More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0053 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_0053  DNA replication and repair protein RecF  100 
 
 		 347 aa  684    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2998  DNA replication and repair protein RecF  73 
 
 		 357 aa  501  1e-141  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0957887  normal  0.356139 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1620  recombination protein F  42 
 
 		 358 aa  218  1e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.251361 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0003  DNA replication and repair protein RecF  37.12 
 
 		 360 aa  199  6e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.447101  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0004  recombination protein F  32.43 
 
 		 371 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.106759  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0003  DNA replication and repair protein RecF  34.12 
 
 		 365 aa  171  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.390569  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0003  recombination protein F  35.11 
 
 		 370 aa  169  5e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.715959  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0004  DNA replication and repair protein RecF  30.68 
 
 		 386 aa  169  7e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00780262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0004  DNA replication and repair protein RecF  29.71 
 
 		 376 aa  166  5e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0004  DNA replication and repair protein RecF  29.77 
 
 		 360 aa  163  4.0000000000000004e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0004  recombination protein F  28.45 
 
 		 361 aa  161  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0004  recombination protein F  28.45 
 
 		 361 aa  161  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0004  recombination protein F  32.14 
 
 		 374 aa  159  6e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.60396e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0004  recombination protein F  30.88 
 
 		 375 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000104808  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0004  recombination protein F  30.88 
 
 		 375 aa  157  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.864622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0004  recombination protein F  30.88 
 
 		 375 aa  157  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0004  recombination protein F  31.43 
 
 		 370 aa  157  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.188075  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0004  recombination protein F  31.43 
 
 		 370 aa  157  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.320094  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0004  recombination protein F  30.88 
 
 		 375 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0004  recombination protein F  30.88 
 
 		 375 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0004  recombination protein F  30.88 
 
 		 375 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.340003 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0003  DNA replication and repair protein RecF  34.75 
 
 		 372 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2550  recombination protein F  31.81 
 
 		 371 aa  156  6e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0191996  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0004  DNA replication and repair protein RecF  35.16 
 
 		 371 aa  156  6e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244423  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5316  recombination protein F  30.59 
 
 		 375 aa  155  9e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0155044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0003  DNA replication and repair protein RecF  30.81 
 
 		 369 aa  155  9e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0749386  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0004  recombination protein F  31.3 
 
 		 373 aa  155  9e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.177605  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0004  recombination protein F  30.59 
 
 		 375 aa  155  9e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0003  DNA replication and repair protein RecF  33.43 
 
 		 358 aa  155  1e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0003  recombination protein F  30.2 
 
 		 364 aa  154  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0004  recombination protein F  30.31 
 
 		 375 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2156  recombination protein F  30.92 
 
 		 369 aa  153  5e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000779125  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0003  DNA replication and repair protein RecF  34.92 
 
 		 372 aa  152  8e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0004  recombination protein F  30.55 
 
 		 375 aa  151  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0003  DNA replication and repair protein RecF  32.33 
 
 		 364 aa  150  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0004  DNA replication and repair protein RecF  30.77 
 
 		 373 aa  150  4e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0003  DNA replication and repair protein RecF  29.55 
 
 		 365 aa  149  5e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0004  recombination protein F  31.23 
 
 		 374 aa  149  8e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2374  DNA replication and repair protein RecF  28.49 
 
 		 369 aa  149  9e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0003  DNA replication and repair protein RecF  31.87 
 
 		 382 aa  149  9e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0003  DNA replication and repair protein RecF  35.76 
 
 		 369 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.979634 
 
 
-
 
NC_002620  TC0346  recombination protein F  30.72 
 
 		 365 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00040  DNA replication and repair protein RecF  31.44 
 
 		 375 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0003  recombination protein F  31.42 
 
 		 364 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1772  DNA replication and repair protein RecF  31.81 
 
 		 371 aa  147  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0004  DNA replication and repair protein RecF  33.42 
 
 		 397 aa  146  6e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0004  DNA replication and repair protein RecF  31.92 
 
 		 398 aa  145  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0003  DNA replication and repair protein RecF  25.41 
 
 		 362 aa  144  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000115018  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00040  DNA replication and repair protein RecF  30.36 
 
 		 414 aa  144  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0003  DNA replication and repair protein RecF  29.55 
 
 		 370 aa  144  3e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0004  DNA replication and repair protein RecF  36.02 
 
