More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0004 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0004  pyruvate kinase  83.33 
 
 
474 aa  793    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.328541  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0004  pyruvate kinase  100 
 
 
474 aa  944    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00236484  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0005  pyruvate kinase  64.33 
 
 
482 aa  596  1e-169  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0168768  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1266  pyruvate kinase  48.72 
 
 
585 aa  449  1e-125  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000010731  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0098  pyruvate kinase  50.84 
 
 
594 aa  450  1e-125  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2211  pyruvate kinase  51.6 
 
 
471 aa  448  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0824427 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1179  pyruvate kinase  51.59 
 
 
476 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2312  pyruvate kinase  49.47 
 
 
583 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2953  Pyruvate kinase  52.23 
 
 
476 aa  443  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0833  pyruvate kinase  50.31 
 
 
479 aa  442  1e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.117468  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0178  pyruvate kinase  50.53 
 
 
474 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1694  pyruvate kinase  48.94 
 
 
589 aa  435  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1867  pyruvate kinase  50.85 
 
 
582 aa  437  1e-121  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3452  pyruvate kinase  48.63 
 
 
488 aa  437  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.824418  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3162  pyruvate kinase  50.53 
 
 
477 aa  437  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0597738  normal  0.419031 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3155  pyruvate kinase  49.47 
 
 
492 aa  437  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.561746 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3440  pyruvate kinase  49.89 
 
 
601 aa  434  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.386221 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5962  pyruvate kinase  49.79 
 
 
478 aa  435  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814276  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3295  pyruvate kinase  48.41 
 
 
487 aa  433  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101413  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1436  pyruvate kinase  49.47 
 
 
494 aa  432  1e-120  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.952527  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3482  pyruvate kinase  49.25 
 
 
492 aa  434  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.587472  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0815  pyruvate kinase  47.12 
 
 
583 aa  432  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417655 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03220  pyruvate kinase  47.87 
 
 
584 aa  433  1e-120  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000682258  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1195  pyruvate kinase., pyruvate, water dikinase  47.45 
 
 
583 aa  434  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000647409  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1461  pyruvate kinase  50.96 
 
 
474 aa  429  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.566125  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1063  pyruvate kinase  49.36 
 
 
483 aa  431  1e-119  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1428  pyruvate kinase  50.42 
 
 
478 aa  429  1e-119  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262848  hitchhiker  0.00576902 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0381  pyruvate kinase  49.04 
 
 
578 aa  429  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2926  pyruvate kinase  48.84 
 
 
587 aa  430  1e-119  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2569  pyruvate kinase  46.17 
 
 
580 aa  431  1e-119  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0396442  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0728  pyruvate kinase  51.48 
 
 
483 aa  431  1e-119  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.201777  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3020  pyruvate kinase  49.58 
 
 
487 aa  429  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111812  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2862  pyruvate kinase  50.32 
 
 
476 aa  422  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222457  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4729  pyruvate kinase  47.56 
 
 
585 aa  422  1e-117  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4492  pyruvate kinase  47.77 
 
 
585 aa  423  1e-117  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0550646  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4327  pyruvate kinase  47.77 
 
 
585 aa  423  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4339  pyruvate kinase  47.77 
 
 
585 aa  423  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.113971  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3524  pyruvate kinase  49.04 
 
 
592 aa  423  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3385  pyruvate kinase  49.26 
 
 
482 aa  422  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.468525  normal  0.558043 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0986  pyruvate kinase  48.5 
 
 
478 aa  424  1e-117  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.855047 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4673  pyruvate kinase  47.57 
 
 
477 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4724  pyruvate kinase  47.56 
 
 
585 aa  422  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4843  pyruvate kinase  47.77 
 
 
585 aa  423  1e-117  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2582  pyruvate kinase  49.04 
 
 
592 aa  423  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1423  pyruvate kinase  48.4 
 
 
477 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.379623  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4713  pyruvate kinase  47.77 
 
 
585 aa  423  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0392602 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1402  pyruvate kinase  48.41 
 
 
477 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.304037  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1218  pyruvate kinase  48.07 
 
 
478 aa  423  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0529  pyruvate kinase  47.77 
 
 
585 aa  424  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3282  pyruvate kinase  47.35 
 
