More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0077 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2795  extracellular solute-binding protein family 5  85.17 
 
 		 499 aa  855    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.730452 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0077  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 501 aa  1023    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  37.18 
 
 		 508 aa  308  1.0000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3437  extracellular solute-binding protein  37.71 
 
 		 492 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.58601  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0810  extracellular solute-binding protein  39.3 
 
 		 489 aa  308  2.0000000000000002e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1313  extracellular solute-binding protein  38.74 
 
 		 493 aa  306  7e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1288  extracellular solute-binding protein  37.55 
 
 		 492 aa  304  3.0000000000000004e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213997  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1012  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.68 
 
 		 492 aa  298  1e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622148  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0954  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.68 
 
 		 479 aa  298  1e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0782  extracellular solute-binding protein  37.04 
 
 		 494 aa  291  2e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.319175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3619  extracellular solute-binding protein  37.31 
 
 		 495 aa  282  9e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.43082  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4491  extracellular solute-binding protein family 5  33.6 
 
 		 509 aa  280  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4354  extracellular solute-binding protein family 5  36.53 
 
 		 497 aa  280  5e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.148655  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4201  extracellular solute-binding protein family 5  34.78 
 
 		 508 aa  279  9e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4355  extracellular solute-binding protein family 5  37.47 
 
 		 495 aa  273  6e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0355555  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0816  extracellular solute-binding protein family 5  37.14 
 
 		 496 aa  273  6e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0887  extracellular solute-binding protein  37.14 
 
 		 496 aa  273  6e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.545524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0139  extracellular solute-binding protein  37.78 
 
 		 502 aa  273  7e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.184027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6472  putative oligopeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  34.8 
 
 		 495 aa  258  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.149439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5441  extracellular solute-binding protein  36.04 
 
 		 497 aa  253  6e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.876365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3049  extracellular solute-binding protein family 5  34.85 
 
 		 503 aa  240  5e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0919  dipeptide ABC transporter periplasmic protein  32.4 
 
 		 539 aa  238  3e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.654123  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05920  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  32.96 
 
 		 507 aa  233  6e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0728022 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26350  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  31.7 
 
 		 526 aa  227  3e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.228589 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3152  extracellular solute-binding protein family 5  32.96 
 
 		 506 aa  225  1e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1058  extracellular solute-binding protein  30.04 
 
 		 563 aa  217  4e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.271211 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0459  extracellular solute-binding protein  31.52 
 
 		 504 aa  216  8e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.435025  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  29.71 
 
 		 522 aa  213  4.9999999999999996e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2769  extracellular solute-binding protein  30 
 
 		 507 aa  213  7.999999999999999e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12042  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0387  extracellular solute-binding protein family 5  29.48 
 
 		 503 aa  211  2e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000219856  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  30.75 
 
 		 505 aa  197  2.0000000000000003e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  30.12 
 
 		 502 aa  197  5.000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1933  extracellular solute-binding protein family 5  28.82 
 
 		 505 aa  195  2e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.22177  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1807  extracellular solute-binding protein family 5  28.86 
 
 		 528 aa  194  4e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1189  4-phytase  30.66 
 
 		 523 aa  187  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  34.96 
 
 		 520 aa  187  4e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3248  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  30.75 
 
 		 503 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336639  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3982  extracellular solute-binding protein  30.75 
 
 		 503 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2585  putative ABC transporter, substrate binding subunit  30.17 
 
 		 520 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598963 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  34.96 
 
 		 519 aa  180  4.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  29.94 
 
 		 510 aa  177  4e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  27.43 
 
 		 541 aa  176  7e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3635  extracellular solute-binding protein  34.02 
 
 		 515 aa  176  7e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.014259  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  32.71 
 
 		 510 aa  176  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0890  glutathione-binding protein GsiB  31.77 
 
 		 512 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362875  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1000  glutathione-binding protein GsiB  31.51 
 
 		 512 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  30.1 
 
 		 546 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  31.77 
 
 		 512 aa  173  5.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4534  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  30.19 
 
 		 504 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0979  glutathione-binding protein GsiB  31.51 
 
 		 512 aa  173  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0917  glutathione-binding protein GsiB  31.51 
 
 		 512 aa  173  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0950  glutathione-binding protein GsiB  31.51 
 
 		 512 aa  173  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  29.83 
 
 		 512 aa  173  7.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4831  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  29.93 
 
 		 527 aa  172  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.153883  normal  0.947205 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4877  putative ABC transporter, substrate binding protein  31.13 
 
 		 560 aa  172  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.674427  normal  0.0830201 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  31.49 
 
 		 512 aa  172  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  31.22 
 
 		 512 aa  171  3e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  31.22 
 
 		 512 aa  171  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  30 
 
 		 524 aa  171  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  31.22 
 
 		 512 aa  171  3e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00814  hypothetical protein  31.22 
 
 		 512 aa  170  4e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.840204  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2812  extracellular solute-binding protein family 5  31.22 
 
 		 512 aa  170  4e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.431185  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00797  predicted peptide transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  31.22 
 
 		 493 aa  170  5e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.719474  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1491  extracellular solute-binding protein family 5  32.03 
 
 		 514 aa  170  6e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.19 
 
 		 538 aa  169  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  31.51 
 
 		 524 aa  169  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  28.81 
 
 		 512 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  28.81 
 
 		 512 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2814  extracellular solute-binding protein  31.22 
 
 		 512 aa  168  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.993061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  28.81 
 
 		 512 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  33.42 
 
 		 544 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  27.91 
 
 		 533 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  28.02 
 
 		 534 aa  167  5e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  31.62 
 
 		 538 aa  167  5e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  30.06 
 
 		 505 aa  167  5e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0939  extracellular solute-binding protein  30.14 
 
 		 517 aa  167  5e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  33.78 
 
 		 511 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5070  extracellular solute-binding protein  32.67 
 
 		 495 aa  166  8e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.27843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0111  extracellular solute-binding protein family 5  29.69 
 
 		 517 aa  166  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2974  extracellular solute-binding protein family 5  31.87 
 
 		 514 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4211  extracellular solute-binding protein  29.31 
 
 		 504 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0744589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1324  extracellular solute-binding protein  32.11 
 
 		 512 aa  166  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.725738 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2547  extracellular solute-binding protein  30.43 
 
 		 534 aa  166  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  28.81 
 
 		 510 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0453  4-phytase  29.13 
 
 		 526 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  33.67 
 
 		 509 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  31.29 
 
 		 528 aa  164  3e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  27.34 
 
 		 534 aa  164  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1526  extracellular solute-binding protein  28.09 
 
 		 544 aa  164  4.0000000000000004e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4254  extracellular solute-binding protein  29.21 
 
 		 527 aa  164  4.0000000000000004e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.340537  normal  0.123719 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3221  extracellular solute-binding protein  26.78 
 
 		 517 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4294  extracellular solute-binding protein  28.67 
 
 		 530 aa  163  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.502669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  30.59 
 
 		 540 aa  162  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4859  putative ABC transporter, substrate-binding protein  27.04 
 
 		 532 aa  161  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  27.45 
 
 		 544 aa  161  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7558  putative dipeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  26.73 
 
 		 515 aa  161  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  29.09 
 
 		 515 aa  160  4e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2497  extracellular solute-binding protein family 5  30.73 
 
 		 528 aa  160  4e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0778602 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  30.25 
 
 		 495 aa  160  5e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7214  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  28.98 
 
 		 532 aa  160  5e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>