More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0012 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_0012  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  100 
 
 		 153 aa  317  6e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.121067  normal  0.063625 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0026  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  72.67 
 
 		 160 aa  222  2e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1880  RNA methyltransferase TrmH, group 2  54 
 
 		 155 aa  154  4e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000892134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1687  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  51.59 
 
 		 164 aa  150  4e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0138  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  49.67 
 
 		 153 aa  148  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0147773  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2133  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  52 
 
 		 154 aa  148  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0805  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  53.02 
 
 		 168 aa  148  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.309509 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4135  RNA methyltransferase  46.41 
 
 		 162 aa  147  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.438164  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4812  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  48.03 
 
 		 157 aa  147  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.799981  hitchhiker  0.00015333 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0075  RNA methyltransferase  46.41 
 
 		 162 aa  147  4e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0081  RNA methyltransferase  46.41 
 
 		 162 aa  147  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11010  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  48.68 
 
 		 162 aa  146  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0271045  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1629  tRNA/rRNA methyltransferase  45.1 
 
 		 161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0152  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  43.62 
 
 		 166 aa  144  5e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.143728  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1874  RNA methyltransferase TrmH, group 2  52.98 
 
 		 156 aa  144  5e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0129  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  46.71 
 
 		 157 aa  143  7.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.253397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0990  RNA methyltransferase  49.02 
 
 		 154 aa  143  8.000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.411714  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0099  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  46.05 
 
 		 157 aa  142  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0241  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  49.34 
 
 		 171 aa  142  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4034  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  46.05 
 
 		 157 aa  142  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0417  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  49.34 
 
 		 171 aa  142  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.897811  hitchhiker  0.000103614 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0990  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  44.3 
 
 		 172 aa  143  1e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3943  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  46.05 
 
 		 157 aa  142  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0238  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  50.66 
 
 		 153 aa  143  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.460006  normal  0.0379576 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03464  predicted rRNA methylase  46.05 
 
 		 157 aa  142  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1004  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  49.66 
 
 		 188 aa  142  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4979  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  46.05 
 
 		 157 aa  142  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0102  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  46.05 
 
 		 157 aa  142  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3818  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  46.05 
 
 		 157 aa  142  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03415  hypothetical protein  46.05 
 
 		 157 aa  142  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2205  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  51.63 
 
 		 152 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2268  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  51.63 
 
 		 152 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00048141  hitchhiker  0.0001006 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3912  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  46.71 
 
 		 157 aa  141  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4110  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  46.05 
 
 		 157 aa  142  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3194  RNA methyltransferase TrmH, group 2  52.63 
 
 		 153 aa  141  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00355106  hitchhiker  0.0000259155 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2182  RNA methyltransferase TrmH, group 2  47.02 
 
 		 154 aa  141  3e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00014694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4081  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  46.05 
 
 		 157 aa  140  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4019  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  46.05 
 
 		 157 aa  140  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.921331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3896  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  46.05 
 
 		 157 aa  140  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.282741 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3974  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  46.05 
 
 		 157 aa  140  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.818121 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2332  RNA methyltransferase  48.99 
 
 		 152 aa  140  6e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1836  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  51.66 
 
 		 152 aa  140  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.646648  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2417  hypothetical protein  45.64 
 
 		 149 aa  139  9e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2563  hypothetical protein  45.64 
 
 		 149 aa  139  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1127  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  47.02 
 
 		 153 aa  139  9.999999999999999e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2405  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  47.65 
 
 		 155 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000095272  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1130  putative tRNA/rRNA methyltransferase  47.37 
 
 		 177 aa  139  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00538  putative tRNA/rRNA methyltransferase  46.71 
 
 		 154 aa  139  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0763  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  45.03 
 
 		 152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.635512  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1518  RNA methyltransferase  43.62 
 
 		 153 aa  138  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4242  RNA methyltransferase  46.36 
 
 		 154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.175929 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0462  RNA methyltransferase  49.66 
 
 		 162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2090  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  50.98 
 