 
585 aa  422  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.829257  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4428  pyruvate kinase  47.77 
 
 
585 aa  423  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4708  pyruvate kinase  47.77 
 
 
585 aa  424  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2208  pyruvate kinase  48.2 
 
 
590 aa  425  1e-117  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1165  pyruvate kinase  47.67 
 
 
478 aa  419  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1182  pyruvate kinase  48.62 
 
 
481 aa  420  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3090  pyruvate kinase  49.25 
 
 
479 aa  421  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1678  pyruvate kinase  51.81 
 
 
471 aa  420  1e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0855403  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3702  pyruvate kinase  48.83 
 
 
497 aa  418  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0596651 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3905  pyruvate kinase  48.95 
 
 
600 aa  420  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.252836 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3834  pyruvate kinase  49.37 
 
 
477 aa  421  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705924  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45050  pyruvate kinase  49.37 
 
 
477 aa  420  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1294  pyruvate kinase  50.11 
 
 
472 aa  421  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09671  pyruvate kinase  46.85 
 
 
485 aa  418  1e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal  0.0962448 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3160  pyruvate kinase  48.84 
 
 
482 aa  417  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0251321 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1864  pyruvate kinase  49.05 
 
 
470 aa  418  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.950853  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2685  pyruvate kinase  47.88 
 
 
588 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000142008  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0295  pyruvate kinase  46.43 
 
 
485 aa  417  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5207  pyruvate kinase  48.31 
 
 
478 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0792274  normal  0.137713 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1692  pyruvate kinase  50.64 
 
 
479 aa  415  9.999999999999999e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309469  unclonable  0.00000000134054 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0778  pyruvate kinase  48.21 
 
 
587 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3093  pyruvate kinase  48.41 
 
 
481 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09951  pyruvate kinase  48.3 
 
 
596 aa  418  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4301  pyruvate kinase  47.98 
 
 
471 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1448  pyruvate kinase  49.05 
 
 
472 aa  414  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.438422 
 
 
-
 
NC_004310  BR1748  pyruvate kinase  47.67 
 
 
478 aa  412  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1688  pyruvate kinase  47.67 
 
 
478 aa  412  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.525724  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2465  pyruvate kinase  47.99 
 
 
478 aa  412  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1568  pyruvate kinase  47.98 
 
 
471 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.168426  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3058  pyruvate kinase  49.26 
 
 
472 aa  415  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.947696  normal  0.788477 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3042  pyruvate kinase  49.26 
 
 
472 aa  415  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.139243  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2404  pyruvate kinase  43.55 
 
 
474 aa  414  1e-114  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.824082  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1980  pyruvate kinase  47.66 
 
 
478 aa  415  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.237893  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3101  pyruvate kinase  49.26 
 
 
472 aa  415  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.509766  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2602  pyruvate kinase  49.46 
 
 
471 aa  412  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.272565  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0550  pyruvate kinase  46.48 
 
 
580 aa  415  1e-114  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0357286  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3121  pyruvate kinase  48.3 
 
 
485 aa  412  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2676  pyruvate kinase  48.09 
 
 
479 aa  413  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.18741  normal  0.256993 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5100  pyruvate kinase  48.1 
 
 
482 aa  409  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2352  pyruvate kinase  48.2 
 
 
472 aa  411  1e-113  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.401076  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3626  pyruvate kinase  47.77 
 
 
471 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.946323  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3866  pyruvate kinase  47.77 
 
 
471 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.104743  normal  0.747042 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3982  pyruvate kinase  47.55 
 
 
475 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3591  pyruvate kinase  47.77 
 
 
472 aa  409  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.802913  normal  0.0255261 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1519  pyruvate kinase  47.79 
 
 
472 aa  410  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210693  decreased coverage  0.0000976418 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2116  pyruvate kinase  43.13 
 
 
474 aa  409  1e-113  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24770  pyruvate kinase  47.91 
 
 
474 aa  409  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2040  pyruvate kinase  47.33 
 
 
582 aa  411  1e-113  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3590  pyruvate kinase  47.67 
 
 
479 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.768977  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09491  pyruvate kinase  46.71 
 
 
596 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2866  pyruvate kinase  48.52 
 
 
478 aa  410  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>