28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2047 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_2047  putative DNA primase, small subunit  100 
 
 
387 aa  783  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0953  DNA primase, small subunit  56.63 
 
 
378 aa  464  1e-129  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1955  putative DNA primase, small subunit  56.01 
 
 
374 aa  441  1e-123  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.804448 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1303  DNA primase small subunit  52.53 
 
 
380 aa  407  1e-112  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1132  DNA primase, small subunit, putative  48.87 
 
 
388 aa  380  1e-104  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1392  DNA primase small subunit  42.86 
 
 
390 aa  293  2e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.369939  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0420  DNA primase small subunit  44.8 
 
 
395 aa  294  2e-78  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.669616  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1571  DNA primase small subunit  41.98 
 
 
414 aa  278  1e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2564  DNA primase, small subunit  37.78 
 
 
391 aa  233  3e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2482  DNA primase, small subunit  37.53 
 
 
392 aa  233  4e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0410  DNA primase, small subunit  38.1 
 
 
391 aa  233  4e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193863  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2753  DNA primase small subunit  37.75 
 
 
386 aa  233  6e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1798  DNA primase small subunit  37.56 
 
 
387 aa  219  7e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1245  DNA primase, small subunit  34.05 
 
 
404 aa  210  4e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0622  putative DNA primase, small subunit  31.19 
 
 
389 aa  175  1e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0066  DNA primase small subunit  26.65 
 
 
373 aa  139  7e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0991  DNA primase small subunit  40.11 
 
 
312 aa  129  7e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1787  putative DNA primase, small subunit  38.86 
 
 
312 aa  125  9e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.057405 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0437  putative DNA primase, small subunit  39.43 
 
 
312 aa  125  1e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1378  putative DNA primase, small subunit  28.03 
 
 
348 aa  120  3e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.214397  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1683  DNA primase, small subunit  40 
 
 
312 aa  119  8e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.773478 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2019  DNA primase small subunit  34.25 
 
 
330 aa  106  7e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.358314  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1793  DNA primase small subunit  34.65 
 
 
320 aa  90.1  6e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0882  putative DNA primase, small subunit  23.48 
 
 
364 aa  83.2  7e-15  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.506684  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1084  putative DNA primase, small subunit  22.28 
 
 
355 aa  78.6  2e-13  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.346262  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0877  DNA primase, small subunit  20.92 
 
 
357 aa  70.1  6e-11  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1070  putative DNA primase, small subunit  21.19 
 
 
363 aa  66.6  8e-10  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1606  DNA primase small subunit  20.2 
 
 
357 aa  64.7  3e-09  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>