More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0041 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0041  branched-chain amino acid aminotransferase  100 
 
 
319 aa  662    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2994  branched-chain amino acid aminotransferase  83.96 
 
 
319 aa  577  1.0000000000000001e-163  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.127266  normal  0.646226 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1818  branched-chain amino acid aminotransferase  51.32 
 
 
307 aa  332  5e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.774485  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1533  branched-chain amino acid aminotransferase  51.32 
 
 
307 aa  330  1e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0264  branched-chain amino acid aminotransferase  52.81 
 
 
312 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0201  branched-chain amino acid aminotransferase  52.15 
 
 
312 aa  322  5e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0203  branched-chain amino acid aminotransferase  51.16 
 
 
312 aa  321  9.000000000000001e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0493  branched-chain amino acid aminotransferase  51.66 
 
 
306 aa  320  3e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785071  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2699  branched-chain amino acid aminotransferase  50.99 
 
 
306 aa  319  3.9999999999999996e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0182  branched-chain amino acid aminotransferase  51.49 
 
 
312 aa  319  3.9999999999999996e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392478  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0567  branched-chain amino acid aminotransferase  51.32 
 
 
309 aa  318  5e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.83417 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3552  branched-chain amino acid aminotransferase  51.16 
 
 
307 aa  316  3e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0190  branched-chain amino acid aminotransferase  53 
 
 
307 aa  316  3e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0136  branched-chain amino acid aminotransferase  50.5 
 
 
309 aa  315  7e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0596945  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0316  branched-chain amino acid aminotransferase  50.83 
 
 
312 aa  313  1.9999999999999998e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0301  branched-chain amino acid aminotransferase  50.33 
 
 
306 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.471777  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0147  branched-chain amino acid aminotransferase  51.32 
 
 
313 aa  313  2.9999999999999996e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.65778  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2475  branched-chain amino acid aminotransferase  51.64 
 
 
313 aa  312  3.9999999999999997e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0505  branched-chain amino acid aminotransferase  52.63 
 
 
307 aa  311  1e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.527203  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0626  branched-chain amino acid aminotransferase  49.67 
 
 
306 aa  310  1e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000994351  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0254  branched-chain amino acid aminotransferase  50 
 
 
317 aa  309  4e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.925789  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1301  branched-chain amino acid aminotransferase  50.84 
 
 
296 aa  309  4e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0767028 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0667  branched-chain amino acid aminotransferase  50.17 
 
 
307 aa  308  8e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.541959 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1863  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  51.99 
 
 
305 aa  306  3e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2134  branched-chain amino acid aminotransferase  50 
 
 
307 aa  305  7e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0456  branched-chain amino acid aminotransferase  48.84 
 
 
307 aa  305  7e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.940058  normal  0.29974 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5962  branched-chain amino acid aminotransferase  50.5 
 
 
307 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1209  branched-chain amino acid aminotransferase  48.68 
 
 
306 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2660  branched-chain amino acid aminotransferase  50.5 
 
 
307 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351839  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0777  branched-chain amino acid aminotransferase  50.33 
 
 
307 aa  304  1.0000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2020  branched-chain amino acid aminotransferase  50.5 
 
 
307 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2631  branched-chain amino acid aminotransferase  50.5 
 
 
307 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.66412  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2349  branched-chain amino acid aminotransferase  50.33 
 
 
306 aa  303  2.0000000000000002e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.888959  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1102  branched-chain amino acid aminotransferase  50.83 
 
 
317 aa  302  4.0000000000000003e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0534  branched-chain amino acid aminotransferase  48.34 
 
 
308 aa  302  4.0000000000000003e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2268  branched-chain amino acid aminotransferase  50.33 
 
 
307 aa  303  4.0000000000000003e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0506  branched-chain amino acid aminotransferase  50.49 
 
 
316 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.309351  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2679  branched-chain amino acid aminotransferase  49.16 
 
 
312 aa  301  8.000000000000001e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3280  branched-chain amino acid aminotransferase  49.17 
 
 
307 aa  301  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3294  branched-chain amino acid aminotransferase  49.01 
 
 
306 aa  301  1e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.845143 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0703  branched-chain amino acid aminotransferase  49.67 
 
 
307 aa  301  1e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0316871  hitchhiker  0.000000451168 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0547  branched-chain amino acid aminotransferase  49.67 
 
 
307 aa  301  1e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0660  branched-chain amino acid aminotransferase  49.17 
 
 
307 aa  301  1e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256122  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1449  branched-chain amino acid aminotransferase  48.18 
 
 
308 aa  301  1e-80  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.295507  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0034  branched-chain amino acid aminotransferase  49.17 
 
 
307 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0293  branched-chain amino acid aminotransferase  49.17 
 
 
307 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0981  branched-chain amino acid aminotransferase  48.84 
 
 
309 aa  300  2e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000156201 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0992  branched-chain amino acid aminotransferase  49.17 
 
 
307 aa  300  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.631035  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0830  branched-chain amino acid aminotransferase  49.17 
 
 
307 aa  300  2e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2421  branched-chain amino acid aminotransferase  49.17 
 
