More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0389 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0389  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  100 
 
 
485 aa  978    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3026  DNA polymerase III subunits gamma and tau  72.16 
 
 
641 aa  661    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.196255 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2135  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.73 
 
 
737 aa  390  1e-107  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_524  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  42.57 
 
 
562 aa  270  4e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000305256  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0031  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.7 
 
 
447 aa  268  2e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000324435  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1535  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.49 
 
 
599 aa  268  2e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495544  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0585  DNA polymerase III, gamma and tau subunits, putative  40.35 
 
 
559 aa  264  2e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2789  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  45.02 
 
 
602 aa  264  2e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.226663  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0027  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  47.83 
 
 
589 aa  264  3e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154817 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0559  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.18 
 
 
570 aa  264  3e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.42957  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20790  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.3 
 
 
588 aa  260  4e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000015496  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1386  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.24 
 
 
550 aa  259  8e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0257  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.42 
 
 
518 aa  259  9e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0042  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.94 
 
 
540 aa  258  1e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000215305  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5294  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.61 
 
 
562 aa  258  2e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000435365  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0368  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  42.21 
 
 
602 aa  258  2e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.614636  hitchhiker  0.000122178 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0024  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.61 
 
 
562 aa  257  3e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00112319  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0026  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.61 
 
 
562 aa  256  6e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000589622  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0020  DNA polymerase III subunits gamma and tau  42.9 
 
 
562 aa  256  9e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.327732  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0033  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.56 
 
 
518 aa  256  9e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.168879  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0021  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.61 
 
 
562 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0259778  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.61 
 
 
562 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0496501  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.61 
 
 
562 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0875141  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21271  DNA polymerase, gamma and tau subunits  36.82 
 
 
565 aa  255  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0242  DNA polymerase III subunits gamma and tau  33.95 
 
 
562 aa  255  1.0000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000227385  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0512  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.47 
 
 
565 aa  254  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0499  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.47 
 
 
565 aa  254  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0810383  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0114  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  41.1 
 
 
568 aa  254  3e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.61 
 
 
562 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0804011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  44.29 
 
 
562 aa  252  1e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0790  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.26 
 
 
626 aa  251  1e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0016  DNA polymerase III subunits gamma and tau  44.86 
 
 
559 aa  252  1e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0023  DNA polymerase III subunits gamma and tau  44.29 
 
 
562 aa  251  2e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  42.58 
 
 
562 aa  251  2e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0519893  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1138  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.96 
 
 
550 aa  251  2e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0632409  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0015  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  45.85 
 
 
589 aa  251  3e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00819086  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0050  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.46 
 
 
554 aa  250  4e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000022733  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1256  DNA polymerase III, tau subunit  36.14 
 
 
565 aa  250  5e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.303373  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0015  DNA polymerase III subunit gamma/tau  47.88 
 
 
548 aa  249  7e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.466533  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0212  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.2 
 
 
582 aa  249  7e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.783119  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2144  DNA polymerase III subunits gamma and tau  33.87 
 
 
547 aa  249  1e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00119695  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2215  AAA ATPase, central region  44.41 
 
 
650 aa  247  3e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.110333  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2005  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.97 
 
 
496 aa  247  3e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0195  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.63 
 
 
579 aa  247  4e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.92139e-31 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0094  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  35.81 
 
 
579 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4327  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.91 
 
 
579 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.923822  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2444  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.81 
 
 
567 aa  246  6e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.453017  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2608  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.26 
 
 
610 aa  246  8e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0092  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.54 
 
 
527 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000833689 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3473  DNA polymerase III subunits gamma and tau  46.69 
 
 
659 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25950  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  46.21 
 
 
796 aa  245  9.999999999999999e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.08 
 
 
517 aa  244  1.9999999999999999e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.433516  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.17 
 
 
561 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000159056  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0194  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  52.17 
 
 
614 aa  244  3e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2107  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.48 
 
 
534 aa  244  3e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00560473  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2293  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  48.79 
 
 
644 aa  243  3.9999999999999997e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.566282  normal  0.158563 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0189  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  51.38 
 
 
622 aa  244  3.9999999999999997e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4930  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.34 
 
 
621 aa  243  5e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.522711  normal  0.575314 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0058  DNA-directed DNA polymerase  45.1 
 
 
625 aa  243  5e-63  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2269  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  52.44 
 
 
688 aa  243  6e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3199  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.21 
 
 
613 aa  242  9e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000104981  normal  0.61313 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0062  DNA polymerase III, tau subunit  45.8 
 
 
614 aa  242  9e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0106  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  50.45 
 
 
586 aa  241  1e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0912  DNA polymerase III, tau subunit  44.9 
 
 
652 aa  242  1e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.850857 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0052  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.61 
 
 
547 aa  242  1e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0055  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.61 
 
 
547 aa  242  1e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0473  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.5 
 
 
560 aa  242  1e-62  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3534  DNA polymerase III subunits gamma and tau  48.1 
 
 
729 aa  241  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.698933 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1322  DNA-directed DNA polymerase  42.91 
 
 
396 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.403308  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0245  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.73 
 
 
478 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0243  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.73 
 
 
478 aa  240  4e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0796  DNA polymerase III subunits gamma and tau  42.59 
 
 
565 aa  240  5e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0481374 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1470  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.47 
 
 
617 aa  240  5e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0928579  normal  0.923251 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1414  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.36 
 
 
467 aa  239  6.999999999999999e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.873736  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2130  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  48.71 
 
 
427 aa  239  6.999999999999999e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0748227  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0055  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.41 
 
 
582 aa  239  6.999999999999999e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0628794  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0365  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  45.96 
 
 
551 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00200762  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1289  DNA polymerase III subunits gamma and tau  44.31 
 
 
960 aa  238  2e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1233  DNA polymerase III, tau and gamma subunits  41.64 
 
 
381 aa  238  2e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.710684  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0832  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.84 
 
 
695 aa  238  2e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4439  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.85 
 
 
730 aa  237  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0934  ATPase  42.32 
 
 
396 aa  237  3e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.894546  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0046  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.63 
 
 
522 aa  237  3e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.241439  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0331  hypothetical protein  41.72 
 
 
629 aa  237  4e-61  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.517311 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0769  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  47.04 
 
 
591 aa  237  4e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.775776  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2016  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.37 
 
 
637 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.780836  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1175  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.79 
 
 
520 aa  236  5.0000000000000005e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4353  DNA polymerase III subunits gamma and tau  42.03 
 
 
663 aa  236  6e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.695185  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0326  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  50.67 
 
 
611 aa  236  7e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0950425  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0270  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.73 
 
 
812 aa  236  7e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0830  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.6 
 
 
580 aa  236  7e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9315  DNA-directed DNA polymerase  46.71 
 
 
727 aa  236  8e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0374  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  44.18 
 
 
582 aa  236  8e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000945747  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf158  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.92 
 
 
647 aa  236  8e-61  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3778  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.42 
 
 
601 aa  236  9e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131326  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3695  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.42 
 
 
601 aa  236  9e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3587  DNA polymerase III subunits gamma and tau  46.67 
 
 
689 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3834  DNA polymerase III subunits gamma and tau  46.67 
 
 
687 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.471872 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2144  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  49.32 
 
 
741 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3922  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.58 
 
 
575 aa  234  2.0000000000000002e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0150926  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>