20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0219 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_0219  protein of unknown function UPF0153  100 
 
 		 114 aa  233  6e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.162124 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0119  hypothetical protein  73.85 
 
 		 99 aa  100  7e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.226036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2777  hypothetical protein  54.55 
 
 		 78 aa  86.3  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0388254  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2457  hypothetical protein  53.95 
 
 		 75 aa  86.7  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.574225  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0636  hypothetical protein  52.63 
 
 		 77 aa  85.5  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207413  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0579  protein of unknown function UPF0153  52.63 
 
 		 76 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000485137  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0592  protein of unknown function UPF0153  52.63 
 
 		 76 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00030944 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3912  hypothetical protein  55.32 
 
 		 79 aa  52.8  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3252  hypothetical protein  35.82 
 
 		 146 aa  45.4  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0365  hypothetical protein  40.74 
 
 		 173 aa  44.3  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.759593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2301  hypothetical protein  43.14 
 
 		 138 aa  44.3  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.708032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2510  hypothetical protein  46.67 
 
 		 83 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0872529  normal  0.87408 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1650  hypothetical protein  45.28 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0564934  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2331  protein of unknown function UPF0153  43.64 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0049  hypothetical protein  45.76 
 
 		 87 aa  40.8  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0897  hypothetical protein  38 
 
 		 138 aa  40.4  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0194546 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44090  putative Fe-S-cluster oxidoreductase  41.67 
 
 		 84 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1006  hypothetical protein  39.74 
 
 		 83 aa  40.4  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1921  protein of unknown function UPF0153  45.28 
 
 		 84 aa  40  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00522326  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2428  protein of unknown function UPF0153  43.4 
 
 		 84 aa  40  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>