More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2255 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2255  shikimate kinase  100 
 
 		 166 aa  338  2e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1850  shikimate kinase  67.92 
 
 		 174 aa  228  2e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.620898 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1256  shikimate kinase  66.05 
 
 		 166 aa  223  7e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0372  shikimate kinase  56.79 
 
 		 167 aa  187  5e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0374428  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3880  shikimate kinase  54.09 
 
 		 170 aa  186  9e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2437  shikimate kinase  56.05 
 
 		 169 aa  182  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00281475  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2014  shikimate kinase  51.53 
 
 		 169 aa  172  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1018  shikimate kinase  48.19 
 
 		 170 aa  167  5e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0096  Shikimate kinase  47.02 
 
 		 171 aa  157  6e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.650156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3097  shikimate kinase  51.27 
 
 		 177 aa  156  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1230  shikimate kinase  43.98 
 
 		 171 aa  155  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0731  shikimate kinase  46.11 
 
 		 170 aa  154  4e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000355155  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12700  shikimate kinase  47.62 
 
 		 179 aa  153  9e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.947256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0517  Shikimate kinase  46.34 
 
 		 173 aa  150  5.9999999999999996e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0103494  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3183  shikimate kinase  45.34 
 
 		 169 aa  137  7.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.020728  hitchhiker  0.00306949 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2426  shikimate kinase  40.12 
 
 		 167 aa  129  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00106596  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0183  shikimate kinase  46.21 
 
 		 201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000422214 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0912  shikimate kinase  41.32 
 
 		 173 aa  125  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1973  shikimate kinase  41.25 
 
 		 192 aa  124  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0334894  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2609  shikimate kinase  39.74 
 
 		 182 aa  122  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0706478  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0200  shikimate kinase  43.51 
 
 		 174 aa  122  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.495734  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0827  shikimate kinase  42.5 
 
 		 173 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0994  shikimate kinase I  39.76 
 
 		 175 aa  112  3e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0963  shikimate kinase I  39.76 
 
 		 175 aa  112  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0971  shikimate kinase  42.36 
 
 		 185 aa  110  6e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.488424 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0723  shikimate kinase  40.85 
 
 		 180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1002  shikimate kinase  39.26 
 
 		 183 aa  108  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2137  shikimate kinase  36.53 
 
 		 174 aa  107  7.000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.628527  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2353  shikimate kinase  38.18 
 
 		 235 aa  107  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2394  shikimate kinase  38.18 
 
 		 235 aa  107  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0537211  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2400  shikimate kinase  38.18 
 
 		 235 aa  107  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0971022 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12559  shikimate kinase  37.04 
 
 		 176 aa  106  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121488  normal  0.108726 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0683  shikimate kinase  35.8 
 
 		 196 aa  104  6e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.47245  normal  0.517024 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0207  shikimate kinase  39.74 
 
 		 183 aa  103  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.807253  normal  0.16478 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2206  shikimate kinase I  35.5 
 
 		 174 aa  103  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000184461  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1091  shikimate kinase  37.65 
 
 		 172 aa  102  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.393566  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3686  shikimate kinase I  35.29 
 
 		 173 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000028278  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3793  shikimate kinase I  35.29 
 
 		 173 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.013782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3855  shikimate kinase I  35.29 
 
 		 173 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.0000716125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3684  shikimate kinase I  35.29 
 
 		 173 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000504262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3759  shikimate kinase I  35.29 
 
 		 173 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00136839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00028  shikimate kinase I  34.91 
 
 		 172 aa  101  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0286  shikimate kinase I  34.91 
 
 		 171 aa  100  9e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3698  shikimate kinase I  34.91 
 
 		 171 aa  100  9e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000225658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0247  shikimate kinase I  34.91 
 
 		 171 aa  100  9e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000294714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1308  shikimate kinase  38.61 
 
 		 172 aa  100  9e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0211808 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4202  shikimate kinase I  34.91 
 
 		 171 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000383652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4113  shikimate kinase I  34.91 
 
 		 171 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000040137  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4084  shikimate kinase I  34.91 
 
 		 171 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000358948  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0346  shikimate kinase  36.75 
 
 		 191 aa  100  1e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3706  shikimate kinase I  34.91 
 
 		 171 aa  99.8  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000103243  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0261  shikimate kinase I  34.91 
 