 		 399 aa  144  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0005  DNA replication and repair protein RecF  33.43 
 
 		 370 aa  143  4e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000369508  hitchhiker  0.000000145417 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0003  DNA replication and repair protein RecF  36 
 
 		 372 aa  143  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3722  DNA replication and repair protein RecF  34.49 
 
 		 385 aa  142  6e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000891221  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0434  DNA replication and repair protein RecF  34.5 
 
 		 392 aa  141  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.626531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0004  recombination protein F  34.08 
 
 		 386 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187663 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2238  recombination protein F  31.5 
 
 		 359 aa  141  1.9999999999999998e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1991  recombination protein F  31.99 
 
 		 366 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00040  recombination protein F  33.6 
 
 		 390 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0000332989  normal  0.373412 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0003  RecF protein  30.53 
 
 		 364 aa  140  3e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.056932  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0003  recombination protein F  32.04 
 
 		 365 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0003  DNA replication and repair protein RecF  30.85 
 
 		 363 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0005  DNA replication and repair protein RecF  34.25 
 
 		 401 aa  139  8.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0002  recombination protein F  33.02 
 
 		 365 aa  139  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0004  DNA replication and repair protein RecF  33.24 
 
 		 381 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.321306  normal  0.933031 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0004  recombination protein F  27 
 
 		 362 aa  138  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0002  RecF protein  32.67 
 
 		 369 aa  137  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000642266  normal  0.645599 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10003  recombination protein F  33.7 
 
 		 385 aa  137  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0004  DNA replication and repair protein RecF  33.06 
 
 		 378 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.332828  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0004  recombination protein F  30.57 
 
 		 374 aa  138  2e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0004  recombination protein F  27.99 
 
 		 372 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0003  recombination protein F  31.79 
 
 		 368 aa  137  4e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00792918  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0003  recombination protein F  33.06 
 
 		 371 aa  137  4e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0004  recombination protein F  32.71 
 
 		 399 aa  136  5e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000897119  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0004  DNA replication and repair protein RecF  34.21 
 
 		 377 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.780515  decreased coverage  0.00205006 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0824  recombination protein F  32.96 
 
 		 389 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0004  DNA replication and repair protein RecF  29.24 
 
 		 363 aa  135  9.999999999999999e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0015  recombination protein F  29.83 
 
 		 360 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00214178  hitchhiker  0.000779425 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00030  DNA replication and repair protein RecF  31.63 
 
 		 414 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0950556  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0004  DNA replication and repair protein RecF  33.13 
 
 		 374 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0004  recombination protein F  29.6 
 
 		 374 aa  134  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09773  putative DNA replication and repair protein  25.84 
 
 		 359 aa  134  3e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.753312  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0004  recombination protein F  33.8 
 
 		 377 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0533102  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0003  recombination protein F  29.06 
 
 		 360 aa  133  5e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0851424  hitchhiker  0.00000000117147 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0003  DNA repair and genetic recombination protein  31.81 
 
 		 365 aa  133  5e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0003  recombination protein F  29.06 
 
 		 360 aa  132  6e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133569  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0003  recombination protein F  29.06 
 
 		 360 aa  132  6e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0219866  hitchhiker  0.0042678 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0005  Recombinational DNA repair ATPase (RecF pathway)- like protein  31.35 
 
 		 390 aa  132  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0003  recombination protein F  28.77 
 
 		 360 aa  133  6e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00706398  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0004  recombination protein F  29.07 
 
 		 401 aa  132  6.999999999999999e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.582462  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3391  recombination protein F  32.45 
 
 		 376 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2750  DNA replication and repair protein RecF  33.33 
 
 		 387 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.433504  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0003  recombination protein F  29.06 
 
 		 360 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0977543  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0003  DNA replication and repair protein RecF  27.79 
 
 		 363 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0752559  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0025  DNA replication and repair protein RecF  29.82 
 
 		 386 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0498  hypothetical protein  29.27 
 
 		 370 aa  130  3e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0214  DNA replication and repair protein RecF  27.25 
 
 		 359 aa  130  4.0000000000000003e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.613838  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0004  DNA replication and repair protein RecF  27.95 
 
 		 372 aa  129  6e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370076  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0004  recombination protein F  31.13 
 
 		 402 aa  129  8.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000215476 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0004  recombination protein F  34.15 
 
 		 371 aa  129  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00656338  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>