More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2234 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_2234  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
380 aa  775    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0250  glycosyl transferase, group 1  61.8 
 
 
378 aa  480  1e-134  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1678  glycosyl transferase, group 1  39.01 
 
 
373 aa  242  6e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0612  glycosyl transferase group 1  32.9 
 
 
378 aa  209  6e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2394  glycosyl transferase, group 1  26.82 
 
 
395 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0348  glycosyl transferase group 1  26.04 
 
 
396 aa  100  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212038  normal  0.421702 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0289  glycosyl transferase, group 1  28.09 
 
 
405 aa  97.1  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  31.22 
 
 
404 aa  95.1  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1973  glycosyl transferase, group 1  28.63 
 
 
416 aa  94.4  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0228  glycosyl transferase, group 1  26.41 
 
 
401 aa  91.7  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.631935  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  28.94 
 
 
394 aa  90.5  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  27.32 
 
 
411 aa  89.4  9e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  28.53 
 
 
405 aa  88.2  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4282  glycosyl transferase group 1  26.35 
 
 
405 aa  87.4  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.870736  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4118  glycosyl transferase group 1  30.36 
 
 
383 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0967144  hitchhiker  0.00000000882956 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3271  glycosyl transferase group 1  31.23 
 
 
768 aa  82.8  0.000000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0580  glycosyl transferase group 1  30.18 
 
 
399 aa  80.1  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55279  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0624  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.76 
 
 
383 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  28.95 
 
 
426 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  29.82 
 
 
416 aa  78.6  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2080  glycosyl transferase, group 1  28.01 
 
 
447 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.371281  normal  0.082698 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  26.27 
 
 
412 aa  77.8  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2753  glycosyl transferase group 1  26.48 
 
 
394 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0670  glycosyl transferase, group 1  28.8 
 
 
405 aa  77  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0581  glycosyl transferase, group 1  28.26 
 
 
405 aa  77  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3833  glycosyl transferase, group 1  26.23 
 
 
397 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.794205  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  34.9 
 
 
414 aa  75.5  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  34.9 
 
 
414 aa  75.5  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3178  glycosyl transferase, group 1  30.08 
 
 
402 aa  74.7  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1509  glycosyl transferase, group 1  36.73 
 
 
425 aa  74.7  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1527  glycosyl transferase, group 1  28.76 
 
 
384 aa  74.7  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.161562  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0136  glycosyl transferase, group 1  26.62 
 
 
417 aa  74.3  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3107  glycosyl transferase, group 1  30.99 
 
 
475 aa  73.9  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.27638  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0171  glycosyl transferase, group 1  30.35 
 
 
422 aa  73.9  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3857  glycosyl transferase group 1  32.57 
 
 
423 aa  74.3  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.352881  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  24.6 
 
 
406 aa  73.6  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1691  glycosyl transferase, group 1  27.69 
 
 
550 aa  73.6  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7644  glycosyl transferase group 1  29.53 
 
 
545 aa  72  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.939663  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0293  glycosyl transferase, group 1  24.92 
 
 
406 aa  72.8  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.551542  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2439  glycosyl transferase, group 1  28.15 
 
 
388 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  31.18 
 
 
427 aa  71.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4703  glycosyl transferase group 1  25.3 
 
 
390 aa  70.9  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08640  glycosyltransferase  29.91 
 
 
364 aa  71.2  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4821  glycosyl transferase, group 1  29.18 
 
 
401 aa  70.9  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.726751  normal  0.695392 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1929  glycosyl transferase, group 1  26.64 
 
 
409 aa  70.9  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6507  glycosyl transferase group 1  29.02 
 
 
383 aa  70.9  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.961113  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1306  glycosyl transferase group 1  26.16 
 
 
403 aa  70.1  0.00000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2168  glycosyl transferase group 1  27.72 
 
 
399 aa  70.5  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0756  glycosyl transferase group 1  24.53 
 
