More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2100 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_2100  ABC transporter-related protein  100 
 
 
262 aa  525  1e-148  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0442  ABC transporter related  48.43 
 
 
261 aa  262  4.999999999999999e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0187  ABC transporter related  45.8 
 
 
275 aa  260  2e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.184625  normal  0.796471 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1095  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  45.77 
 
 
262 aa  256  2e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.927351  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0432  ABC transporter related  45 
 
 
262 aa  255  6e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  43.7 
 
 
258 aa  242  3.9999999999999997e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2397  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  45.67 
 
 
255 aa  241  1e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.497702 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1821  ABC transporter related  46.64 
 
 
274 aa  233  2.0000000000000002e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77339  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1642  ABC transporter related protein  47.06 
 
 
274 aa  232  5e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1319  ABC transporter related  40.94 
 
 
258 aa  231  1e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0499  ABC transporter related  41.18 
 
 
252 aa  222  4e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.367002  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1426  ABC transporter related  46.84 
 
 
254 aa  221  8e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.883261  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1152  multi anti extrusion protein MatE  40.39 
 
 
255 aa  217  1e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1214  ABC transporter related  44.71 
 
 
274 aa  217  2e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.719028  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0249  ABC transporter related  40.4 
 
 
252 aa  215  5e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  43.59 
 
 
268 aa  214  8e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1651  ABC transporter-related protein  46.58 
 
 
276 aa  214  8e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1872  iron(III) dicitrate transport ATP-binding protein  42.46 
 
 
260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.345427  normal  0.281065 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2331  ABC transporter-related protein  43.25 
 
 
255 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1464  ABC transporter related  43.48 
 
 
255 aa  211  5.999999999999999e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2733  Fe(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  37.4 
 
 
257 aa  211  9e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000467134  hitchhiker  0.000159988 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0221  ABC transporter related  38.8 
 
 
252 aa  210  2e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.785412 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0430  ABC transporter related  39.37 
 
 
253 aa  207  1e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.591461  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1049  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  39.58 
 
 
250 aa  207  1e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  38.7 
 
 
418 aa  206  4e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1490  ABC transporter related  38.58 
 
 
253 aa  205  7e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.771678  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0602  ABC transporter-related protein  45.14 
 
 
418 aa  204  9e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.660447  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0345  ABC transporter related  41.37 
 
 
259 aa  203  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0407  ABC transporter related  38.58 
 
 
260 aa  204  2e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.430136  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2015  ABC transporter related protein  43.19 
 
 
278 aa  203  3e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00270172  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1134  ABC transporter related  38.8 
 
 
250 aa  202  4e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00501593  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0275  ABC transporter related  39.04 
 
 
254 aa  202  5e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4111  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  40.32 
 
 
272 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4214  ABC transporter related  39.92 
 
 
272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2824  ABC transporter related  42.21 
 
 
278 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4100  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  40.32 
 
 
272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3057  ATP-binding component of citrate-dependent iron (III) transport protein  40.08 
 
 
250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1176  iron ABC transporter ATP-binding protein  39.04 
 
 
272 aa  199  3e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0750  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  39.13 
 
 
272 aa  199  3e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4263  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  39.92 
 
 
272 aa  199  3e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4595  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  39.92 
 
 
272 aa  199  3e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4447  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  39.92 
 
 
272 aa  199  3e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4500  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  39.92 
 
 
272 aa  200  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4448  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  39.92 
 
 
272 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0246  ABC transporter related  42.31 
 
 
256 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.067691  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4486  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  39.13 
 
 
272 aa  199  5e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1193  ABC transporter related protein  42 
 
 
250 aa  198  6e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1289  hypothetical protein  42.56 
 
 
259 aa  198  7.999999999999999e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.128877 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  44.17 
 
 
536 aa  198  7.999999999999999e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0333  ABC transporter related  42.58 
 
 
282 aa  197  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19110  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  42.69 
 
 
271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0967158 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  39.54 
 
 
266 aa  196  4.0000000000000005e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2492  ABC transporter related  43.03 
 
 
419 aa  195  7e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2149  ABC transporter related  40.32 
 
 
252 aa  194  1e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.161407 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1472  ABC transporter related  42.15 
 
 
280 aa  193  3e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.140058  normal  0.304695 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7988  ABC transporter related protein  43.75 
 
 
260 aa  192  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.34701  normal  0.255367 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0486  ABC transporter related  38.74 
 
 
252 aa  193  3e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000281839 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1624  ATPase  42.17 
 
 
250 aa  192  4e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.215797  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2066  ABC transporter related  43.48 
 
 
258 aa  192  4e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1088  H+-transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit  40.96 
 
 
299 aa  192  4e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  38.55 
 
 
264 aa  192  4e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.04 
 
 
253 aa  191  7e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3334  hypothetical protein  42.46 
 
 
267 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.435313  normal  0.165854 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2307  ABC transporter related protein  42.86 
 
 
275 aa  191  1e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3756  ABC transporter related protein  41.41 
 
 
274 aa  191  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3529  ABC transporter related  41.47 
 
 
260 aa  191  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3639  ABC transporter related  37.65 
 
 
269 aa  190  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.395378  normal  0.0643524 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  36.33 
 
 
266 aa  190  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  35.94 
 
 
266 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2320  ABC transporter related protein  41.41 
 
 
277 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4079  ABC transporter related  41.27 
 
 
268 aa  189  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.465594  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3576  ABC transporter related  46.61 
 
 
264 aa  189  4e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0297567 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2099  ABC transporter related  40.57 
 
 
261 aa  188  5.999999999999999e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0733  ABC transporter related  39.92 
 
 
258 aa  188  5.999999999999999e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000120086  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_590  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, ATPase component  41.6 
 
 
275 aa  188  7e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.139681  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2365  ABC transporter related  38.76 
 
 
455 aa  188  7e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0882  corrinoid ABC transporter ATPase  43.33 
 
 
424 aa  188  7e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0622  ABC transporter related  40.6 
 
 
275 aa  187  1e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.258343  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0652  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, ATP-binding protein  42.02 
 
 
274 aa  187  1e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0686  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, ATP-binding protein  42.02 
 
 
274 aa  187  1e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0757  ABC transporter related  39.11 
 
 
258 aa  187  2e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00138491  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2417  ABC transporter-like protein  40.71 
 
 
274 aa  187  2e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0465  Fe(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  35.43 
 
 
265 aa  186  3e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2583  ABC transporter related protein  41.63 
 
 
293 aa  186  4e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.641759  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3149  ABC transporter related  39.76 
 
 
271 aa  186  5e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0281771  hitchhiker  0.00000000506205 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5334  ABC transporter related protein  38.98 
 
 
285 aa  185  6e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  38.02 
 
 
255 aa  185  6e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  37.94 
 
 
409 aa  185  6e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3834  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38.1 
 
 
273 aa  185  7e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.860088  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5447  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  39.09 
 
 
270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.753542  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0754  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  41.54 
 
 
265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648275  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0690  ABC transporter related  35.92 
 
 
255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1172  iron ABC transporter, ATP-binding protein  38.31 
 
 
259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1465  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38.1 
 
 
273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000310402 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5100  ABC transporter related  38.4 
 
 
253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0130853  normal  0.02881 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  42.13 
 
 
269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3902  ABC transporter-related protein  38.68 
 
 
270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0703  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  41.54 
 
 
264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0576418  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3480  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  37.7 
 
 
273 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3503  ABC transporter related  37.7 
 
 
273 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>