More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2160 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2160  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 272 aa  549  1e-155  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2431  diaminopimelate epimerase  64.36 
 
 		 275 aa  365  1e-100  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.410157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0259  diaminopimelate epimerase  61.76 
 
 		 277 aa  346  3e-94  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2316  diaminopimelate epimerase  59.41 
 
 		 274 aa  329  4e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0560  diaminopimelate epimerase  58.24 
 
 		 274 aa  305  7e-82  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00795649 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0454  diaminopimelate epimerase  56.46 
 
 		 279 aa  272  5.000000000000001e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.691704  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0204  diaminopimelate epimerase  39.38 
 
 		 295 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.164402  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  41.3 
 
 		 278 aa  181  8.000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  39.29 
 
 		 283 aa  181  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  40.51 
 
 		 284 aa  179  4e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3911  diaminopimelate epimerase  40.36 
 
 		 278 aa  176  4e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000014608  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0339  diaminopimelate epimerase  39.36 
 
 		 278 aa  175  6e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.6920099999999997e-35 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2115  diaminopimelate epimerase  38.43 
 
 		 278 aa  175  6e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1150  Diaminopimelate epimerase  39.58 
 
 		 287 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.756006  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2992  diaminopimelate epimerase  38.43 
 
 		 282 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000459249  normal  0.46742 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3545  diaminopimelate epimerase  37.68 
 
 		 288 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3414  diaminopimelate epimerase  38.57 
 
 		 278 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0481236  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0358  diaminopimelate epimerase  38.73 
 
 		 278 aa  171  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000380809  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2322  diaminopimelate epimerase  39.64 
 
 		 277 aa  170  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000212903  hitchhiker  0.00476007 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3074  diaminopimelate epimerase  37.63 
 
 		 279 aa  169  3e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000185766  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5076  diaminopimelate epimerase  38.11 
 
 		 288 aa  169  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0531  diaminopimelate epimerase  38.65 
 
 		 282 aa  169  4e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.46131  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3323  diaminopimelate epimerase  38.79 
 
 		 278 aa  169  4e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1764  diaminopimelate epimerase  38.49 
 
 		 269 aa  168  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2345  diaminopimelate epimerase  37.81 
 
 		 279 aa  167  2e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4756  diaminopimelate epimerase  37.06 
 
 		 288 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0166  diaminopimelate epimerase  37.41 
 
 		 288 aa  165  8e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5074  diaminopimelate epimerase  36.71 
 
 		 288 aa  165  9e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0790  diaminopimelate epimerase  40.43 
 
 		 276 aa  165  9e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4806  diaminopimelate epimerase  36.71 
 
 		 288 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4647  diaminopimelate epimerase  36.71 
 
 		 288 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4667  diaminopimelate epimerase  36.71 
 
 		 288 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5170  diaminopimelate epimerase  36.71 
 
 		 288 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1814  diaminopimelate epimerase  36.69 
 
 		 272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5079  diaminopimelate epimerase  36.71 
 
 		 288 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5045  diaminopimelate epimerase  36.71 
 
 		 288 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2100  diaminopimelate epimerase  36.33 
 
 		 272 aa  163  3e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.312969  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0888  diaminopimelate epimerase  38.79 
 
 		 279 aa  162  4.0000000000000004e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000673594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0630  diaminopimelate epimerase  37.28 
 
 		 304 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  34.86 
 
 		 284 aa  162  6e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0322  diaminopimelate epimerase  36.46 
 
 		 284 aa  161  1e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.217655  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1371  diaminopimelate epimerase  36.97 
 
 		 368 aa  161  1e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.692483  normal  0.473185 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  36.59 
 
 		 281 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  36.59 
 
 		 281 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0349  diaminopimelate epimerase  37.5 
 
 		 293 aa  161  1e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000570655  hitchhiker  0.0000127535 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0018  diaminopimelate epimerase  35.25 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  35.31 
 
 		 282 aa  160  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0061  diaminopimelate epimerase  38.25 
 
 		 279 aa  160  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0549  diaminopimelate epimerase  37.41 
 
 		 280 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09951  diaminopimelate epimerase  35.44 
 
 		 284 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.51158 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  35.23 
 