 
307 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0834  branched-chain amino acid aminotransferase  49.17 
 
 
307 aa  300  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245498  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0588  branched-chain amino acid aminotransferase  49.17 
 
 
307 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0686  branched-chain amino acid aminotransferase  48.84 
 
 
307 aa  300  3e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2143  branched-chain amino acid aminotransferase  49.01 
 
 
306 aa  300  3e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2551  branched-chain amino acid aminotransferase  49.83 
 
 
307 aa  299  4e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.317698  normal  0.771861 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2678  branched-chain amino acid aminotransferase  49.83 
 
 
307 aa  299  4e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1550  branched-chain amino acid aminotransferase  49.16 
 
 
309 aa  299  5e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1962  branched-chain amino acid aminotransferase  49.16 
 
 
308 aa  299  5e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.981543 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0360  branched-chain amino acid aminotransferase  48.34 
 
 
310 aa  298  8e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.270933  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0464  branched-chain amino acid aminotransferase  48.34 
 
 
306 aa  298  1e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0855  branched-chain amino acid aminotransferase  49 
 
 
304 aa  296  2e-79  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3547  branched-chain amino acid aminotransferase  47.49 
 
 
311 aa  295  5e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2109  branched-chain amino acid aminotransferase  48.33 
 
 
304 aa  295  5e-79  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0065  branched-chain amino acid aminotransferase  50 
 
 
307 aa  295  7e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1108  branched-chain amino acid aminotransferase  50.5 
 
 
304 aa  295  7e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0578  branched-chain amino acid aminotransferase  48.01 
 
 
307 aa  295  8e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0382856 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44880  branched-chain amino acid aminotransferase  49.17 
 
 
307 aa  294  1e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419974  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1179  branched-chain amino acid aminotransferase  50.17 
 
 
304 aa  294  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1052  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  50.83 
 
 
304 aa  294  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0193  branched-chain amino acid aminotransferase  50.5 
 
 
307 aa  293  2e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2344  branched-chain amino acid aminotransferase  48.34 
 
 
306 aa  291  9e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1060  branched-chain amino acid aminotransferase  48.34 
 
 
305 aa  291  1e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1216  branched-chain amino acid aminotransferase  47.21 
 
 
309 aa  290  2e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00270183 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002039  branched-chain amino acid aminotransferase  49.01 
 
 
312 aa  290  2e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0304  branched-chain amino acid aminotransferase  47.83 
 
 
307 aa  290  3e-77  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66260  branched-chain amino acid aminotransferase  45.87 
 
 
307 aa  289  4e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1537  branched-chain amino acid aminotransferase  49.17 
 
 
308 aa  289  5.0000000000000004e-77  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5748  branched-chain amino acid aminotransferase  45.87 
 
 
307 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0549  branched-chain amino acid aminotransferase  47.85 
 
 
303 aa  289  5.0000000000000004e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000680418  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4078  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  49 
 
 
304 aa  288  6e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3219  branched-chain amino acid aminotransferase  47.68 
 
 
306 aa  288  9e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000260212  normal  0.0812213 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1404  branched-chain amino acid aminotransferase  46.71 
 
 
304 aa  288  1e-76  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1176  branched-chain amino acid aminotransferase  46.56 
 
 
309 aa  288  1e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.0000401768 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4443  branched-chain amino acid aminotransferase  48 
 
 
307 aa  287  2e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00412  branched-chain amino acid aminotransferase  48.34 
 
 
312 aa  287  2e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2135  branched-chain amino acid aminotransferase  45.87 
 
 
311 aa  286  2.9999999999999996e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1707  branched-chain amino acid aminotransferase  46.49 
 
 
304 aa  285  1.0000000000000001e-75  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0318  branched-chain amino acid aminotransferase  45.72 
 
 
304 aa  283  3.0000000000000004e-75  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1109  branched-chain amino acid aminotransferase  46.33 
 
 
312 aa  283  3.0000000000000004e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00000000000646452  normal  0.0889333 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1779  branched-chain amino acid aminotransferase  48.83 
 
 
303 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.059153  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0607  branched-chain amino acid aminotransferase  46.53 
 
 
303 aa  282  4.0000000000000003e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000582891  decreased coverage  0.00306589 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0291  branched-chain amino acid aminotransferase  46.15 
 
 
307 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0296  branched-chain amino acid aminotransferase  45.39 
 
 
304 aa  282  5.000000000000001e-75  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3774  branched-chain amino acid aminotransferase  46.71 
 
 
308 aa  281  1e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.694412  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  45.87 
 
 
303 aa  281  1e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1099  branched-chain amino acid aminotransferase  46.67 
 
 
307 aa  280  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0192  branched-chain amino acid aminotransferase  47.18 
 
 
304 aa  280  2e-74  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.749275 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0347  branched-chain amino acid aminotransferase  46.82 
 
 
309 aa  280  2e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2490  branched-chain amino acid aminotransferase  47.02 
 
 
319 aa  280  3e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4293  branched-chain amino acid aminotransferase  46.71 
 
 
309 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>