 
445 aa  70.1  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.621398  hitchhiker  0.000561624 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
419 aa  70.1  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3282  glycosyl transferase, group 1  32.51 
 
 
377 aa  68.9  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0171  hypothetical protein  27.2 
 
 
391 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  25.09 
 
 
365 aa  68.9  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2935  glycosyl transferase group 1  32.48 
 
 
407 aa  69.3  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.577866  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2794  glycosyl transferase group 1  29.6 
 
 
404 aa  68.9  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1905  glycosyltransferase  32.27 
 
 
402 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2518  glycosyl transferase group 1  29.61 
 
 
411 aa  68.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.377974  normal  0.0256247 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0285  glycosyl transferase group 1  27.24 
 
 
389 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2890  glycosyl transferase, group 1  26.06 
 
 
409 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.036478 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30010  hypothetical protein  29.23 
 
 
416 aa  68.2  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255646  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2281  glycosyl transferase, group 1  23.44 
 
 
389 aa  68.6  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0265  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.88 
 
 
427 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0256  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  22.88 
 
 
427 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188802  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6075  glycosyl transferase group 1  33.52 
 
 
390 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.353621  normal  0.425913 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0302  glycosyltransferase  31.32 
 
 
383 aa  67.8  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464413  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2279  glycosyl transferase, group 1  28.15 
 
 
382 aa  67.4  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_874  glycosyl transferase, group 1  26.15 
 
 
405 aa  67  0.0000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7635  glycosyl transferase group 1  26.05 
 
 
507 aa  67  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.212629  normal  0.696625 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2962  glycosyl transferase, group 1  28.76 
 
 
409 aa  67  0.0000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.355294  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  26.77 
 
 
386 aa  67  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  26.11 
 
 
415 aa  66.6  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0268  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.99 
 
 
477 aa  66.6  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3514  glycosyl transferase group 1  32.51 
 
 
376 aa  67  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  28.17 
 
 
376 aa  66.6  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10750  glycosyltransferase  35.14 
 
 
399 aa  66.6  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  30.73 
 
 
426 aa  66.6  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3904  glycosyl transferase group 1  24.75 
 
 
374 aa  66.2  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0307  glycosyl transferase, group 1  28.34 
 
 
396 aa  66.2  0.0000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.813373  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1510  glycosyl transferase, group 1  31.54 
 
 
415 aa  66.2  0.0000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5018  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.64 
 
 
377 aa  65.5  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.437821  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0294  glycosyl transferase, group 1  31.39 
 
 
413 aa  65.5  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26810  glycosyltransferase  24.23 
 
 
723 aa  65.9  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  24.8 
 
 
424 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6757  UDP-N-acetylglucosamine  31.38 
 
 
417 aa  65.1  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  29.66 
 
 
436 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3059  glycosyl transferase group 1  32.54 
 
 
374 aa  65.1  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000425383  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  27.16 
 
 
1119 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2160  glycosyl transferase, group 1  29.39 
 
 
461 aa  64.7  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.355932  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4489  glycosyl transferase group 1  25.96 
 
 
417 aa  64.7  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  28.44 
 
 
370 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3878  glycosyl transferase group 1  24.09 
 
 
535 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1805  glycosyl transferase, group 1  33.85 
 
 
372 aa  63.9  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 
425 aa  64.3  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1002  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.9 
 
 
405 aa  63.5  0.000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00183695  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10494  mannosyltransferase  27.35 
 
 
480 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00261948  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3302  glycosyl transferase, group 1  40.35 
 
 
387 aa  63.5  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2537  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related glycosyltransferase  28.08 
 
 
468 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.252035 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3311  glycosyl transferase, group 1  27.17 
 
 
390 aa  63.5  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0105  glycosyl transferase group 1  26.47 
 
 
385 aa  63.5  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4112  glycosyl transferase group 1  27.23 
 
 
385 aa  63.5  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>