More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0089 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0089  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 
477 aa  989    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8092  prolyl-tRNA synthetase  63.12 
 
 
480 aa  635    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0469  prolyl-tRNA synthetase  82.18 
 
 
477 aa  819    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0863  prolyl-tRNA synthetase  60.17 
 
 
477 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0570  prolyl-tRNA synthetase  56.94 
 
 
497 aa  572  1.0000000000000001e-162  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.267387  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2390  prolyl-tRNA synthetase  59.03 
 
 
483 aa  545  1e-154  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1665  prolyl-tRNA synthetase  56 
 
 
483 aa  537  1e-151  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0830  prolyl-tRNA synthetase  55.58 
 
 
480 aa  538  1e-151  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2053  prolyl-tRNA synthetase  54.17 
 
 
480 aa  536  1e-151  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.449201 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1775  prolyl-tRNA synthetase  53.03 
 
 
480 aa  531  1e-150  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal  0.0147594 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2310  prolyl-tRNA synthetase  54.08 
 
 
490 aa  527  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317446 
 
 
-
 
NC_002950  PG0962  prolyl-tRNA synthetase  55.15 
 
 
493 aa  522  1e-147  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.353479 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1544  prolyl-tRNA synthetase  53.66 
 
 
492 aa  523  1e-147  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.138396  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2910  prolyl-tRNA synthetase  53.06 
 
 
490 aa  522  1e-147  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104105  hitchhiker  0.00000000473758 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1083  prolyl-tRNA synthetase  54.04 
 
 
481 aa  521  1e-146  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000273538  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1492  prolyl-tRNA synthetase  55.28 
 
 
481 aa  518  1e-146  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0711  prolyl-tRNA synthetase  54.04 
 
 
481 aa  519  1e-146  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1587  prolyl-tRNA synthetase  54.26 
 
 
481 aa  520  1e-146  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000034459  normal  0.935252 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1877  prolyl-tRNA synthetase  53.85 
 
 
481 aa  520  1e-146  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0103164  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2271  prolyl-tRNA synthetase  54.66 
 
 
496 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0849  prolyl-tRNA synthetase  53.62 
 
 
481 aa  517  1.0000000000000001e-145  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000760097  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1696  prolyl-tRNA synthetase  54.17 
 
 
481 aa  515  1.0000000000000001e-145  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5952  prolyl-tRNA synthetase  52.33 
 
 
493 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000821965  normal  0.0117202 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4939  prolyl-tRNA synthetase  52.03 
 
 
492 aa  516  1.0000000000000001e-145  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.580893  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0277  prolyl-tRNA synthetase  51.93 
 
 
491 aa  512  1e-144  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.273584 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0345  prolyl-tRNA synthetase  52.48 
 
 
478 aa  511  1e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0139585  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0435  prolyl-tRNA synthetase  52.1 
 
 
483 aa  510  1e-143  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0217  prolyl-tRNA synthetase  53.77 
 
 
491 aa  510  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000503447  normal  0.017665 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01055  prolyl-tRNA synthetase  51.22 
 
 
492 aa  507  9.999999999999999e-143  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0313  prolyl-tRNA synthetase  53.53 
 
 
478 aa  501  1e-140  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000674041  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3228  prolyl-tRNA synthetase  51.73 
 
 
491 aa  495  1e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.64525  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2485  prolyl-tRNA synthetase  53.97 
 
 
480 aa  491  1e-137  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0333949  normal  0.491162 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0461  prolyl-tRNA synthetase  48.97 
 
 
476 aa  486  1e-136  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00085857  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0405  prolyl-tRNA synthetase  48.77 
 
 
488 aa  485  1e-136  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0440  prolyl-tRNA synthetase  47.73 
 
 
476 aa  478  1e-134  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0510  prolyl-tRNA synthetase  47.93 
 
 
476 aa  480  1e-134  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0373  prolyl-tRNA synthetase  47.93 
 
 
476 aa  480  1e-134  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0370  prolyl-tRNA synthetase  47.93 
 
 
476 aa  480  1e-134  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0510  prolyl-tRNA synthetase  47.93 
 
 
476 aa  479  1e-134  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4863  prolyl-tRNA synthetase  48.13 
 
 
476 aa  480  1e-134  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0382  prolyl-tRNA synthetase  47.7 
 
 
476 aa  480  1e-134  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0376  prolyl-tRNA synthetase  47.91 
 
 
476 aa  478  1e-133  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3837  prolyl-tRNA synthetase  52.27 
 
 
477 aa  470  1.0000000000000001e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00668476  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0382  prolyl-tRNA synthetase  47.6 
 
 
508 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0396  prolyl-tRNA synthetase  47.6 
 
 
508 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.468915  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0658  prolyl-tRNA synthetase  47.81 
 
 
480 aa  465  9.999999999999999e-131  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.448149 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0026  prolyl-tRNA synthetase  50 
 
 
510 aa  464  1e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0024  prolyl-tRNA synthetase  50.7 
 
 
510 aa  464  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1087  prolyl-tRNA synthetase  52.32 
 