 		 277 aa  159  3e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  34.88 
 
 		 277 aa  159  3e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0342  diaminopimelate epimerase  36.69 
 
 		 270 aa  159  4e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00240422  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  37.68 
 
 		 280 aa  159  4e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0218  diaminopimelate epimerase  36.59 
 
 		 266 aa  159  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0196  diaminopimelate epimerase  35.23 
 
 		 290 aa  159  6e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.465069  hitchhiker  0.000651224 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0724  diaminopimelate epimerase  34.88 
 
 		 277 aa  158  7e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0456566  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  37.41 
 
 		 278 aa  158  8e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1165  diaminopimelate epimerase  36.75 
 
 		 277 aa  158  9e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  34.39 
 
 		 292 aa  158  9e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  36.24 
 
 		 281 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0405  diaminopimelate epimerase  37.5 
 
 		 283 aa  157  1e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.759979  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2730  diaminopimelate epimerase  38.69 
 
 		 268 aa  157  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0948067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0200  diaminopimelate epimerase  36.01 
 
 		 295 aa  157  2e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000663087 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0220  diaminopimelate epimerase  36.36 
 
 		 295 aa  157  2e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0184363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09701  diaminopimelate epimerase  34.86 
 
 		 286 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0227672  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3033  diaminopimelate epimerase  38.35 
 
 		 290 aa  156  4e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09731  diaminopimelate epimerase  35.79 
 
 		 286 aa  155  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.137092  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1382  diaminopimelate epimerase  39.21 
 
 		 279 aa  155  6e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12773  Diaminopimelate epimerase  38.46 
 
 		 261 aa  155  8e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09711  diaminopimelate epimerase  36.4 
 
 		 286 aa  155  9e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.646782  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1107  diaminopimelate epimerase  36.36 
 
 		 355 aa  155  9e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134817  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  35.38 
 
 		 280 aa  155  9e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0755  diaminopimelate epimerase  38.54 
 
 		 292 aa  155  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.277533  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  36.97 
 
 		 278 aa  154  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1873  diaminopimelate epimerase  38.89 
 
 		 281 aa  154  2e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00642624 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0912  diaminopimelate epimerase  36.4 
 
 		 286 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3444  diaminopimelate epimerase  36.3 
 
 		 291 aa  154  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3245  diaminopimelate epimerase  35.47 
 
 		 296 aa  154  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.139278  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0671  diaminopimelate epimerase  38.89 
 
 		 309 aa  154  2e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00498295 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5091  diaminopimelate epimerase  37.28 
 
 		 259 aa  153  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000217016  normal  0.274183 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1455  diaminopimelate epimerase  36.13 
 
 		 257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0568169  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35896  predicted protein  36.43 
 
 		 407 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.22648  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0648  diaminopimelate epimerase  37.36 
 
 		 279 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.312023  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0181  diaminopimelate epimerase  37.05 
 
 		 272 aa  153  4e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00086691  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2694  diaminopimelate epimerase  35.04 
 
 		 268 aa  152  7e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000359695  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0153  diaminopimelate epimerase  34.03 
 
 		 288 aa  152  7e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3266  diaminopimelate epimerase  35.44 
 
 		 326 aa  151  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0214186 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0033  diaminopimelate epimerase  35.07 
 
 		 292 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0039  diaminopimelate epimerase  35.07 
 
 		 292 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1614  diaminopimelate epimerase  36.82 
 
 		 264 aa  151  1e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  33.92 
 
 		 279 aa  151  1e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1200  diaminopimelate epimerase  36.04 
 
 		 287 aa  150  2e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0570214  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4074  diaminopimelate epimerase  34.52 
 
 		 276 aa  150  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34582  predicted protein  35.57 
 
 		 334 aa  150  2e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0172  diaminopimelate epimerase  34.71 
 
 		 289 aa  149  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0076  diaminopimelate epimerase  33.56 
 
 		 286 aa  149  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2888  diaminopimelate epimerase  36.62 
 
 		 284 aa  148  8e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0197  diaminopimelate epimerase  34.02 
 
 		 289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.925339  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2922  diaminopimelate epimerase  34.02 
 
 		 289 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.513817  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>