More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0016 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_0016  Polyprenyl synthetase  100 
 
 		 332 aa  657    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.24479 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0011  Polyprenyl synthetase  73.8 
 
 		 336 aa  471  1.0000000000000001e-131  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1618  polyprenyl synthetase  53.94 
 
 		 329 aa  291  1e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.399283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2351  polyprenyl synthetase  41.35 
 
 		 386 aa  186  4e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.777136 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2312  polyprenyl synthetase  41.35 
 
 		 386 aa  186  4e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2359  polyprenyl synthetase  41.35 
 
 		 386 aa  186  4e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.852076  normal  0.554984 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  36.47 
 
 		 364 aa  162  9e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0263779 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03940  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  36.53 
 
 		 354 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.530934 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1042  Dimethylallyltranstransferase  35.16 
 
 		 332 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0345  Polyprenyl synthetase  33 
 
 		 347 aa  146  4.0000000000000006e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2135  geranyltranstransferase  35.41 
 
 		 327 aa  141  9.999999999999999e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0551821  decreased coverage  0.00000978796 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0577  Polyprenyl synthetase  34.46 
 
 		 349 aa  140  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.25249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1604  Polyprenyl synthetase  34.38 
 
 		 343 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.643499 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1125  Polyprenyl synthetase  29.19 
 
 		 350 aa  132  6.999999999999999e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0728299  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3558  Polyprenyl synthetase  30.17 
 
 		 324 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1275  Polyprenyl synthetase  30.97 
 
 		 343 aa  126  6e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.360405  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2372  Polyprenyl synthetase  33.08 
 
 		 320 aa  125  9e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.550389  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0472  farnesyltranstransferase  33.45 
 
 		 327 aa  124  2e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0424008  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  31.85 
 
 		 322 aa  123  5e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2209  farnesyltranstransferase  32.32 
 
 		 325 aa  122  9e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5744  Dimethylallyltranstransferase  31.48 
 
 		 323 aa  120  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0840  dimethylallyltranstransferase  34.84 
 
 		 327 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1417  dimethylallyltranstransferase / geranyltranstransferase  30.3 
 
 		 321 aa  120  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000231045  decreased coverage  0.000138058 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2399  farnesyltranstransferase  31.58 
 
 		 322 aa  119  7e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0453989  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  31.23 
 
 		 317 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3672  Polyprenyl synthetase  30.11 
 
 		 323 aa  118  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00904172  normal  0.171557 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  34.69 
 
 		 322 aa  118  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1816  geranyltranstransferase  33.33 
 
 		 321 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.204305  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1235  Polyprenyl synthetase  34.59 
 
 		 330 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0461  geranyltranstransferase (farnesyl-diphosphate synthase)  28.32 
 
 		 325 aa  118  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.215839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3918  dimethylallyltranstransferase  34.21 
 
 		 342 aa  119  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996484 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  32.42 
 
 		 317 aa  117  3e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  31.51 
 
 		 326 aa  117  3e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0533  polyprenyl synthetase  34.32 
 
 		 338 aa  117  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.506738 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3032  trans-hexaprenyltranstransferase  30.22 
 
 		 345 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  33.48 
 
 		 317 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  33.89 
 
 		 317 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1983  octaprenyl diphosphate synthase  29.48 
 
 		 322 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.977315  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1186  polyprenyl synthetase  32.88 
 
 		 320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1849  trans-hexaprenyltranstransferase  30.91 
 
 		 323 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0769  Polyprenyl synthetase  32.52 
 
 		 327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3242  Polyprenyl synthetase  30.89 
 
 		 354 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.650754  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  30.63 
 
 		 323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2220  trans-hexaprenyltranstransferase  29.76 
 
 		 322 aa  114  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000307661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2412  Dimethylallyltranstransferase  34.9 
 
 		 322 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033108 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0340  trans-hexaprenyltranstransferase  27.44 
 
 		 321 aa  113  5e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104163  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  29.8 
 
 		 332 aa  112  8.000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1016  Polyprenyl synthetase  32.8 
 
 		 332 aa  112  8.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00162211  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4219  Trans-hexaprenyltranstransferase  33.2 
 
 		 345 aa  112  8.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1286  polyprenyl synthetase  32.36 
 
 		 338 aa  112  9e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.916051  normal  0.252037 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0863  trans-hexaprenyltranstransferase  28.02 
 
 		 343 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0603068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1844  Polyprenyl synthetase  31.86 
 
 		 321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0409  Polyprenyl synthetase  29.31 
 
