More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2098 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2098  periplasmic binding protein  100 
 
 		 402 aa  816    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1597  periplasmic binding protein  31.64 
 
 		 409 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.465677  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0836  periplasmic binding protein  33.41 
 
 		 397 aa  212  1e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00603144  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  33.33 
 
 		 483 aa  192  7e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  33.02 
 
 		 478 aa  190  5e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2617  periplasmic binding protein  33.23 
 
 		 380 aa  166  8e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  31.31 
 
 		 354 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  32.22 
 
 		 354 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0972  periplasmic binding protein  28.92 
 
 		 429 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1591  periplasmic binding protein  28.18 
 
 		 377 aa  152  1e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0970823  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1645  periplasmic binding protein  30.47 
 
 		 354 aa  151  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.399451  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2396  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  29.74 
 
 		 375 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.507465 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0185  periplasmic binding protein  27.96 
 
 		 426 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0952847  normal  0.560438 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1596  periplasmic binding protein  30.77 
 
 		 339 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.691704  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0528  periplasmic binding protein  29.19 
 
 		 361 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147263  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2735  putative iron complex transport system substrate-binding protein  28.78 
 
 		 427 aa  137  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0180927  decreased coverage  0.0000609348 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0547  periplasmic binding protein  27.41 
 
 		 359 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1321  periplasmic binding protein  31.4 
 
 		 366 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.77394  normal  0.0125945 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1218  periplasmic binding protein  29.49 
 
 		 358 aa  130  5.0000000000000004e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0017043  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0286  periplasmic binding protein  24.76 
 
 		 338 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.234357  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1593  periplasmic binding protein  28.28 
 
 		 372 aa  125  2e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0653353  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0444  periplasmic binding protein  26.76 
 
 		 356 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1314  periplasmic binding protein  30.12 
 
 		 380 aa  120  6e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0394754 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0435  periplasmic binding protein  27.67 
 
 		 362 aa  113  6e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000278634  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1316  periplasmic binding protein  28.61 
 
 		 390 aa  109  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.867732  normal  0.0135564 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1151  hypothetical protein  26.83 
 
 		 333 aa  105  1e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3089  periplasmic binding protein  30.47 
 
 		 375 aa  103  5e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1221  ABC transporter substrate binding protein (iron)  29.33 
 
 		 406 aa  103  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1093  Fe3+-hydroxamate binding protein  25.81 
 
 		 426 aa  100  4e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000629133  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0283  periplasmic binding protein  26.81 
 
 		 383 aa  96.7  6e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.996344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  27.98 
 
 		 361 aa  93.6  5e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2696  periplasmic binding protein  27.87 
 
 		 377 aa  93.6  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.773462  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0467  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  25.49 
 
 		 384 aa  91.7  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1701  periplasmic binding protein  28.52 
 
 		 365 aa  90.9  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4418  periplasmic binding protein  26.61 
 
 		 377 aa  91.3  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.468441 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1317  periplasmic binding protein  25.75 
 
 		 307 aa  90.9  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0448  periplasmic binding protein  26.98 
 
 		 345 aa  90.5  5e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0352349  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1220  ABC transporter substrate binding protein (iron)  26.1 
 
 		 383 aa  89.7  9e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0484482  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5271  periplasmic binding protein  27.48 
 
 		 274 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2468  periplasmic binding protein  27.57 
 
 		 328 aa  88.6  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.208513  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2567  periplasmic binding protein  27.9 
 
 		 365 aa  88.6  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0204616  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1538  putative ABC transporter periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  23.98 
 
 		 381 aa  87.8  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2751  periplasmic binding protein  23.98 
 
 		 389 aa  87.4  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.369256  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2669  putative ABC transporter, periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  23.98 
 
 		 389 aa  87.4  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1145  periplasmic binding protein  28.63 
 
 		 258 aa  86.7  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.676996  normal  0.936441 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1421  periplasmic binding protein  28.43 
 
 		 379 aa  86.3  8e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1127  periplasmic binding protein  26.3 
 
 		 368 aa  85.5  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4715  periplasmic binding protein  27.48 
 
 		 264 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2194  ferrichrome/ferrioxamine B periplasmic transporter  26.15 
 
 		 377 aa  84.7  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.0100465 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4146  periplasmic binding protein  28.91 
 
 		 288 aa  83.6  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0746656  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  26.41 
 
 		 360 aa  83.6  0.000000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4077  periplasmic binding protein  25.15 
 
