More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2326 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_2326  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
467 aa  955    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1892  beta-lactamase domain protein  52.53 
 
 
453 aa  478  1e-133  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0875078  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2729  hydrolase  48.47 
 
 
456 aa  422  1e-117  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.252968  decreased coverage  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0688  beta-lactamase domain-containing protein  42.27 
 
 
450 aa  363  3e-99  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.715713  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0421  beta-lactamase-like  40.22 
 
 
450 aa  320  3.9999999999999996e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1167  beta-lactamase domain protein  38.3 
 
 
470 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.705193  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3119  beta-lactamase domain protein  36.91 
 
 
463 aa  283  6.000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  37.86 
 
 
476 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2309  metallo-beta-lactamase family protein  35.96 
 
 
472 aa  271  2e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1354  metallo-beta-lactamase superfamily protein  35.27 
 
 
472 aa  268  1e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47654  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5172  beta-lactamase domain protein  35.67 
 
 
466 aa  268  1e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  35 
 
 
480 aa  268  2e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0946  beta-lactamase domain protein  36.14 
 
 
467 aa  265  8.999999999999999e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0047  beta-lactamase domain protein  34.75 
 
 
466 aa  263  6e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0543  beta-lactamase domain protein  36.73 
 
 
471 aa  262  1e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000327684 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  34.37 
 
 
480 aa  261  2e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2913  beta-lactamase domain protein  35.08 
 
 
469 aa  259  9e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  34.79 
 
 
459 aa  256  6e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1183  beta-lactamase domain protein  35.43 
 
 
476 aa  251  1e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0291229  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  36.47 
 
 
455 aa  251  1e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1619  beta-lactamase-like protein  36.83 
 
 
479 aa  252  1e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000199695  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6177  beta-lactamase domain protein  36.66 
 
 
470 aa  251  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.670762  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  34.96 
 
 
470 aa  251  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5594  beta-lactamase domain protein  34.29 
 
 
470 aa  251  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00681465  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  35.22 
 
 
461 aa  250  3e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4881  beta-lactamase domain-containing protein  34.13 
 
 
471 aa  249  5e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897195  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1571  metallo-beta-lactamase superfamily protein  34.51 
 
 
471 aa  248  2e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3085  rhodanese-like protein  37.2 
 
 
459 aa  248  2e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1830  beta-lactamase domain-containing protein  36.03 
 
 
459 aa  246  6e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.772754  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4023  beta-lactamase domain-containing protein  36.03 
 
 
459 aa  246  6e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139103  normal  0.561085 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3523  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.64 
 
 
478 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5691  beta-lactamase domain-containing protein  35.89 
 
 
459 aa  244  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5312  beta-lactamase-like protein  35.89 
 
 
459 aa  244  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5401  beta-lactamase domain-containing protein  35.89 
 
 
459 aa  244  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  0.319128 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2338  beta-lactamase domain-containing protein  33.4 
 
 
478 aa  241  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.415527  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2319  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.35 
 
 
478 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001105  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2552  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain protein  32.21 
 
 
478 aa  240  4e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08286e-25 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
471 aa  240  4e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1732  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.84 
 
 
478 aa  239  9e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322507 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2277  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.21 
 
 
478 aa  238  2e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0985  beta-lactamase domain-containing protein  35.67 
 
 
459 aa  238  2e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1643  beta-lactamase domain-containing protein  34.74 
 
 
464 aa  238  2e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2361  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  32.21 
 
 
484 aa  237  4e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105565  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2538  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  32.21 
 
 
484 aa  237  4e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3839  beta-lactamase domain-containing protein  33.88 
 
 
469 aa  235  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0513  beta-lactamase domain-containing protein  32.9 
 
 
617 aa  234  3e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  34.92 
 
 
460 aa  231  2e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0208  beta-lactamase domain protein  33.76 
 
 
470 aa  229  8e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0980  beta-lactamase domain-containing protein  33.49 
 
 
455 aa  229  8e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4014  beta-lactamase-like protein  34.16 
 
 
453 aa  227  3e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4088  beta-lactamase domain-containing protein  34.16 
 
 
453 aa  227  3e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4244  beta-lactamase domain-containing protein  34.16 
 
 
453 aa  227  4e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2681  beta-lactamase-like  33.62 
 
