282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2289 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_2289  peptidase M28  100 
 
 
338 aa  689    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  31.49 
 
 
677 aa  100  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2131  leucyl aminopeptidase  32.42 
 
 
523 aa  89.4  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.227059  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0032  hypothetical protein  25.68 
 
 
397 aa  78.6  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0344  Aminopeptidase Y  34.52 
 
 
534 aa  77.4  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138174  normal  0.69761 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0927  Aminopeptidase Y  41.59 
 
 
548 aa  75.9  0.0000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464767  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0421  aminopeptidase  26.23 
 
 
501 aa  75.9  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.131984  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1065  peptidase M28  32.84 
 
 
455 aa  74.7  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.377443  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89245  Aminopeptidase yscIII Transferrin receptor  34.44 
 
 
533 aa  73.6  0.000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  29.22 
 
 
598 aa  72.8  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0031  hypothetical protein  25 
 
 
397 aa  72  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  31.34 
 
 
1103 aa  71.6  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05516  aminopeptidase  27.5 
 
 
504 aa  71.2  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28372  leucyl aminopeptidase precursor  25.96 
 
 
407 aa  71.2  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.36652 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0596  aminopeptidase Ap1  27.12 
 
 
417 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5001  leucyl aminopeptidase  28.81 
 
 
417 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.341623  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3301  leucyl aminopeptidase  28.39 
 
 
417 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177748  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07020  leucyl aminopeptidase  27.16 
 
 
483 aa  70.1  0.00000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.384558  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4476  leucyl aminopeptidase  28.81 
 
 
417 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5067  leucyl aminopeptidase  28.39 
 
 
417 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0862  peptidase M28  27.65 
 
 
574 aa  69.7  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2986  peptidase M28  29.9 
 
 
775 aa  70.1  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0757  peptidase family protein  27.37 
 
 
408 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31218  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5218  leucyl aminopeptidase  28.39 
 
 
417 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0487  putative leucine aminopeptidase  27.02 
 
 
408 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2403  aminopeptidase Y  34.62 
 
 
512 aa  68.9  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204184  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2124  aminopeptidase  27.02 
 
 
408 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1852  leucine aminopeptidase, putative  27.17 
 
 
408 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0188761  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1962  putative leucine aminopeptidase  27.02 
 
 
384 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0694  putative leucine aminopeptidase  27.02 
 
 
384 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.832714  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0990  putative leucine aminopeptidase  27.02 
 
 
384 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2907  peptidase M28  31.44 
 
 
463 aa  68.2  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3895  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  29.96 
 
 
1077 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0845  peptidase family protein  27.02 
 
 
384 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.292004  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2729  hypothetical protein  24.74 
 
 
401 aa  67.4  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  27.88 
 
 
674 aa  67.4  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0660  hypothetical protein  25.28 
 
 
568 aa  67.4  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.61826 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5215  peptidase M28  32.46 
 
 
450 aa  67  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.05114  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  25.09 
 
 
318 aa  67  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1960  peptidases M20 and M28  33.1 
 
 
333 aa  67  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0902014  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0543  aminopeptidase Y  42.57 
 
 
501 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.207964  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1976  peptidase M28  27.05 
 
 
347 aa  66.2  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.242432  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0793  Aminopeptidase Y  39.02 
 
 
514 aa  66.2  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0553  aminopeptidase Y  42.57 
 
 
501 aa  66.2  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0565  aminopeptidase Y  42.57 
 
 
501 aa  66.2  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.234277 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0715  aminopeptidase Y  45.54 
 
 
502 aa  66.2  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0168155 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6133  peptidase M28  31.11 
 
 
461 aa  65.9  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07035  aminopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04210)  23.79 
 
 
390 aa  65.9  0.0000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8952  Aminopeptidase Y  45.35 
 
 
515 aa  65.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2866  hypothetical protein  24.74 
 
 
401 aa  65.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1190  peptidase M28  32.11 
 
 
629 aa  65.5  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.909659  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0054  peptidase M28  29.08 
 
 
335 aa  65.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2428  M28 family peptidase  30.45 
 
 
273 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5208  aminopeptidase  32.02 
 
 
466 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274505  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5606  aminopeptidase  32.02 
 
 
466 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2343  Aminopeptidase Y  44.55 
 
 
512 aa  64.7  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.362822  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0652  hypothetical protein  27.19 
 
 
591 aa  64.3  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  35 
 
 
558 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5720  peptidase M28  30 
 
 
313 aa  63.9  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.311136  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  35 
 
 
558 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1949  peptidase M28  27.44 
 
 
439 aa  63.9  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2556  peptidase M28  42.2 
 
 
558 aa  63.9  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050336  unclonable  0.0000000000133142 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0052  peptidase M28  29.23 
 
 
308 aa  63.9  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000295021 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0141  peptidase M28  38.1 
 
 
524 aa  63.5  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.481582 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5481  putative aminopeptidase  30.46 
 
 
466 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3246  aminopeptidase Y  40.23 
 
 
518 aa  63.2  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.765312  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5470  putative aminopeptidase  30.46 
 
 
466 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.155221 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0003  peptidase M28  29.1 
 
 
319 aa  63.2  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00570901  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  41.12 
 
 
559 aa  63.2  0.000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1748  peptidase M28  24.88 
 
 
430 aa  62.8  0.000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2164  peptidase M28  29.76 
 
 
512 aa  62.8  0.000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.502107  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5488  aminopeptidase, putative  32.02 
 
 
466 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  41.28 
 
 
558 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0190  aminopeptidase Y  39.71 
 
 
510 aa  62  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10423  lipoprotein aminopeptidase lpqL  45.1 
 
 
500 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0596975  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0754  peptidase M28  32.72 
 
 
339 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.050482 
 
 
-
 
NC_006694  CNI04080  peptidase, putative  24.75 
 
 
402 aa  61.6  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.321428  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0578  peptidase M28  31.37 
 
 
373 aa  61.6  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.43286  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08445  aminopeptidase Y, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00650)  32.77 
 
 
503 aa  60.8  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5537  putative aminopeptidase  29.81 
 
 
466 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5040  aminopeptidase  29.81 
 
 
466 aa  60.8  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5056  aminopeptidase  31.64 
 
 
466 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.418047  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02780  aminopeptidase, putative  30.8 
 
 
516 aa  60.8  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0844  peptidase M28  42.5 
 
 
539 aa  60.8  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2825  peptidase M28  30.9 
 
 
539 aa  60.8  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.741116  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4664  peptidase M28  28.43 
 
 
526 aa  61.2  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062927  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  30.57 
 
 
346 aa  60.8  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5450  putative aminopeptidase  29.81 
 
 
466 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3219  peptidase M28  29.15 
 
 
306 aa  60.8  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.115329  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  40.37 
 
 
557 aa  61.2  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1386  peptidase M28  30.25 
 
 
323 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.492148  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5156  peptidase M28  31.07 
 
 
465 aa  60.5  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2420  M28A family peptidase  30.25 
 
 
323 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.564351  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3155  peptidase M28  30.58 
 
 
436 aa  60.5  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000680764  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  30.64 
 
 
557 aa  60.5  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1044  peptidase M28  29.15 
 
 
306 aa  60.1  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0202745 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2070  peptidase M28  30.05 
 
 
309 aa  60.1  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.316925  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1997  peptidase M28  37.8 
 
 
537 aa  59.7  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801062  hitchhiker  0.00000223343 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0075  peptidase M28  34.03 
 
 
947 aa  60.1  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11414  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  37.61 
 
 
557 aa  60.1  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>