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0504  thioredoxin  42.75 
 
 
145 aa  111  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0235096 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1436  thioredoxin  49.04 
 
 
107 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000083  thioredoxin 2  41.01 
 
 
144 aa  111  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.396729  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4537  thioredoxin  54.74 
 
 
108 aa  111  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  53.85 
 
 
125 aa  111  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  52.75 
 
 
108 aa  110  7.000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0520  thioredoxin  42.75 
 
 
145 aa  110  7.000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.609436  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  52.75 
 
 
120 aa  110  8.000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  48.98 
 
 
106 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  53.33 
 
 
108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3582  thioredoxin  55.79 
 
 
107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.968394  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9377  thioredoxin  57.47 
 
 
107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0031  thioredoxin  52.75 
 
 
110 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4233  thioredoxin  58.62 
 
 
111 aa  109  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1524  thioredoxin  37.86 
 
 
148 aa  109  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0659124 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4084  thioredoxin  56.04 
 
 
112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2977  thioredoxin  42.22 
 
 
146 aa  109  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000101834  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05698  thioredoxin 2  41.01 
 
 
162 aa  108  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5119  thioredoxin  41.67 
 
 
144 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.402757  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  53.85 
 
 
107 aa  108  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  50 
 
 
106 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0397  thioredoxin  40.3 
 
 
144 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3437  thioredoxin  51.11 
 
 
107 aa  107  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0690  thioredoxin 2  39.57 
 
 
144 aa  107  5e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.555698  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3491  thioredoxin 2  39.42 
 
 
139 aa  107  5e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0887  thioredoxin 2  40.31 
 
 
141 aa  107  6e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00834128  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  48.51 
 
 
107 aa  107  6e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  0.000000265159 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1294  thioredoxin  56.04 
 
 
108 aa  107  6e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316672  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  54.12 
 
 
107 aa  107  7.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1476  thioredoxin  42.61 
 
 
223 aa  107  7.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00459132  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3022  thioredoxin  46.67 
 
 
108 aa  107  7.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18120  thioredoxin  47.47 
 
 
106 aa  107  7.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000183291  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  50.57 
 
 
107 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000534537  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2468  thioredoxin  48.08 
 
 
108 aa  106  9.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  51.72 
 
 
108 aa  106  9.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  53.85 
 
 
109 aa  106  9.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>