 		 383 aa  83.6  0.000000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2249  periplasmic binding protein  24.56 
 
 		 378 aa  83.2  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.254495 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1547  ligand binding protein  26.84 
 
 		 363 aa  83.2  0.000000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0601  periplasmic binding protein  28.77 
 
 		 354 aa  82.8  0.000000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.56983  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1430  periplasmic binding protein  23.67 
 
 		 300 aa  82.4  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4030  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  28.46 
 
 		 288 aa  82.8  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0135159  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3900  periplasmic binding protein  26.04 
 
 		 386 aa  82.8  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3611  periplasmic binding protein  26.35 
 
 		 380 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.486041  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  26.73 
 
 		 315 aa  81.3  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7105  ABC Fe3+-hydroxamate transporter, periplasmic ligand binding protein  26.76 
 
 		 401 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.320123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0137  periplasmic binding protein  27.17 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4774  periplasmic binding protein  26.48 
 
 		 311 aa  80.9  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.739783  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18990  periplasmic binding protein  22.77 
 
 		 318 aa  80.5  0.00000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0620  periplasmic binding protein  24.08 
 
 		 337 aa  79  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000216594  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7622  ABC transporter substrate binding protein (iron)  27.71 
 
 		 429 aa  79  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  26.73 
 
 		 315 aa  78.2  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2363  periplasmic binding protein  26.49 
 
 		 289 aa  77.8  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2202  periplasmic binding protein  26.18 
 
 		 318 aa  77.8  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.134078  normal  0.0623252 
 
 
-
 
NC_002936  DET0650  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, periplasmic binding protein, putative  23.75 
 
 		 338 aa  77.8  0.0000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000661971  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0684  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, periplasmic binding protein, putative  23.75 
 
 		 338 aa  77.8  0.0000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0151926  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3396  periplasmic binding protein  25.35 
 
 		 350 aa  77.4  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2758  periplasmic binding protein  25.8 
 
 		 373 aa  77  0.0000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.593995  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2550  periplasmic binding protein  25.54 
 
 		 289 aa  76.3  0.0000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  24.92 
 
 		 374 aa  75.9  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_588  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, periplasmic component  24.25 
 
 		 338 aa  75.9  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378985  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2660  periplasmic binding protein  25 
 
 		 318 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.166696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1056  periplasmic binding protein  24.51 
 
 		 341 aa  75.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1235  periplasmic binding protein  25.5 
 
 		 375 aa  74.7  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1296  iron chelate ABC transporter solute-binding protein  24.69 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.478734  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0373  periplasmic binding protein  27.79 
 
 		 723 aa  73.9  0.000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.390993 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1868  iron(III) dicitrate-binding protein  27.27 
 
 		 401 aa  73.9  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.311818 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3141  periplasmic binding protein  25.96 
 
 		 371 aa  73.9  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3395  periplasmic binding protein  24.86 
 
 		 350 aa  73.9  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.182926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3249  periplasmic binding protein  24.25 
 
 		 322 aa  73.9  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000036127  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1133  periplasmic binding protein  24.32 
 
 		 349 aa  73.6  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4137  ferrichrome/ferrioxamine B periplasmic transporter  25 
 
 		 365 aa  73.6  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3842  periplasmic binding protein  26.28 
 
 		 349 aa  73.2  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.294669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2718  periplasmic binding protein  26.98 
 
 		 360 aa  73.2  0.000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.410203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3389  periplasmic binding protein  25.35 
 
 		 350 aa  73.2  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2755  ABC transporter, substrate binding protein  24.27 
 
 		 375 aa  73.2  0.000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000138231  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3272  periplasmic binding protein  23.44 
 
 		 274 aa  73.2  0.000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1015  periplasmic binding protein  25.43 
 
 		 371 aa  72.8  0.000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.543354 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2060  periplasmic binding protein  25.84 
 
 		 309 aa  73.2  0.000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182535  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2027  periplasmic binding protein  23.39 
 
 		 378 aa  72.8  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.683361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1702  periplasmic binding protein  23.47 
 
 		 364 aa  72.4  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1460  periplasmic binding protein  26.86 
 
 		 300 aa  72.4  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.77673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4771  periplasmic binding protein  22.29 
 
 		 370 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2212  periplasmic binding protein  22.67 
 
 		 318 aa  72  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2140  periplasmic binding protein  23.77 
 
 		 394 aa  71.6  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.07383  normal  0.925288 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>