 		 153 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000512947 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0602  RNA methyltransferase  49.66 
 
 		 162 aa  138  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.863015  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0548  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  49.66 
 
 		 162 aa  138  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.67047e-31 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0516  RNA methyltransferase  49.66 
 
 		 162 aa  138  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0459  RNA methyltransferase  49.66 
 
 		 162 aa  138  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.172229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0455  RNA methyltransferase  49.66 
 
 		 162 aa  138  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0547  RNA methyltransferase  49.66 
 
 		 162 aa  138  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0694927  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4754  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  49.66 
 
 		 162 aa  138  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0101258  hitchhiker  0.00000000000898658 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0623  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  49.66 
 
 		 162 aa  138  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0584  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  49.66 
 
 		 162 aa  138  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4609  TrmA family RNA methyltransferase  49.34 
 
 		 153 aa  138  3e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00112922  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0272  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  43.05 
 
 		 148 aa  137  3.9999999999999997e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1943  RNA methyltransferase  47.62 
 
 		 156 aa  137  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.158878  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1909  RNA methyltransferase  47.62 
 
 		 156 aa  137  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0507641  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3163  RNA methyltransferase  44.74 
 
 		 154 aa  137  4.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2088  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  50.67 
 
 		 154 aa  137  4.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.227987  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2823  RNA methyltransferase TrmH, group 2  48.34 
 
 		 161 aa  137  7e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00419688  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2141  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  47.13 
 
 		 160 aa  136  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4126  RNA methyltransferase  46.05 
 
 		 154 aa  135  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00837599  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0452  RNA methyltransferase  45.7 
 
 		 156 aa  136  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2267  rRNA methylase  46.05 
 
 		 158 aa  135  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00105703  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0307  RNA methyltransferase  46.71 
 
 		 154 aa  136  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4247  RNA methyltransferase  46.05 
 
 		 154 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0108586  hitchhiker  0.00213899 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0470  RNA methyltransferase  49.66 
 
 		 162 aa  135  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0127  RNA methyltransferase  47.65 
 
 		 164 aa  135  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00636988  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0272  RNA methyltransferase  44.37 
 
 		 156 aa  135  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1700  RNA methyltransferase  47.37 
 
 		 152 aa  135  2e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.295449  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1308  rRNA methylase-like protein cspR  42.95 
 
 		 153 aa  135  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3736  RNA methyltransferase  46.05 
 
 		 154 aa  135  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.607715 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3934  RNA methyltransferase  46.05 
 
 		 154 aa  135  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000097835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0432  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  48.32 
 
 		 152 aa  135  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.112018  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0450  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  47.97 
 
 		 152 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4529  RNA methyltransferase  45.39 
 
 		 154 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002216  tRNA (cytosine34-2'-O-)-methyltransferase  46.1 
 
 		 159 aa  134  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1538  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  47.02 
 
 		 170 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04710  RNA methyltransferase TrmH, group 2  46.05 
 
 		 153 aa  134  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.187102  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0413  RNA methyltransferase  44.37 
 
 		 153 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.85413 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2768  RNA methyltransferase  45.7 
 
 		 156 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0211  RNA methyltransferase  46.05 
 
 		 154 aa  134  4e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000450191  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5103  RNA methyltransferase  45.16 
 
 		 153 aa  134  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0540  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  47.02 
 
 		 156 aa  134  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.699614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2906  RNA methyltransferase  45.7 
 
 		 170 aa  134  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0213  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  46.05 
 
 		 154 aa  134  5e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.653568  normal  0.505987 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2862  RNA methyltransferase  45.7 
 
 		 156 aa  134  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.427649 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6180  RNA methyltransferase TrmH, group 2  45.7 
 
 		 156 aa  134  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67710  putative rRNA methylase  46.05 
 
 		 153 aa  134  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000281538  normal  0.793348 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3807  RNA methyltransferase  45.39 
 
 		 154 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.509614  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0194  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  46.71 
 
 		 156 aa  133  7.000000000000001e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.141115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>