 
464 aa  224  2e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06430  metallo-beta-lactamase superfamily protein  33.12 
 
 
471 aa  223  7e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2435  metallo-beta-lactamase family protein  32.61 
 
 
442 aa  218  1e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21680  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.62 
 
 
470 aa  218  1e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0074  beta-lactamase domain-containing protein  33.55 
 
 
444 aa  218  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0076  beta-lactamase domain-containing protein  33.55 
 
 
444 aa  218  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2578  beta-lactamase domain protein  35.93 
 
 
471 aa  216  7e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010585  decreased coverage  0.0000461867 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0267  beta-lactamase domain protein  34.92 
 
 
484 aa  216  8e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.30409  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5835  beta-lactamase domain-containing protein  32.35 
 
 
450 aa  216  9e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.33754 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2606  beta-lactamase domain protein  33.56 
 
 
444 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0866757 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0359  beta-lactamase domain protein  35.39 
 
 
476 aa  212  9e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1826  beta-lactamase-like protein  33.7 
 
 
457 aa  212  1e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1707  Rhodanese domain protein  34.32 
 
 
472 aa  209  8e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.140865  normal  0.999922 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2225  beta-lactamase domain-containing protein  33.79 
 
 
470 aa  203  6e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.4809 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2086  beta-lactamase domain-containing protein  33.56 
 
 
470 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.472502  normal  0.029766 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21300  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  33.41 
 
 
456 aa  201  3e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.617308  hitchhiker  0.0075618 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5378  beta-lactamase domain protein  34.76 
 
 
462 aa  195  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.120982  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11813  Rhodanese-like protein  30.27 
 
 
442 aa  192  8e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.154405  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34990  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.35 
 
 
453 aa  188  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.848513  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28130  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30.47 
 
 
502 aa  187  5e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4226  beta-lactamase domain protein  31.96 
 
 
480 aa  186  6e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3632  beta-lactamase domain-containing protein  30.49 
 
 
488 aa  186  7e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.182786  normal  0.236484 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2892  beta-lactamase domain-containing protein  31.48 
 
 
452 aa  184  3e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193457  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2429  beta-lactamase domain protein  31.67 
 
 
464 aa  184  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00447087  normal  0.135271 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3957  beta-lactamase domain-containing protein  28.48 
 
 
489 aa  179  9e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.381216 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2937  beta-lactamase domain-containing protein  29.61 
 
 
452 aa  179  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.142956  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1960  beta-lactamase domain-containing protein  31.64 
 
 
478 aa  177  3e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0558054  normal  0.587362 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3361  beta-lactamase domain-containing protein  31.18 
 
 
466 aa  176  7e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655276  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0108  beta-lactamase domain-containing protein  30.2 
 
 
454 aa  167  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2038  beta-lactamase domain protein  30.86 
 
 
451 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0124329  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12628  hypothetical protein  26.85 
 
 
448 aa  163  6e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.520905  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1900  metallo-beta-lactamase family protein  28.54 
 
 
446 aa  156  9e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.309949  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0093  Beta-lactamase-like  38.26 
 
 
244 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000294531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3935  beta-lactamase-like  39.71 
 
 
251 aa  138  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1014  beta-lactamase domain protein  29.78 
 
 
454 aa  136  8e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.532589  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0757  beta-lactamase domain protein  38.91 
 
 
244 aa  134  3e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.717339  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2790  beta-lactamase domain protein  35.74 
 
 
246 aa  133  9e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  30.58 
 
 
346 aa  126  7e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2738  putative metallo-beta-lactamase family protein  35.89 
 
 
243 aa  125  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.292941  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5355  beta-lactamase domain-containing protein  28.38 
 
 
356 aa  109  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3467  beta-lactamase domain-containing protein  34.8 
 
 
243 aa  108  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.919915  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  28.8 
 
 
361 aa  108  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3239  beta-lactamase domain-containing protein  33.92 
 
 
243 aa  107  4e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.211177  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0182  Beta-lactamase-like  27.85 
 
 
356 aa  107  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.237116 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3034  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
382 aa  105  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1223  metallo-beta-lactamase family protein  33.04 
 
 
246 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2863  metallo-beta-lactamase family protein  33.04 
 
 
246 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3258  beta-lactamase domain-containing protein  33.92 
 
 
243 aa  104  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0866294  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>