More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0223 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010682  Rpic_0744  alanyl-tRNA synthetase  41.48 
 
 
888 aa  635  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.453512  normal  0.711122 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3979  alanyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 
897 aa  665  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.567891  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1489  alanyl-tRNA synthetase  45.41 
 
 
877 aa  707  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  1.63922e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4235  alanyl-tRNA synthetase  44.02 
 
 
880 aa  655  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.688921  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0898  alanyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 
875 aa  668  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.0723e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0883  alanyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 
865 aa  645  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  8.18492e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1906  alanyl-tRNA synthetase  43.61 
 
 
874 aa  681  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.206627 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0620  alanyl-tRNA synthetase  44.49 
 
 
876 aa  712  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4054  alanyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 
874 aa  662  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100715  normal  0.103124 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2617  alanyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 
879 aa  677  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00109675  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3267  alanyl-tRNA synthetase  43.67 
 
 
874 aa  663  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.235906  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3635  alanyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 
889 aa  642  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.988674  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1268  alanyl-tRNA synthetase  43.19 
 
 
876 aa  654  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1196  alanyl-tRNA synthetase  43.61 
 
 
875 aa  669  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00838926  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1394  alanyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 
883 aa  676  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0912  alanyl-tRNA synthetase  44.83 
 
 
880 aa  688  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00106674  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2824  alanyl-tRNA synthetase  43.52 
 
 
874 aa  679  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0756598 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3180  alanyl-tRNA synthetase  43.21 
 
 
876 aa  691  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  2.08446e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0028  alanyl-tRNA synthetase  42.52 
 
 
868 aa  648  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.812151  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1613  alanyl-tRNA synthetase  43.41 
 
 
874 aa  679  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894889  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2405  alanyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 
901 aa  639  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.665825  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0087  alanyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 
884 aa  637  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000138455  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1324  alanyl-tRNA synthetase  43.44 
 
 
874 aa  688  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1387  alanyl-tRNA synthetase  43.19 
 
 
874 aa  683  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.371658 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3339  alanyl-tRNA synthetase  44.3 
 
 
874 aa  672  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0101035  hitchhiker  6.88194e-07 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3763  alanyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 
897 aa  667  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.469111  normal  0.276016 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2820  alanyl-tRNA synthetase  43.21 
 
 
876 aa  692  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  7.29274e-05  hitchhiker  2.729e-05 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1433  alanyl-tRNA synthetase  45.7 
 
 
863 aa  727  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1015  alanyl-tRNA synthetase  42.87 
 
 
876 aa  690  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00108503  hitchhiker  0.000252417 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  43.11 
 
 
892 aa  707  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  2.00247e-06  unclonable  3.09197e-08 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1318  alanyl-tRNA synthetase  43.3 
 
 
874 aa  672  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0106685  hitchhiker  0.00151314 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2980  alanyl-tRNA synthetase  43.21 
 
 
876 aa  692  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  4.68314e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1611  alanyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 
903 aa  677  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0248511  hitchhiker  1.35737e-05 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3223  alanyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 
931 aa  647  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1441  alanyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 
897 aa  670  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0440336  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1164  alanyl-tRNA synthetase  43.46 
 
 
885 aa  649  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.855181  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1675  alanyl-tRNA synthetase  41.85 
 
 
876 aa  657  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.131241  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1387  alanyl-tRNA synthetase  45.66 
 
 
863 aa  720  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5448  alanyl-tRNA synthetase  43.14 
 
 
896 aa  672  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.10309 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0222  alanyl-tRNA synthetase  42.49 
 
 
876 aa  662  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0072  alanyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 
860 aa  651  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.163524  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0047  alanyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 
871 aa  651  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.620417  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2903  alanyl-tRNA synthetase  43.86 
 
 
892 aa  674  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0357783  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2745  alanyl-tRNA synthetase  43.56 
 
 
892 aa  665  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.376883  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3172  alanyl-tRNA synthetase  43.43 
 
 
875 aa  692  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0289065  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1281  alanyl-tRNA synthetase  43.02 
 
 
859 aa  652  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1709  alanyl-tRNA synthetase  41.85 
 
 
876 aa  657  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2833  alanyl-tRNA synthetase  43.21 
 
 
876 aa  692  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.53011e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03511  alanyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 
865 aa  662  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3711  alanyl-tRNA synthetase  43.04 
 