 
476 aa  459  9.999999999999999e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.723439  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0039  prolyl-tRNA synthetase  50.3 
 
 
508 aa  461  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2058  prolyl-tRNA synthetase  48.2 
 
 
508 aa  456  1e-127  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl476  prolyl-tRNA synthetase  44.79 
 
 
473 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18002  predicted protein  52.43 
 
 
448 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.938893  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0318  prolyl-tRNA synthetase  44.21 
 
 
474 aa  445  1e-123  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.237485  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3132  prolyl-tRNA synthetase  48.61 
 
 
484 aa  437  1e-121  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.778775  normal  0.421139 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2528  prolyl-tRNA synthetase  49.48 
 
 
493 aa  434  1e-120  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3199  prolyl-tRNA synthetase  48.64 
 
 
493 aa  435  1e-120  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0777  prolyl-tRNA synthetase  49.17 
 
 
491 aa  433  1e-120  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.941817 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0034  prolyl-tRNA synthetase  45.97 
 
 
506 aa  434  1e-120  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.599841 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1192  prolyl-tRNA synthetase  50.68 
 
 
468 aa  430  1e-119  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107795  normal  0.0912472 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2180  prolyl-tRNA synthetase  51.57 
 
 
468 aa  427  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0348  prolyl-tRNA synthetase  51.02 
 
 
471 aa  424  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0147635 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1303  prolyl-tRNA synthetase  50.9 
 
 
468 aa  423  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4267  prolyl-tRNA synthetase  53.6 
 
 
468 aa  419  1e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.975115  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43097  predicted protein  47.06 
 
 
671 aa  417  9.999999999999999e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2695  prolyl-tRNA synthetase  47.33 
 
 
484 aa  414  1e-114  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000655749  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf031  prolyl-tRNA synthetase  43.36 
 
 
476 aa  409  1e-113  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84407  proline-tRNA ligase  41.26 
 
 
682 aa  404  1e-111  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_19561  predicted protein  41.41 
 
 
524 aa  401  9.999999999999999e-111  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000000000368339  normal  0.864068 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02150  prolyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_2G16010)  42.26 
 
 
594 aa  384  1e-105  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05640  proline-tRNA ligase, putative  40.32 
 
 
740 aa  383  1e-105  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.835718  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1950  prolyl-tRNA synthetase  43.08 
 
 
515 aa  372  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_23547  predicted protein  42.49 
 
 
479 aa  367  1e-100  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.034898  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1230  prolyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 
527 aa  362  1e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.448186  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0487  prolyl-tRNA synthetase  39.17 
 
 
472 aa  345  8e-94  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0179  prolyl-tRNA synthetase  39.03 
 
 
480 aa  342  9e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.732046 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0817  prolyl-tRNA synthetase  41.49 
 
 
482 aa  329  9e-89  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1386  prolyl-tRNA synthetase  38.51 
 
 
477 aa  326  6e-88  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.399979  normal  0.968589 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0728  prolyl-tRNA synthetase  40.21 
 
 
465 aa  325  1e-87  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.102661  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1963  prolyl-tRNA synthetase  39.47 
 
 
478 aa  318  2e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.914598 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0190  prolyl-tRNA synthetase  37.13 
 
 
478 aa  315  8e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.15585  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2042  prolyl-tRNA synthetase  39.51 
 
 
477 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1972  prolyl-tRNA synthetase  39.24 
 
 
481 aa  312  7.999999999999999e-84  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1139  prolyl-tRNA synthetase  36.67 
 
 
478 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1092  prolyl-tRNA synthetase  38.56 
 
 
487 aa  305  9.000000000000001e-82  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1921  prolyl-tRNA synthetase  38.08 
 
 
480 aa  304  2.0000000000000002e-81  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1640  prolyl-tRNA synthetase  36.19 
 
 
478 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1366  prolyl-tRNA synthetase  39.05 
 
 
487 aa  303  5.000000000000001e-81  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0822  prolyl-tRNA synthetase  38.61 
 
 
488 aa  299  8e-80  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.62191  normal  0.0638308 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0803  prolyl-tRNA synthetase  37.68 
 
 
488 aa  299  1e-79  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0138093  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0945  prolyl-tRNA synthetase  38.53 
 
 
479 aa  296  4e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.258723  normal  0.604975 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1574  prolyl-tRNA synthetase  38.52 
 
 
461 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.167911  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1723  prolyl-tRNA synthetase  37.68 
 
 
460 aa  279  8e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.612812 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0880  prolyl-tRNA synthetase  38.27 
 
 
460 aa  276  7e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.276664  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0188  prolyl-tRNA synthetase  37.2 
 
 
460 aa  273  7e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0234  prolyl-tRNA synthetase  39.53 
 
 
456 aa  271  1e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1635  prolyl-tRNA synthetase  32.72 
 
 
481 aa  271  2e-71  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0744  prolyl-tRNA synthetase  27.01 
 
 
445 aa  99  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1852  prolyl-tRNA synthetase  24.88 
 
 
451 aa  89.4  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.116732 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1407  prolyl-tRNA synthetase  33.15 
 
 
603 aa  86.3  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.116406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>