 		 171 aa  100  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000154257  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4003  shikimate kinase I  34.91 
 
 		 171 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000558194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3894  shikimate kinase I  34.91 
 
 		 171 aa  100  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000513438  normal  0.331881 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4605  shikimate kinase I  34.71 
 
 		 173 aa  99.8  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000116276  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0330  shikimate kinase  36.31 
 
 		 179 aa  99.8  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15338  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3727  shikimate kinase I  34.71 
 
 		 173 aa  99.8  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000014395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3966  shikimate kinase I  34.71 
 
 		 173 aa  99.8  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  1.60057e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2209  shikimate kinase  37.04 
 
 		 165 aa  99.4  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.218962  normal  0.751084 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3883  shikimate kinase I  34.71 
 
 		 173 aa  99.4  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000719849  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0225  shikimate kinase I  34.71 
 
 		 173 aa  99.8  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000752096  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03242  shikimate kinase I  34.71 
 
 		 173 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00034661  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3767  shikimate kinase I  34.71 
 
 		 173 aa  98.6  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000106668  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3586  shikimate kinase I  34.71 
 
 		 173 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  2.9305899999999995e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3757  shikimate kinase  36.42 
 
 		 220 aa  98.6  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.28547 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0323  shikimate kinase I  34.71 
 
 		 173 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000129228  normal  0.10404 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03194  hypothetical protein  34.71 
 
 		 173 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000404125  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3860  shikimate kinase I  34.71 
 
 		 173 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000504187  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0323  Shikimate kinase  34.71 
 
 		 225 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000263169  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4694  shikimate kinase I  34.71 
 
 		 225 aa  98.6  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000528588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3666  shikimate kinase I  34.71 
 
 		 225 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000538429  normal  0.0827574 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2532  shikimate kinase  33.94 
 
 		 173 aa  97.8  6e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884272  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3803  shikimate kinase I  34.71 
 
 		 173 aa  97.8  6e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00268813  normal  0.803666 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2456  shikimate kinase  32.93 
 
 		 170 aa  97.8  7e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.209695  normal  0.679915 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0472  shikimate kinase  34.71 
 
 		 172 aa  96.7  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0810879  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0215  shikimate kinase  38.31 
 
 		 172 aa  97.1  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.365544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2345  shikimate kinase  34.94 
 
 		 199 aa  97.1  1e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0877  Shikimate kinase  37.27 
 
 		 176 aa  97.1  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.317471 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2722  shikimate kinase I  34.12 
 
 		 172 aa  96.7  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2549  Shikimate kinase  32.53 
 
 		 189 aa  96.7  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3368  shikimate kinase I  34.32 
 
 		 171 aa  96.7  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000011554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3524  Shikimate kinase  38.61 
 
 		 169 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.236256  normal  0.835023 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2258  shikimate kinase  37.21 
 
 		 177 aa  96.3  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2925  shikimate kinase  33.74 
 
 		 179 aa  96.3  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0375  shikimate kinase I  34.91 
 
 		 171 aa  96.3  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00773873  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0894  shikimate kinase  32.12 
 
 		 190 aa  95.5  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00120765  hitchhiker  0.000836884 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0528  Shikimate kinase  31.87 
 
 		 166 aa  95.1  4e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.276227  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2761  shikimate kinase  38.46 
 
 		 179 aa  95.1  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2646  shikimate kinase  33.95 
 
 		 220 aa  95.1  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2368  Shikimate kinase  35 
 
 		 165 aa  94.7  5e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0733676  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1563  shikimate 5-dehydrogenase  34.38 
 
 		 462 aa  94.7  6e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0611  shikimate kinase  36.49 
 
 		 180 aa  94.4  7e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.78726  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3401  shikimate kinase  36.71 
 
 		 182 aa  94.4  7e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2952  Shikimate kinase  36.65 
 
 		 171 aa  94  9e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000140842  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3108  shikimate kinase  34.39 
 
 		 184 aa  93.2  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0973333 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0441  shikimate kinase  31.95 
 
 		 176 aa  93.6  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.567872  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0652  shikimate kinase  35.15 
 
 		 195 aa  94  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0024  shikimate kinase I  34.71 
 
 		 173 aa  93.6  1e-18  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0692  shikimate kinase  36.49 
 
 		 180 aa  93.2  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0678  shikimate kinase  33.12 
 
 		 182 aa  93.6  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.211914 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>