 
905 aa  660  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.296443  hitchhiker  6.4855e-05 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0990  alanyl-tRNA synthetase  41.74 
 
 
865 aa  647  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2579  alanyl-tRNA synthetase  43.77 
 
 
913 aa  659  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.159446  normal  0.328441 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1499  alanyl-tRNA synthetase  43.3 
 
 
867 aa  660  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3238  alanyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 
875 aa  669  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.22674e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3904  alanyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 
904 aa  657  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.639044  normal  0.0112827 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3101  alanyl-tRNA synthetase  43.68 
 
 
880 aa  657  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.438368  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1987  alanyl-tRNA synthetase  43.09 
 
 
885 aa  642  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.363624  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3124  alanyl-tRNA synthetase  43.34 
 
 
874 aa  659  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.600607  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4612  alanyl-tRNA synthetase  43.41 
 
 
874 aa  676  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1521  alanyl-tRNA synthetase  43.43 
 
 
887 aa  638  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32618  predicted protein  44.27 
 
 
906 aa  653  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.63515 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00147  alanyl-tRNA synthetase  43.67 
 
 
882 aa  653  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.328967  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3088  alanyl-tRNA synthetase  42.06 
 
 
880 aa  662  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.150623  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2555  alanyl-tRNA synthetase  44.67 
 
 
878 aa  666  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0457  alanyl-tRNA synthetase  44.53 
 
 
881 aa  693  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05100  alanyl-tRNA synthetase  42.47 
 
 
878 aa  645  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.637109  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07800  alanyl-tRNA synthetase  43.86 
 
 
889 aa  657  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0367295 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1452  alanyl-tRNA synthetase  43 
 
 
879 aa  671  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3211  alanyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 
875 aa  657  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.277669  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0983  alanyl-tRNA synthetase  41.78 
 
 
875 aa  662  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0820082  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02512  hypothetical protein  42.98 
 
 
876 aa  693  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00356315  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0998  alanyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 
875 aa  655  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.932608  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0814  alanyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 
893 aa  637  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2490  alanyl-tRNA synthetase  45.42 
 
 
877 aa  706  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000298908  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34460  alanyl-tRNA synthetase  43.9 
 
 
874 aa  679  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.440747  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1072  alanyl-tRNA synthetase  41.75 
 
 
845 aa  650  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2026  alanyl-tRNA synthetase  46.69 
 
 
879 aa  707  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0668165  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2268  alanyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 
878 aa  684  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  1.49569e-05 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0223  alanyl-tRNA synthetase  100 
 
 
894 aa  1816  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0181746 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2952  alanyl-tRNA synthetase  79.78 
 
 
883 aa  1412  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1614  alanyl-tRNA synthetase  42.13 
 
 
869 aa  648  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_50  alanyl-tRNA synthetase  43.16 
 
 
876 aa  652  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000334801  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0089  alanyl-tRNA synthetase  43.17 
 
 
879 aa  650  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1033  alanyl-tRNA synthetase  44.95 
 
 
882 aa  684  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002521  alanyl-tRNA synthetase  43 
 
 
860 aa  667  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1946  alanyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 
890 aa  645  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197292  hitchhiker  0.00683804 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0357  alanyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 
872 aa  639  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.160702  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1116  alanyl-tRNA synthetase  41.65 
 
 
875 aa  653  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0502279  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0962  alanyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 
878 aa  695  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1440  alanyl-tRNA synthetase  45.72 
 
 
874 aa  656  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000329754  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0311  alanyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 
880 aa  649  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1331  alanyl-tRNA synthetase  44.22 
 
 
883 aa  713  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.255644  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1779  alanyl-tRNA synthetase  41.64 
 
 
874 aa  655  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2557  alanyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 
887 aa  656  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.243689  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0635  alanyl-tRNA synthetase  41.27 
 
 
860 aa  650  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.427199  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1052  alanyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 
877 aa  654  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.103695 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3136  alanyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 
876 aa  690  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299814  hitchhiker  0.000378627 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2946  alanyl-tRNA synthetase  42.76 
 
 
876 aa  684  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00651312  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3633  alanyl-tRNA synthetase  41.44 
 
 
875 aa  637  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511669  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3839  alanyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 
905 aa  657  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.538554  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>