More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2051 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2051  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  100 
 
 		 259 aa  523  1e-147  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1128  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  68.97 
 
 		 264 aa  374  1e-102  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0957  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  68.73 
 
 		 261 aa  359  3e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.652274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1299  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  67.7 
 
 		 257 aa  349  3e-95  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1951  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  64.23 
 
 		 263 aa  340  1e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.612676 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0416  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  51.76 
 
 		 257 aa  264  1e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.131172  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1567  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  50 
 
 		 268 aa  262  4.999999999999999e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1396  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  48.06 
 
 		 265 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0200343  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2502  translation initiation factor 2, alpha subunit  45.74 
 
 		 266 aa  229  3e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2880  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  45.32 
 
 		 277 aa  229  5e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.651055  normal  0.408906 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0870  translation initiation factor 2, alpha subunit  45.74 
 
 		 266 aa  228  1e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2790  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  45.7 
 
 		 266 aa  226  3e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.289487  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1152  translation initiation factor 2, alpha subunit  47.64 
 
 		 254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1009  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  47.89 
 
 		 266 aa  209  3e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0703  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  41 
 
 		 262 aa  203  2e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0964  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  41.06 
 
 		 265 aa  202  3e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.497618  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0982  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  41.44 
 
 		 265 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1009  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  40.68 
 
 		 265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1699  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  39.31 
 
 		 265 aa  196  3e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.328913  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1359  translation initiation factor 2, alpha subunit  36.68 
 
 		 277 aa  158  9e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.256809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0077  RNA-binding S1 domain-containing protein  35.55 
 
 		 265 aa  155  8e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.541121 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0642  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  30.5 
 
 		 265 aa  122  5e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000204722  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1802  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  30.65 
 
 		 256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0433  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  29.1 
 
 		 264 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1783  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  30.58 
 
 		 265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.030089 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2023  translation initiation factor 2, alpha subunit  29.39 
 
 		 266 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.576744  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1687  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  29.15 
 
 		 264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.640158  normal  0.427628 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0995  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  27.87 
 
 		 266 aa  102  4e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00230  eukaryotic translation initiation factor 2 alpha subunit, putative  28.87 
 
 		 300 aa  85.1  0.000000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.433033  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03156  translation initiation factor eIF2 alpha subunit (Eurofung)  27.56 
 
 		 308 aa  78.2  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34538  predicted protein  25.68 
 
 		 320 aa  74.3  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000454395  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119592  Eukaryotic translation initiation factor 2, alpha subunit  24.82 
 
 		 322 aa  67  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0150821  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4722  general stress protein 13  35.78 
 
 		 114 aa  63.2  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2860  general stress protein 13  39.08 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5039  general stress protein 13  35.78 
 
 		 114 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4770  general stress protein 13  35.78 
 
 		 114 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4610  general stress protein 13  35.78 
 
 		 114 aa  62  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4632  general stress protein 13  35.78 
 
 		 114 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5044  general stress protein 13  35.78 
 
 		 114 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3511  general stress protein 13  34.86 
 
 		 133 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5132  general stress protein 13  35.78 
 
 		 114 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0202  general stress protein 13  35.78 
 
 		 114 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5011  general stress protein 13  35.78 
 
 		 114 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0970  RNA-binding protein  29.31 
 
 		 143 aa  61.6  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5032  general stress protein 13  35.78 
 
 		 114 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0608546  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0268  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  37.89 
 
 		 714 aa  60.8  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00840028 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0743  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  38.95 
 
 		 713 aa  60.8  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.10381  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3632  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  39.77 
 
 		 728 aa  61.2  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0176906  hitchhiker  0.00320297 
 
 
-
 
NC_004310  BR2169  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  38.71 
 
 		 714 aa  60.5  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.184355  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2081  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  38.71 
 
 		 714 aa  60.5  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0369235  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3070  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.24 
 
 		 707 aa  59.7  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.526485  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00900  pre-mRNA splicing factor, putative  43.04 
 
 		 1189 aa  58.9  0.00000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2997  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  38.1 
 
 		 711 aa  58.2  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0227  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  38.95 
 
 		 722 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.133448  normal  0.547858 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0436  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  38.95 
 
 		 722 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1031  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  44.44 
 
 		 702 aa  57.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0967354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4062  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  37.89 
 
 		 712 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2759  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  36.96 
 
 		 736 aa  57.4  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00521923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4382  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  37.89 
 
 		 712 aa  57  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.968521 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0674  RNA binding S1  44.59 
 
 		 127 aa  57  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.175739 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0078  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  36.67 
 
 		 711 aa  57  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.901584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3192  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  40.51 
 
 		 715 aa  57  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.002791  normal  0.0369352 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0028  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.77 
 
 		 718 aa  56.6  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.171141 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2918  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.78 
 
 		 740 aa  56.2  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.777239  normal  0.227939 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0605  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.51 
 
 		 718 aa  56.2  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3935  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  38.1 
 
 		 715 aa  55.8  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.138516  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3050  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  36.17 
 
 		 710 aa  55.8  0.0000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.464324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0896  30S ribosomal protein S1  31.82 
 
 		 408 aa  55.1  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000252731  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2774  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.52 
 
 		 716 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1112  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.52 
 
 		 716 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.254666  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1301  RNA binding S1 domain protein  35 
 
 		 140 aa  53.9  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000152887  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1102  30S ribosomal protein S1  40 
 
 		 401 aa  54.3  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000946853  normal  0.0119462 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1618  RNA-binding S1 domain-containing protein  37.97 
 
 		 532 aa  54.3  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4028  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  36.9 
 
 		 706 aa  54.3  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0696  hypothetical protein  36.84 
 
 		 140 aa  54.3  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000983919  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0653  RNA binding S1 domain protein  39.51 
 
 		 120 aa  53.9  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000131287  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0062  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.51 
 
 		 720 aa  53.5  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4027  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  39.24 
 
 		 752 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.749576  normal  0.189287 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15110  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr6 family  40.54 
 
 		 376 aa  53.9  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4396  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  39.24 
 
 		 745 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.735081 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0369  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  36.71 
 
 		 717 aa  53.1  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4507  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  39.24 
 
 		 745 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.398327 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0142  RNA binding S1 domain protein  40 
 
 		 128 aa  53.5  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000417569  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0035  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  38.75 
 
 		 748 aa  53.1  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4916  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  35.79 
 
 		 725 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.937332 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0175  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  35.79 
 
 		 714 aa  52.8  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0066  RNA binding S1 domain protein  40.26 
 
 		 129 aa  52.8  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1149  RNA-binding S1 domain-containing protein  36.19 
 
 		 124 aa  52.8  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000879414  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0981  RNA-binding S1 domain-containing protein  36.19 
 
 		 124 aa  52.8  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000445297  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3446  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  35.79 
 
 		 714 aa  52.4  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0122  RNA-binding S1 domain-containing protein  36.59 
 
 		 126 aa  52.4  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2015  RNA-binding S1 domain-containing protein  33.33 
 
 		 411 aa  52.4  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0652883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2897  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.74 
 
 		 725 aa  52.4  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0235  30S ribosomal protein S1  32.95 
 
 		 577 aa  52.4  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.00000120876  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0541  general stress protein 13  38.36 
 
 		 126 aa  51.2  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0164  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  39.02 
 
 		 704 aa  51.6  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2075  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  38.75 
 
 		 712 aa  51.6  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.57561 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1703  RNA binding S1 domain protein  38.89 
 
 		 385 aa  52  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000241805  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0484  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  39.24 
 
 		 715 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.102378 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2483  hypothetical protein  34.74 
 
 		 134 aa  52  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000579369  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>