 		 317 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000164225  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01980  putative isoprenoid biosynthesis related protein  29.3 
 
 		 324 aa  110  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0963  polyprenyl synthetase  29.35 
 
 		 324 aa  110  3e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728777  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0784  polyprenyl synthetase  31.15 
 
 		 325 aa  110  4.0000000000000004e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0510  dimethylallyltransferase  30.82 
 
 		 330 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0303508 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2886  farnesyltranstransferase  29.43 
 
 		 320 aa  109  5e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.435226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1263  polyprenyl synthetase  29.89 
 
 		 324 aa  109  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3742  farnesyltranstransferase  32.88 
 
 		 336 aa  109  7.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.326793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0840  trans-hexaprenyltranstransferase  31.93 
 
 		 327 aa  109  8.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.24671  normal  0.90387 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16070  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  30.89 
 
 		 362 aa  108  9.000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00352979  normal  0.115981 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  27.1 
 
 		 322 aa  107  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0868  trans-hexaprenyltranstransferase  29.55 
 
 		 323 aa  107  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000612724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1465  Polyprenyl synthetase  30.91 
 
 		 345 aa  107  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2538  Dimethylallyltranstransferase  30.5 
 
 		 349 aa  107  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0966  polyprenyl synthetase  30.93 
 
 		 331 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000309131  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3324  Polyprenyl synthetase  31.27 
 
 		 331 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000403675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1219  trans-hexaprenyltranstransferase  29.79 
 
 		 324 aa  107  3e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.581853 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0912  Polyprenyl synthetase  28.57 
 
 		 312 aa  107  3e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0418451  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1814  farnesyltranstransferase  28.35 
 
 		 322 aa  107  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1035  polyprenyl synthetase  30.93 
 
 		 331 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000587704  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1068  polyprenyl synthetase  30.93 
 
 		 331 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000253104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0566  polyprenyl synthetase family protein  31.76 
 
 		 297 aa  107  3e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.293627  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5487  polyprenyl synthetase  33.86 
 
 		 359 aa  107  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.057481  normal  0.26211 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  29.79 
 
 		 320 aa  107  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1267  farnesyltranstransferase  33.33 
 
 		 327 aa  107  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000414362  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4513  octaprenyl-diphosphate synthase  28.87 
 
 		 327 aa  106  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0181  polyprenyl synthetase  32.98 
 
 		 334 aa  106  5e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.375352 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0164  Trans-hexaprenyltranstransferase  31.66 
 
 		 325 aa  106  5e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0195554  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2004  Trans-hexaprenyltranstransferase  29.93 
 
 		 322 aa  106  5e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3090  trans-hexaprenyltranstransferase  30.38 
 
 		 323 aa  106  6e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0524  octaprenyl-diphosphate synthase  27.46 
 
 		 331 aa  106  7e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1003  polyprenyl synthetase  30.85 
 
 		 323 aa  105  7e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000127512  decreased coverage  0.00000500836 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0851  polyprenyl synthetase  29.83 
 
 		 323 aa  105  8e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000684066  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0645  polyprenyl synthetase family protein  31.37 
 
 		 297 aa  105  9e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0989219  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1430  Polyprenyl synthetase  34.9 
 
 		 368 aa  105  9e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.28506  normal  0.583365 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60470  octaprenyl-diphosphate synthase  31.49 
 
 		 322 aa  105  9e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.456687  normal  0.0384277 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0752  trans-hexaprenyltranstransferase  30.17 
 
 		 327 aa  105  9e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0130726 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5209  octaprenyl-diphosphate synthase  30.45 
 
 		 322 aa  105  9e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3278  polyprenyl synthetase  30.64 
 
 		 313 aa  105  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000293097 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3011  Polyprenyl synthetase  35.15 
 
 		 326 aa  105  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40810  Trans-hexaprenyltranstransferase  31.6 
 
 		 322 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.368005  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3739  trans-hexaprenyltranstransferase  28.62 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000225438  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1389  polyprenyl synthetase family protein  31.37 
 
 		 297 aa  105  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2049  Polyprenyl synthetase  29.89 
 
 		 346 aa  105  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.000493992  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3676  trans-hexaprenyltranstransferase  33.03 
 
 		 344 aa  105  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4493  polyprenyl synthetase  33.08 
 
 		 339 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000291603  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0890  polyprenyl synthetase  31.18 
 
 		 309 aa  103  3e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0253423 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1317  octaprenyl-diphosphate synthase  25.23 
 
 		 322 aa  103  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>