More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0035 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_3001  primosomal protein N'  62.94 
 
 		 723 aa  852    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.380738  normal  0.338473 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0035  primosomal protein N'  100 
 
 		 732 aa  1443    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0271  primosomal protein N'  40.11 
 
 		 841 aa  304  3.0000000000000004e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1332  primosomal protein N'  28.08 
 
 		 749 aa  200  7.999999999999999e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000143785  normal  0.287743 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0179  primosome assembly protein PriA  29.58 
 
 		 734 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0672  primosomal protein N'  28.93 
 
 		 835 aa  194  6e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00593856 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3601  primosome assembly protein PriA  28.52 
 
 		 732 aa  192  2.9999999999999997e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.550659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0427  primosome assembly protein PriA  29.9 
 
 		 738 aa  191  4e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3986  primosomal protein N'  27.85 
 
 		 848 aa  189  1e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0840  primosome assembly protein PriA  30.2 
 
 		 729 aa  188  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00727054 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1197  primosome assembly protein PriA  26.69 
 
 		 849 aa  188  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1527  primosomal protein N'  23.8 
 
 		 818 aa  186  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.590711  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0176  primosome assembly protein PriA  28.96 
 
 		 736 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1758  primosomal protein N'  24.38 
 
 		 732 aa  183  8.000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0554  primosome assembly protein PriA  28.82 
 
 		 735 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.940906  normal  0.348137 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2915  primosome assembly protein PriA  25.91 
 
 		 914 aa  181  2.9999999999999997e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.1983  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1322  primosome assembly protein PriA  29.06 
 
 		 725 aa  179  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.658709  normal  0.25509 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1951  primosome assembly protein PriA  27.6 
 
 		 801 aa  178  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0167  primosomal protein N'  25.76 
 
 		 752 aa  177  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132621 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0535  primosome assembly protein PriA  28.27 
 
 		 738 aa  178  4e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.381236  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4311  primosome assembly protein PriA  26.73 
 
 		 732 aa  178  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4427  primosome assembly protein PriA  26.88 
 
 		 732 aa  178  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2498  primosome assembly protein PriA  28.73 
 
 		 733 aa  177  5e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.430233 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4425  primosome assembly protein PriA  26.88 
 
 		 732 aa  177  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.981494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1010  primosome assembly protein PriA  29.32 
 
 		 725 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3737  replication restart DNA helicase PriA  26.34 
 
 		 738 aa  176  9.999999999999999e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228486 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4495  primosome assembly protein PriA  26.75 
 
 		 732 aa  176  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0270  primosome assembly protein PriA  29.15 
 
 		 735 aa  175  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2156  primosome assembly protein PriA  25 
 
 		 781 aa  174  3.9999999999999995e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4341  primosome assembly protein PriA  26.75 
 
 		 732 aa  174  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.849244  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0758  primosome assembly protein PriA  29.03 
 
 		 725 aa  174  5e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.741976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2393  primosome assembly protein PriA  30.12 
 
 		 733 aa  174  5.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0560  primosome assembly protein PriA  29.82 
 
 		 730 aa  174  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.926963  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3121  primosome assembly protein PriA  26.86 
 
 		 825 aa  174  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2212  primosome assembly protein PriA  29.66 
 
 		 730 aa  173  9e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4122  primosomal protein N'  25.67 
 
 		 737 aa  173  1e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3495  primosomal protein N'  26.36 
 
 		 736 aa  173  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3672  primosomal protein N'  26.36 
 
 		 736 aa  173  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2053  primosome assembly protein PriA  30.13 
 
 		 727 aa  172  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.785816  normal  0.492845 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1614  primosome assembly protein PriA  29.81 
 
 		 754 aa  172  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802709  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4062  primosomal protein N'  29.12 
 
 		 804 aa  172  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.172877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1225  primosome assembly protein PriA  29.42 
 
 		 730 aa  172  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.241242 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3377  primosomal protein N'  24.47 
 
 		 831 aa  171  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0402  primosome assembly protein PriA  29.83 
 
 		 736 aa  172  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.106987 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0315  primosome assembly protein PriA  26.49 
 
 		 796 aa  171  5e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.169363  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4038  primosome assembly protein PriA  26.97 
 
 		 731 aa  171  5e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0377  primosome assembly protein PriA  28.21 
 
 		 746 aa  170  7e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0499  primosomal protein N'  26.32 
 
 		 731 aa  170  8e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001745  helicase PriA essential for oriC/DnaA-independent DNA replication  24.59 
 
 		 733 aa  170  9e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.579492  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3812  primosome assembly protein PriA  26.39 
 
 		 732 aa  169  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3778  primosomal protein N'  26.82 
 
 		 731 aa  169  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0185  primosomal protein N'  25.38 
 
 		 752 aa  169  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4099  primosome assembly protein PriA  26.26 
 
 		 732 aa  169  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1173  replication restart DNA helicase PriA  24.28 
 
 		 809 aa  169  2e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1061  primosome assembly protein PriA  25.2 
 
 		 804 aa  169  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.964371  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0457  primosomal protein N'  26.1 
 
 		 736 aa  169  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2149  primosome assembly protein PriA  26.6 
 
 		 733 aa  168  2.9999999999999998e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0116  primosome assembly protein PriA  26.26 
 
 		 732 aa  169  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3844  primosomal protein N'  26.2 
 
 		 731 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0485  primosome assembly protein PriA  29.71 
 
 		 730 aa  168  4e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148717 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2315  primosomal protein N'  25.41 
 
 		 747 aa  168  4e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101119  hitchhiker  0.00122833 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0760  primosomal protein N'  22.85 
 
 		 798 aa  168  4e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000570984  hitchhiker  0.00000745488 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0475  primosomal protein N'  26.2 
 
 		 731 aa  167  5e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1550  primosomal protein N'  23.92 
 
 		 824 aa  167  5e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.764668  normal  0.503728 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0603  primosome assembly protein PriA  29.28 
 
 		 759 aa  167  5e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.615341  normal  0.0181016 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0822  primosomal protein N'  27.88 
 
 		 723 aa  167  5.9999999999999996e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.102519  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0551  primosomal protein N'  26.03 
 
 		 731 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2239  primosome assembly protein PriA  25.98 
 
 		 733 aa  167  5.9999999999999996e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04038  primosome assembly protein PriA  30.42 
 
 		 740 aa  167  6.9999999999999995e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2869  primosomal protein N'  24.14 
 
 		 753 aa  167  9e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0959  primosomal protein N'  20.85 
 
 		 790 aa  167  9e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09880  primosomal protein N'  22.81 
 
 		 745 aa  166  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1703  primosomal protein N'  26.44 
 
 		 732 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2703  primosomal protein N'  28.94 
 
 		 866 aa  166  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3774  replication restart DNA helicase PriA  26.04 
 
 		 813 aa  166  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0372203  normal  0.148217 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0379  primosomal protein N'  26.33 
 
 		 731 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5088  primosome assembly protein PriA  30.1 
 
 		 739 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0566  replication restart DNA helicase PriA  23.42 
 
 		 815 aa  166  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00911754  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4126  primosomal protein N'  26.94 
 
 		 743 aa  166  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000536083  hitchhiker  0.00000144445 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00727  primosome assembly protein PriA  24.59 
 
 		 733 aa  166  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0496  primosomal protein N'  26.07 
 
 		 731 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2927  primosome assembly protein PriA  28.6 
 
 		 734 aa  165  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4961  primosome assembly protein PriA  30.1 
 
 		 739 aa  165  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0161  primosome assembly protein PriA  27.73 
 
 		 835 aa  165  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3946  primosome assembly protein PriA  27.52 
 
 		 738 aa  165  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339061  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0128  primosomal protein n`  26.58 
 
 		 751 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1396  primosome assembly protein PriA  26.01 
 
 		 798 aa  164  6e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1200  primosomal protein N  22.86 
 
 		 780 aa  164  7e-39  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0169  primosome assembly protein PriA  25.77 
 
 		 732 aa  164  7e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2378  primosome assembly protein PriA  28.3 
 
 		 735 aa  164  7e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0567  primosome assembly protein PriA  27.5 
 
 		 836 aa  164  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.973651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2251  primosome assembly protein PriA  25.62 
 
 		 734 aa  163  9e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.889331  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3657  primosome assembly protein PriA  28.15 
 
 		 738 aa  163  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1926  primosome assembly protein PriA  29.18 
 
 		 727 aa  163  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0448061  hitchhiker  0.000000000544837 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03820  primosome assembly protein PriA  26.29 
 
 		 732 aa  162  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.846253  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4050  primosomal protein N'  26.29 
 
 		 732 aa  162  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1804  primosome assembly protein PriA  25.86 
 
 		 744 aa  162  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.207657  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1417  primosomal protein N'  26.22 
 
 		 810 aa  162  2e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03769  hypothetical protein  26.29 
 
 		 732 aa  162  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880403  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1737  primosome assembly protein PriA  25.86 
 
 		 744 aa  162  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>